Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  95  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27825582--27825688
27
4.0
27
91
0
151
28
9
22
39
1.85
27825582--27825688
54
2.0
54
90
3
171
28
9
22
39
1.85
27825675--27826096
27
15.6
27
85
3
501
40
9
22
28
1.85
27825595--27825708
54
2.1
54
80
6
124
30
8
22
37
1.85
27825675--27826096
81
5.2
81
85
3
555
40
9
22
28
1.85
27832431--27832534
37
2.8
37
85
0
136
25
30
19
24
1.98
27832691--27832973
47
6.0
47
88
0
404
25
29
13
32
1.93
27836293--27836324
12
2.7
12
95
0
55
28
9
21
40
1.84
27838247--27838314
20
3.5
20
81
2
84
52
1
23
22
1.55
27839426--27839673
124
2.0
124
86
1
345
41
16
14
27
1.87
27842277--27842449
47
3.7
47
72
13
176
23
19
28
28
1.98
27842281--27842488
93
2.2
93
93
0
362
23
19
27
29
1.98
27842334--27842503
46
3.7
46
72
13
150
22
18
27
31
1.97
27845438--27845517
30
2.7
30
82
3
90
12
13
12
61
1.58
27848270--27848411
40
3.5
40
85
4
187
23
25
24
26
2.00
27851495--27851670
46
3.8
45
74
12
169
20
18
28
32
1.96
27851491--27851662
93
1.8
93
89
0
272
20
19
29
30
1.97
27854149--27854203
25
2.2
25
87
6
76
30
30
9
29
1.88
27854316--27854348
17
1.9
17
93
0
57
24
33
27
15
1.95
27854384--27854702
40
8.0
40
90
0
494
27
30
21
20
1.98
27859976--27860000
12
2.1
12
100
0
50
80
0
20
0
0.72
27861294--27861444
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27861330--27861460
40
3.3
40
79
2
156
25
23
27
23
2.00
27864856--27864933
25
3.2
25
66
23
76
32
30
3
33
1.76
27864805--27865121
47
6.7
47
86
7
433
29
31
7
32
1.84
27864805--27865121
96
3.3
94
87
6
442
29
31
7
32
1.84
27869164--27869314
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
27869200--27869330
40
3.3
40
79
2
156
25
23
27
23
2.00
27871203--27871295
27
3.4
27
84
0
114
35
18
20
25
1.95
27875462--27875513
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
27875558--27875617
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
27882110--27882141
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
27885925--27886074
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
27885949--27886131
67
2.8
64
76
9
185
30
16
30
22
1.96
27887214--27887238
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
27887911--27888016
53
2.0
54
86
1
151
36
17
18
26
1.94
27887911--27888016
27
4.0
27
81
2
124
36
17
18
26
1.94
27888757--27888816
27
2.3
27
85
2
77
21
23
20
35
1.96
27890284--27890312
8
3.6
8
100
0
58
13
41
10
34
1.79
27891983--27892082
23
4.3
23
79
3
112
28
23
13
36
1.92
27891983--27892085
46
2.2
45
83
6
127
27
22
13
36
1.92
27897479--27897526
23
2.1
23
84
7
62
29
2
0
68
1.01
27897826--27897946
46
2.6
45
79
15
142
36
5
0
57
1.29
27897887--27897944
21
2.7
21
89
7
82
39
5
0
55
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27897826--27897940
21
5.2
20
75
15
72
35
6
0
57
1.30
27902404--27902578
40
4.3
40
86
2
181
22
25
25
26
2.00
27902428--27902578
40
3.8
40
88
0
194
22
27
23
26
2.00
27903287--27903312
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
27905478--27905696
40
5.5
40
94
2
363
22
23
28
25
1.99
27914174--27914348
40
4.3
40
86
2
181
22
25
25
26
2.00
27914198--27914348
40
3.8
40
88
0
194
22
27
23
26
2.00
27925425--27925794
69
5.5
70
72
13
222
25
13
23
37
1.91
27925425--27925794
71
5.5
70
72
13
238
25
13
23
37
1.91
27925600--27925794
72
2.8
71
88
3
286
22
12
24
40
1.88
27925425--27925942
194
2.7
194
92
2
846
25
13
23
37
1.91
27925671--27925920
122
2.0
126
86
4
348
23
13
22
40
1.89
27925794--27925957
72
2.3
71
83
9
215
23
15
21
40
1.91
27925793--27926314
159
3.3
155
78
11
513
27
15
20
36
1.93
27926131--27926273
73
2.0
73
94
2
252
30
16
21
30
1.96
27927597--27927711
24
4.8
24
78
5
94
28
22
13
34
