Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  365  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111931436--111931633
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
111938999--111939162
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
111938999--111939196
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
111944369--111944417
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
111945238--111945404
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
111951384--111951565
40
4.6
40
79
8
176
24
24
28
23
2.00
111951384--111951565
78
2.3
80
82
6
210
24
24
28
23
2.00
111954415--111954483
21
3.4
21
71
15
72
36
1
7
55
1.37
111959775--111959816
21
2.0
21
95
0
75
71
11
14
2
1.24
111962106--111962193
43
2.0
44
91
2
142
46
7
17
28
1.75
111963086--111963470
197
2.0
197
92
2
648
29
17
15
37
1.91
111965616--111965640
5
5.0
5
100
0
50
0
20
0
80
0.72
111973141--111973313
46
3.8
44
72
11
116
28
20
27
23
1.99
111976867--111977030
40
4.1
40
79
6
179
25
21
28
25
1.99
111983925--111984073
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
111983966--111984117
40
3.8
40
80
3
162
21
26
24
27
1.99
111983966--111984115
80
1.9
80
83
2
194
21
26
24
27
1.99
112004757--112004900
57
2.5
58
85
6
195
29
20
19
31
1.97
112007901--112007926
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
112015232--112015304
28
2.6
28
84
4
94
30
13
23
32
1.93
112022890--112022988
28
3.5
29
82
6
114
28
15
26
30
1.96
112024566--112024648
42
2.0
41
81
13
98
20
22
37
19
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112024841--112024878
10
3.7
10
83
16
51
31
10
10
47
1.72
112027767--112027840
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
112027708--112027840
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
112035627--112035700
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
112035568--112035700
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
112041152--112041337
42
4.4
42
87
0
264
32
24
19
23
1.98
112049481--112049749
48
5.6
46
76
9
193
23
29
18
28
1.98
112049478--112049747
96
2.8
96
81
4
278
23
29
19
28
1.98
112071745--112071915
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
112079850--112080020
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
112088631--112088821
55
3.5
55
88
0
265
15
27
30
27
1.96
112096916--112096951
18
2.0
18
100
0
72
16
27
22
33
1.95
112097846--112098128
48
5.9
47
80
5
266
24
28
18
27
1.98
112097844--112098118
96
2.9
95
81
7
299
24
29
18
28
1.98
112103647--112103720
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
112103588--112103720
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
112108465--112108659
40
5.2
39
73
18
155
23
28
22
26
1.99
112108487--112108620
68
1.9
70
83
7
175
21
29
23
25
1.99
112110036--112110074
18
2.0
20
85
9
55
25
17
12
43
1.85
112116418--112116621
40
5.2
39
82
7
218
24
27
22
25
2.00
112116434--112116620
77
2.4
77
84
7
227
23
27
22
25
2.00
112118447--112118536
27
3.2
28
81
7
112
18
24
24
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112118457--112118547
27
3.2
28
81
4
94
20
26
20
31
1.98
112118447--112118561
55
2.1
56
82
8
137
18
24
22
34
1.96
112121739--112121792
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
112128681--112128748
6
12.8
5
73
17
50
76
1
4
17
1.03
112128701--112128752
6
9.0
6
85
4
63
78
1
3
15
0.98
112128691--112128752
18
3.6
17
81
14
74
75
1
4
17
1.05
112128681--112128752
11
6.2
11
78
12
65
76
1
4
18
1.02
112130257--112130307
21
2.4
21
80
9
59
11
17
47
23
1.81
112135484--112135674
49
3.9
49
95
1
350
32
8
28
30
1.87
112135486--112135674
96
1.9
97
96
2
353
32
8
28
30
1.87
112135666--112135865
48
4.2
47
89
5
285
35
6
27
31
1.82
112135666--112135865
96
2.1
96
93
0
337
35
6
27
31
1.82
112135905--112135995
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
112137823--112138173
40
8.8
40
92
1
580
