Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  174  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
51999165--51999273
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
52000433--52000803
203
1.8
203
97
0
706
28
16
26
27
1.97
52007223--52007307
24
3.5
24
88
3
118
25
17
23
32
1.97
52027953--52028013
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
52035335--52035516
39
4.6
39
86
1
238
23
30
21
24
1.99
52040078--52040242
40
4.1
40
78
4
145
24
26
23
25
2.00
52042600--52043129
47
11.3
47
95
0
907
28
29
9
32
1.89
52045237--52045273
19
1.9
19
88
0
56
0
16
2
81
0.81
52051864--52052030
40
4.2
40
79
5
151
24
26
23
25
2.00
52053261--52053298
20
1.9
20
88
0
58
0
15
2
81
0.80
52053269--52053304
16
2.1
18
90
10
58
0
13
5
80
0.88
52058330--52058441
38
2.9
39
86
4
156
25
31
21
22
1.98
52062953--52062992
11
3.7
11
87
12
57
12
2
5
80
0.98
52063208--52063247
14
2.9
14
88
0
53
50
10
32
7
1.64
52065744--52065791
15
3.3
15
73
5
53
31
0
25
43
1.55
52065738--52065797
29
2.1
29
90
0
93
30
0
28
41
1.56
52068182--52068210
13
2.2
13
100
0
58
27
0
10
62
1.28
52069723--52069767
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
52070744--52070803
29
2.1
29
87
0
84
41
26
0
31
1.56
52071952--52072001
18
2.8
18
87
0
73
58
0
28
14
1.37
52071945--52072021
24
3.2
24
77
0
91
59
0
27
12
1.34
52074461--52074505
14
3.3
14
78
6
56
35
0
15
48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
52075485--52075544
29
2.1
29
87
6
86
43
26
0
30
1.55
52078156--52078203
17
2.8
17
77
3
51
2
16
6
75
1.11
52080300--52080392
19
5.1
19
73
12
86
48
13
7
30
1.71
52080290--52080418
54
2.4
54
92
0
204
44
14
6
33
1.72
52081830--52081864
17
2.1
17
88
0
52
51
2
0
45
1.16
52083031--52083180
53
2.8
53
81
1
174
22
24
16
37
1.94
52086340--52086432
19
5.1
19
73
12
77
31
8
13
46
1.74
52086314--52086442
54
2.4
54
93
0
213
33
8
15
42
1.77
52086500--52086537
9
4.1
9
86
6
58
31
0
13
55
1.38
52088541--52088638
36
2.7
36
79
7
101
69
1
21
8
1.20
52088769--52088813
15
3.1
14
81
9
54
64
4
22
8
1.40
52092487--52092560
17
4.3
17
69
24
57
67
2
22
6
1.27
52092476--52092526
16
3.1
16
80
5
57
64
1
25
7
1.31
52092476--52092551
33
2.2
34
82
13
86
64
2
26
6
1.31
52092521--52092553
14
2.3
15
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5
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Size
Copy
Number
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Copy
Number
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Period
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