1.93
27933956--27934080
11
10.5
12
67
25
54
38
4
0
56
1.26
27933946--27934066
46
2.6
45
76
15
133
36
6
0
56
1.31
27934007--27934064
21
2.7
21
86
7
73
39
6
0
53
1.28
27934026--27934084
2
31.0
2
79
16
63
44
3
0
52
1.17
27936426--27936474
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
27937296--27937462
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27944438--27944486
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
27945309--27945475
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
27949163--27949267
23
4.6
23
76
13
108
24
20
20
34
1.96
27949163--27949266
46
2.3
45
81
9
122
25
21
20
33
1.97
27949219--27949289
24
2.9
24
85
4
88
29
23
14
32
1.94
27951550--27951637
44
2.0
44
100
0
176
27
6
9
56
1.55
27960896--27961000
29
3.6
29
77
2
86
25
33
17
23
1.96
27960934--27961056
58
2.1
59
87
3
178
25
30
15
28
1.96
27960955--27961056
29
3.5
29
95
0
186
26
29
14
29
1.95
27968870--27968974
29
3.6
29
77
2
86
25
33
17
23
1.96
27968908--27969030
58
2.1
59
87
3
178
25
30
15
28
1.96
27968929--27969030
29
3.5
29
95
0
186
26
29
14
29
1.95
27973017--27973154
40
3.5
40
84
4
156
21
27
23
26
1.99
27980963--27981144
40
4.6
40
84
4
217
21
27
22
28
1.99
27982319--27982348
6
4.8
6
92
8
51
0
16
0
83
0.65
27982319--27982348
13
2.4
13
94
5
53
0
16
0
83
0.65
27985278--27985448
93
1.8
93
89
0
270
29
26
20
22
1.98
27985273--27985445
46
3.7
46
75
10
172
30
26
20
23
1.98
27990087--27990262
46
3.8
45
72
14
144
22
21
26
29
1.99
27990085--27990255
93
1.8
93
86
5
247
23
21
26
28
1.99
28000975--28001492
27
19.2
27
85
2
630
27
21
10
41
1.85
28001497--28001692
27
7.3
27
86
0
257
35
19
19
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28001891--28001973
27
3.1
26
87
5
112
19
21
21
37
1.94
28002061--28002119
22
2.7
22
81
0
64
20
25
22
32
1.98
28002284--28002357
27
2.8
27
85
6
89
17
24
22
35
1.95
28002500--28002667
6
27.8
6
76
16
161
21
16
12
49
1.78
28002510--28002667
30
5.4
29
82
13
191
21
16
12
49
1.79
28002506--28002667
85
1.9
85
96
0
297
21
16
12
49
1.78
28002506--28002688
30
6.3
30
78
14
168
21
17
12
49
1.79
28005111--28005226
46
2.5
46
85
0
160
22
21
26
29
1.99
28019512--28019614
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
28022239--28022286
25
1.9
25
100
0
96
29
8
8
54
1.60
28024771--28025125
46
7.8
46
76
12
338
22
20
28
28
1.98
28024817--28025025
47
4.6
47
73
13
188
22
19
29
27
1.98
28024766--28025117
93
3.8
92
83
5
437
22
20
28
28
1.98
28029569--28029692
40
3.1
40
80
2
124
21
28
24
25
1.99
28031624--28031771
67
2.2
69
78
10
162
32
16
28
22
1.96
28036371--28036411
21
2.0
20
86
13
57
19
4
9
65
1.40
28036899--28036930
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
28044454--28044488
18
1.9
18
88
0
52
11
14
48
25
1.77
28055241--28055290
15
3.4
15
86
2
66
10
18
12
60
1.59
28063423--28063550
40
3.2
40
78
1
141
26
21
25
25
2.00
28075786--28075986
39
5.1
40
90
4
286
25
28
22
22
1.99
28075786--28075986
79
2.6
79
90
4
309
25
28
22
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28084117--28084261
40
3.6
40
93
3
240
26
28
22
22
1.99
28097289--28097456
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
28105319--28105486
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
28115616--28115728
55
2.1
55
84
0
145
15
30
29
24
1.96
28120311--28120447
68
2.0
68
91
0
220
37
14
8
39
1.76
28121687--28121860
27
6.4
27
83
0
222
42
18
14
24
1.87
28123246--28123297
24
2.2
24
82
0
59
26
44
0
28
1.55
28127496--28127652
39
4.0
39
88
0
233
24
31
20
24
1.98
28134907--28135089
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99
28142332--28142514
39
4.6
39
87
0
240
22
30
22
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770