Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  543  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168851040--168851069
11
2.7
11
94
0
51
76
0
0
23
0.78
168851639--168851893
29
8.8
29
79
3
192
22
26
14
36
1.93
168851694--168851891
87
2.3
86
83
8
233
21
27
14
35
1.93
168851663--168851853
58
3.3
57
84
3
238
21
28
14
35
1.92
168852717--168852757
21
2.0
21
85
9
57
21
9
0
68
1.18
168856927--168857006
40
2.0
40
85
4
108
27
21
20
31
1.98
168859699--168859801
39
2.6
39
78
4
100
29
24
15
31
1.96
168859803--168859899
38
2.6
38
88
4
135
38
12
15
34
1.85
168865444--168865553
40
2.8
39
82
10
134
23
24
29
22
1.99
168865444--168865553
39
2.8
37
82
11
130
23
24
29
22
1.99
168875678--168875831
41
3.8
41
80
8
174
20
23
30
25
1.98
168884102--168884242
40
3.5
39
80
6
149
24
21
27
26
1.99
168896644--168896851
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
168896645--168896851
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
168901248--168901661
27
15.4
27
80
6
286
33
22
7
36
1.83
168901248--168901661
54
7.7
54
76
4
318
33
22
7
36
1.83
168901248--168901661
81
5.1
81
73
5
318
33
22
7
36
1.83
168901423--168901501
26
3.0
26
81
1
68
37
21
10
30
1.86
168901674--168901753
27
3.0
26
80
5
81
37
20
17
25
1.94
168902157--168902252
25
3.6
25
81
14
102
17
19
16
45
1.85
168902154--168902224
31
2.3
31
97
0
133
19
16
15
47
1.82
168902154--168902266
6
18.3
6
71
18
81
18
18
15
46
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
168905157--168905225
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
168907236--168907386
40
3.8
40
77
13
141
25
24
27
22
2.00
168907273--168907402
40
3.2
40
80
2
154
23
23
27
24
2.00
168915211--168915361
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
22
2.00
168915248--168915377
40
3.2
40
81
2
163
23
23
28
24
2.00
168926646--168926699
24
2.2
24
83
0
63
12
38
31
16
1.87
168926733--168926853
58
2.1
59
88
1
181
31
24
20
23
1.98
168927249--168927302
24
2.2
24
83
0
72
7
38
33
20
1.80
168927489--168928502
42
24.0
42
83
5
983
16
32
33
18
1.93
168927489--168928518
127
8.1
128
82
4
1022
15
32
33
18
1.93
168927537--168928502
85
11.4
86
82
5
1008
15
32
33
17
1.92
168928266--168928561
43
7.0
43
79
7
275
14
27
36
20
1.92
168935834--168935944
58
1.9
58
90
0
177
33
20
21
24
1.97
168941651--168942728
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169
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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169021277--169021539
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1.9
140
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26
19
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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Period
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Copy
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Percent
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30
24
22
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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