genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.641.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  641  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
201407610--201407669	20	3.0	20	90	0	102	33	20	11	35	1.88
201407712--201407759	25	1.9	25	86	0	69	25	16	25	33	1.96
201408997--201409525	27	19.6	27	86	3	643	41	9	21	27	1.84
201408997--201409556	135	4.1	135	89	1	757	40	9	22	28	1.84
201417076--201417282	40	5.2	39	81	4	218	25	25	22	26	2.00
201417076--201417281	79	2.6	80	82	4	238	25	25	22	25	2.00
201420534--201420577	21	2.1	21	100	0	88	40	13	4	40	1.65
201421440--201421493	25	2.1	26	83	10	67	51	11	5	31	1.60
201424976--201425023	25	1.9	25	86	0	69	33	25	16	25	1.96
201425067--201425125	20	3.0	20	97	0	109	37	10	20	32	1.86
201425071--201425125	11	5.4	11	70	16	55	38	10	20	30	1.87
201425176--201425294	47	2.5	48	89	8	172	27	21	24	26	1.99
201425176--201425294	24	5.0	24	84	9	154	27	21	24	26	1.99
201425485--201425586	31	3.1	31	78	17	123	39	15	21	23	1.92
201425502--201425609	38	2.8	38	94	1	189	39	14	22	23	1.91
201433327--201433387	20	3.0	20	85	4	95	37	11	19	31	1.87
201433332--201433387	11	5.4	11	70	12	55	39	12	19	28	1.88
201433434--201433527	23	4.0	23	88	9	138	25	21	25	27	1.99
201433436--201433552	47	2.5	48	87	9	161	27	21	24	26	1.99
201433434--201433552	24	5.0	24	84	10	147	26	21	25	26	1.99
201433742--201433843	31	3.1	31	78	17	123	39	15	21	23	1.92
201433759--201433866	38	2.8	38	94	1	189	39	14	22	23	1.91
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
201445739--201445942	43	4.6	44	67	14	134	26	21	26	25	2.00
201445730--201446332	133	4.6	133	87	4	906	28	21	23	26	1.99
201445938--201446318	122	3.0	122	84	9	514	29	21	22	26	1.99
201445730--201446318	255	2.3	255	90	4	896	28	21	23	26	1.99
201447511--201447618	33	3.4	31	72	17	87	25	7	0	67	1.16
201447702--201447728	2	13.5	2	100	0	54	48	0	0	51	1.00
201447882--201447911	14	2.1	14	93	0	51	26	3	0	70	1.03
201458031--201458234	43	4.6	44	67	14	134	26	21	26	25	2.00
201458022--201458624	133	4.6	133	87	4	906	28	21	23	26	1.99
201458230--201458610	122	3.0	122	84	9	514	29	21	22	26	1.99
201458022--201458610	255	2.3	255	90	4	896	28	21	23	26	1.99
201459984--201460014	2	15.5	2	100	0	62	48	0	0	51	1.00
201460167--201460196	14	2.1	14	93	0	51	26	3	0	70	1.03
201469894--201469964	28	2.5	28	90	4	108	26	14	28	30	1.95
201474822--201474956	24	5.6	24	95	0	243	22	17	23	37	1.94
201474822--201474978	48	3.3	48	94	1	262	24	17	22	35	1.95
201474822--201474978	72	2.2	72	89	2	235	24	17	22	35	1.95
201479328--201479421	47	2.0	47	100	0	188	46	6	14	31	1.70
201479339--201479413	23	3.2	23	64	17	64	45	5	16	33	1.69
201480152--201480576	48	8.9	48	97	0	760	34	6	28	30	1.83
201480717--201480819	37	2.8	37	96	0	188	23	20	32	24	1.98
201484694--201484770	28	2.8	27	82	3	100	20	20	20	37	1.94
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
201484694--201484809	27	4.3	26	79	7	106	20	19	19	39	1.93
201490490--201490673	40	4.6	39	75	6	138	26	23	27	22	2.00
201490530--201490718	80	2.4	81	77	4	186	23	24	29	22	1.99
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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