Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  292  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89077456--89077699
85
2.8
84
84
6
294
25
20
21
31
1.98
89077456--89077688
128
1.8
128
86
3
344
25
20
21
32
1.97
89084057--89084093
16
2.3
16
95
0
65
64
0
2
32
1.07
89084476--89084515
19
2.1
19
95
0
71
45
5
7
42
1.54
89084803--89084844
22
1.9
22
90
9
68
57
0
4
38
1.20
89091460--89091506
23
2.0
23
95
0
85
29
10
27
31
1.90
89098632--89098711
34
2.4
34
77
8
83
27
18
22
31
1.97
89099494--89099567
18
4.1
18
71
1
67
32
24
13
29
1.93
89105418--89105489
22
3.1
22
64
24
58
23
29
13
33
1.93
89105400--89105565
47
3.5
47
93
3
264
26
26
10
36
1.89
89109407--89109504
29
3.5
28
73
10
83
31
30
15
22
1.95
89109379--89109507
56
2.3
57
85
5
172
31
29
15
23
1.95
89110906--89111018
30
4.0
29
84
6
99
29
23
14
32
1.94
89110918--89111047
30
4.5
30
84
10
162
28
26
13
31
1.94
89110917--89111047
57
2.3
58
84
5
167
28
26
13
31
1.94
89118816--89118916
30
3.5
29
89
7
145
27
25
13
32
1.94
89118816--89118944
29
4.5
30
83
11
153
28
26
13
31
1.93
89122961--89123090
40
3.2
40
84
4
174
24
29
23
22
1.99
89131068--89131130
32
2.0
32
87
0
90
31
19
23
25
1.98
89131116--89131217
27
3.8
27
74
5
82
42
18
19
19
1.90
89131632--89131818
27
7.0
26
81
6
178
32
10
19
38
1.85
89131637--89131818
80
2.3
80
84
6
235
31
9
18
39
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89135557--89135772
27
8.1
26
78
13
172
30
7
19
41
1.80
89135557--89135766
54
3.9
54
81
8
225
30
7
19
42
1.79
89135608--89135761
81
1.9
81
86
5
222
29
8
21
40
1.82
89135980--89136014
17
2.0
18
88
5
54
14
42
25
17
1.86
89154546--89154627
42
2.0
42
100
0
164
52
19
18
9
1.72
89160707--89160821
29
4.0
29
83
6
137
27
28
15
27
1.96
89160698--89160808
58
1.9
57
87
1
159
27
29
16
27
1.97
89162164--89162201
16
2.3
16
90
4
58
15
5
28
50
1.66
89164267--89164315
24
2.0
24
100
0
98
42
16
12
28
1.84
89170207--89170318
27
4.2
26
82
7
116
16
25
21
36
1.94
89170207--89170318
54
2.1
54
84
3
145
16
25
21
36
1.94
89174920--89175113
39
5.0
39
89
0
289
21
23
29
25
1.99
89181787--89181898
27
4.2
26
85
7
143
16
24
23
36
1.94
89181787--89181898
54
2.1
54
89
3
172
16
24
23
36
1.94
89183124--89183171
21
2.3
21
82
7
53
12
18
2
66
1.33
89183457--89183513
26
2.2
26
90
0
87
35
7
24
33
1.82
89184984--89185035
25
2.0
26
85
3
70
38
23
13
25
1.91
89190926--89191038
40
2.8
40
82
2
138
23
28
23
23
2.00
89194757--89194840
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
89196324--89196376
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
89200404--89200529
40
3.2
39
80
6
139
21
25
24
28
1.99
89202882--89203063
39
4.6
39
86
2
231
24
21
30
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89211681--89211806
40
3.2
39
80
6
139
21
25
24
28
1.99
89211620--89211806
80
2.3
80
78
12
204
22
27
24
25
2.00
89214164--89214207
22
2.0
21
83
16
54
54
2
0
43
1.12
89220172--89220272
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
89228122--89228222
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
89230487--89230670
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
89238571--89238671
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
89238571--89238752
40
4.6
40
82
4
181
28
22
26
23
1.99
89247839--89248022
40
4.6
39
77
6
147
28
23
26
22
1.99
89249583--89249633
8
6.4
8
80
8
59
5
19
21
52
1.66
89249587--89249633
24
2.0
24
91
0
76
6
19
23
51
1.70
89250197--89250226
11
2.7
11
100
0
60
50
0
43
6
1.28
89250852--89250885
16
2.1
16
94
0
59
17
8
29
44
1.79
89259939--89259973
18
2.0
18
88
5
54
28
14
20
37
1.91
89261057--89261174
28
4.2
28
82
8
132
33
26
11
28
1.90
89261057--89261174
57
2.1
56
82
4
139
33
26
11
28
1.90
