genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.705.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  705  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
222465676--222465748	18	4.0	18	74	13	69	78	0	9	12	0.98
222465671--222465743	6	12.5	6	79	5	60	76	0	9	13	1.01
222468897--222469063	40	4.2	40	78	6	160	25	22	27	24	2.00
222484281--222484350	27	2.5	28	88	2	106	31	25	14	28	1.95
222487363--222487568	40	5.2	40	82	3	218	24	25	23	26	2.00
222487363--222487570	80	2.6	80	83	3	240	24	25	23	26	2.00
222490274--222490326	27	2.0	27	85	3	72	39	20	11	28	1.87
222494693--222494846	40	3.8	40	80	1	157	25	26	21	26	1.99
222502768--222502932	39	4.2	39	75	10	149	26	21	27	24	2.00
222505293--222505346	28	1.9	28	84	0	72	27	24	9	38	1.86
222517048--222517078	15	2.1	15	100	0	62	19	32	6	41	1.77
222522000--222522124	49	2.7	45	83	10	146	24	16	31	27	1.97
222524573--222524681	40	2.7	38	82	12	112	23	25	29	21	1.99
222524611--222524703	41	2.3	40	83	1	105	25	23	27	22	2.00
222533390--222533540	40	3.8	40	79	6	155	26	23	27	23	2.00
222536570--222536613	20	2.2	20	100	0	88	36	11	18	34	1.86
222536667--222536832	23	7.1	23	90	2	242	28	21	21	27	1.99
222537047--222537110	31	2.1	31	93	0	110	37	15	23	23	1.93
222542941--222543055	27	4.1	29	77	11	100	36	20	23	19	1.95
222542941--222543055	55	2.1	56	84	11	148	36	20	23	19	1.95
222542966--222543055	27	3.2	28	78	13	105	34	22	23	20	1.97
222543161--222543253	28	3.3	28	92	3	152	31	7	27	33	1.85
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
222548634--222548666	9	3.3	10	84	16	50	51	9	9	30	1.64
222549721--222549835	55	2.1	56	83	8	146	34	21	24	19	1.96
222549746--222549835	27	3.2	27	85	7	119	32	23	24	20	1.98
222549941--222550028	28	3.2	28	96	1	160	30	7	27	34	1.85
222550274--222550305	8	4.0	8	91	0	55	3	25	25	46	1.67
222556160--222556277	41	3.1	41	60	28	98	32	17	28	21	1.96
222556128--222556291	71	2.3	71	100	0	328	35	17	28	18	1.94
222560434--222560563	40	3.3	39	76	8	136	23	27	23	24	2.00
222560450--222560601	40	3.8	40	78	6	148	22	26	23	27	1.99
222560450--222560599	80	1.9	80	83	8	198	22	26	24	27	1.99
222566915--222567032	41	3.1	41	60	28	98	32	17	28	21	1.96
222566883--222567046	71	2.3	71	100	0	328	35	17	28	18	1.94
222569674--222569803	40	3.3	39	83	4	163	23	28	25	23	1.99
222580046--222580218	45	3.8	46	79	15	216	20	20	29	28	1.98
222583161--222583229	15	4.6	15	83	0	84	11	17	13	57	1.64
222583152--222583239	30	3.0	30	81	8	99	10	17	15	56	1.66
222585624--222585799	46	3.8	46	80	12	225	21	21	28	28	1.98
222585620--222585791	93	1.8	93	96	0	317	20	21	29	27	1.98
222588230--222588339	40	2.8	40	85	0	148	26	23	26	23	2.00
222588230--222588379	40	3.8	39	80	7	133	26	22	26	24	2.00
222594857--222595007	39	3.9	39	92	2	241	22	31	22	23	1.99
222594857--222595007	77	1.9	79	90	2	243	22	31	22	23	1.99
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
222603070--222607723	535	8.7	540	96	2	8609	36	18	11	33	1.86
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222609961--222610233	134	2.0	137	96	2	507	25	18	24	31	1.97
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222802030--222802160	58	2.2	58	86	4	174	32	13	25	28	1.94
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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