26
20
27
26
1.99
112137823--112138173
159
2.2
159
92
2
571
26
20
27
26
1.99
112141935--112142127
51
3.9
49
93
4
336
32
8
28
30
1.86
112141937--112142127
49
3.9
49
95
2
341
32
8
28
30
1.86
112142119--112142318
48
4.2
47
88
5
276
35
7
26
31
1.83
112142119--112142318
96
2.1
96
92
0
328
35
7
26
31
1.83
112142358--112142448
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
112144805--112144847
17
2.6
16
82
10
50
44
4
2
48
1.36
112149473--112149554
36
2.3
36
100
0
164
40
21
9
28
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112158850--112158878
15
1.9
15
100
0
58
27
27
27
17
1.97
112160544--112160711
40
4.2
40
80
12
175
23
22
27
26
1.99
112160544--112160711
80
2.1
79
86
4
230
23
22
27
26
1.99
112168179--112168346
40
4.2
40
80
12
175
23
22
27
26
1.99
112168179--112168346
80
2.1
79
86
4
230
23
22
27
26
1.99
112174965--112175085
43
2.8
43
82
1
136
19
17
32
31
1.95
112178061--112178267
40
5.2
40
84
1
218
25
22
26
25
2.00
112178062--112178267
79
2.6
77
83
5
241
25
22
26
25
2.00
112181404--112181792
49
8.1
49
90
7
629
34
8
26
30
1.86
112181629--112181706
39
2.0
39
100
0
156
33
5
28
33
1.79
112181480--112181755
88
3.0
88
90
6
426
34
7
26
31
1.85
112181404--112181814
187
2.1
187
91
5
606
34
8
27
30
1.86
112181863--112181948
36
2.3
36
92
7
138
20
18
33
26
1.96
112182769--112182803
18
2.1
16
89
10
52
57
0
14
28
1.38
112183827--112184138
40
7.8
40
95
0
500
27
20
25
26
1.99
112184883--112184983
39
2.6
39
76
10
98
27
22
25
23
2.00
112184923--112185004
40
2.0
40
81
4
94
26
25
26
20
1.99
112187722--112188106
48
8.2
49
90
7
629
33
8
27
30
1.86
112187944--112188106
39
3.7
40
80
16
175
34
5
27
32
1.80
112187889--112188106
87
2.4
89
89
9
325
33
7
27
31
1.84
112188174--112188260
37
2.3
36
94
5
147
20
19
33
26
1.97
112191278--112191446
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112199384--112199552
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
112208045--112208082
20
2.0
20
89
5
60
28
7
7
55
1.57
112212093--112212219
47
2.7
48
77
16
149
22
18
29
29
1.98
112215772--112215937
47
3.6
47
74
8
176
24
17
27
30
1.97
112215718--112215983
93
2.9
93
90
0
406
23
18
28
29
1.98
112215728--112215990
46
5.7
46
72
8
192
23
18
27
30
1.98
112218733--112218785
27
2.0
27
88
7
81
73
7
5
13
1.23
112224640--112224793
40
3.8
40
88
1
211
25
21
27
25
1.99
112224635--112224809
80
2.2
80
82
4
210
24
20
28
27
1.99
112232563--112232703
40
3.5
40
90
1
203
24
22
28
24
2.00
112232563--112232726
80
2.0
80
84
2
213
22
21
29
26
1.99
112237583--112237830
27
9.2
27
81
4
232
33
18
22
24
1.97
112237966--112238037
27
2.7
26
75
12
76
19
18
23
38
1.93
112238220--112238279
28
2.2
27
82
8
68
21
26
26
25
2.00
112238243--112238374
33
4.0
33
88
2
176
28
20
25
25
1.99
112241826--112241992
27
6.2
27
90
1
219
31
19
23
24
1.98
112242164--112242229
27
2.4
28
77
7
73
18
18
24
39
1.92
112242427--112242502
33
2.3
33
90
0
125
27
23
23
25
2.00
112243809--112243940
56
2.4
56
93
0
219
30
14
21
34
1.93
112243809--112243971
56
2.9
56
87
1
175
28
14
23
34
1.93
112246512--112246622
27
4.1
27
89
5
163
36
22
24
16
1.94
112248540--112248758
40
5.4
40
86
2
260
26
24
26
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112248540--112248758
120
1.8
121
85
3
307
26
24
26
23
2.00
112248591--112248784
40
4.8
40
86
5
158
26
24
26
22
2.00
112254848--112255063
40
5.4
40
82
6
233
26
23
26
23
2.00
112254847--112255033
77
2.4
81
82
4
238
25
22
26
24
2.00
112254847--112255077
77
2.9
78
77
7
223
26
23
26
23
2.00
112255006--112255089
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
112254854--112255078
117
1.9
119
80
3
267
27
23
25
23
2.00
112264301--112264430
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
112264301--112264463
40
4.1
40
78
5
145
22
28
24
25
1.99
112273895--112274054
29
5.6
29
93
0
259
26
32
15
26
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770