89261057--89261174
29
4.2
29
80
6
127
33
26
11
28
1.90
89261386--89261416
16
1.9
16
93
0
53
12
25
16
45
1.83
89274589--89274706
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
89274557--89274720
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
89282168--89282285
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
89282136--89282299
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89283453--89283660
40
5.2
40
84
0
218
25
22
26
25
2.00
89283455--89283660
80
2.6
80
84
1
243
25
22
26
25
2.00
89288763--89288970
40
5.2
40
84
0
218
25
22
26
25
2.00
89288765--89288970
80
2.6
80
84
1
243
25
22
26
25
2.00
89293480--89293621
40
3.5
40
83
0
158
22
28
23
26
1.99
89295395--89295547
76
2.0
76
96
0
279
34
18
9
37
1.82
89302752--89302802
21
2.4
21
76
0
57
35
1
13
49
1.54
89305145--89305208
33
1.9
33
96
0
119
29
7
15
46
1.74
89310912--89310951
20
2.0
20
100
0
80
40
5
15
40
1.68
89322170--89322198
14
2.1
14
100
0
58
37
13
0
48
1.43
89327068--89327254
67
2.8
67
87
0
257
35
16
22
25
1.94
89349405--89349474
27
2.5
28
97
2
133
28
12
27
31
1.93
89359301--89359486
40
4.7
40
88
5
227
26
26
21
25
1.99
89367354--89367538
40
4.7
40
87
4
209
26
26
21
25
1.99
89370498--89370583
40
2.2
39
89
2
127
25
17
27
29
1.97
89372810--89372855
23
2.0
24
86
4
67
52
28
2
17
1.56
89380284--89380329
23
2.0
24
86
4
67
52
28
2
17
1.56
89380477--89380615
44
3.2
43
76
9
122
30
24
16
28
1.96
89383948--89384012
26
2.5
26
80
9
78
32
15
9
43
1.78
89384156--89384201
6
7.8
6
92
4
67
17
21
0
60
1.35
89385696--89385754
30
1.9
31
86
3
84
33
8
23
33
1.85
89386517--89386638
47
2.6
47
88
0
190
36
13
22
27
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89386617--89386877
54
4.8
54
86
3
328
36
17
23
22
1.95
89386976--89387003
7
4.0
7
100
0
56
42
0
14
42
1.45
89392676--89392883
40
5.2
39
83
3
211
25
25
23
25
2.00
89392676--89392881
80
2.6
81
83
4
240
25
26
23
25
2.00
89399870--89400077
40
5.2
39
82
3
202
25
25
22
25
2.00
89399873--89400075
80
2.5
81
82
4
225
26
25
22
25
2.00
89404991--89405073
41
2.0
41
100
0
166
43
19
16
20
1.88
89411292--89411324
13
2.5
13
95
0
57
30
0
12
57
1.35
89411738--89411858
50
2.4
50
88
2
179
38
13
14
33
1.84
89414444--89414490
19
2.4
19
82
10
51
25
6
4
63
1.36
89419678--89419841
71
2.3
71
97
0
310
18
28
18
34
1.95
89419678--89419875
71
2.8
70
90
3
267
20
28
18
32
1.96
89427256--89427419
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
89427256--89427453
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
89429428--89429486
23
2.5
24
81
13
68
57
1
23
16
1.48
89429999--89430151
76
2.0
76
100
0
306
23
20
14
41
1.89
89430924--89431092
93
1.8
92
90
1
275
21
20
28
28
1.98
89432449--89432496
23
2.1
23
84
0
60
58
2
25
14
1.48
89432461--89432540
36
2.2
37
78
10
85
65
0
23
11
1.25
89438086--89438157
36
2.0
36
97
0
135
31
25
12
30
1.92
89447632--89447802
93
1.8
93
91
2
281
29
28
19
22
1.98
89447627--89447798
46
3.7
45
78
10
186
29
27
19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
89447675--89447818
46
3.1
45
74
21
129
29
28
19
22
1.98
89464999--89465182
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
89465039--89465227
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
89473112--89473295
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
89473152--89473340
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
89479688--89479715
13
2.2
13
100
0
56
28
7
14
50
1.69
89489620--89489663
21
2.1
21
83
8
54
25
9
2
63
1.35
89491896--89491939
22
2.0
22
100
0
88
18
22
4
54
1.61
89496058--89496119
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
89504297--89504375
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770