Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  578  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
180197442--180197492
27
1.9
26
84
4
66
35
17
27
19
1.94
180199522--180199720
27
7.4
27
83
0
227
38
18
14
28
1.90
180201143--180201167
10
2.5
10
100
0
50
32
28
0
40
1.57
180211065--180211094
14
2.1
15
93
6
53
13
10
13
63
1.52
180212074--180212200
45
2.8
45
89
2
175
18
21
17
43
1.88
180212254--180212360
45
2.4
45
82
6
119
24
21
15
38
1.92
180213651--180213806
77
2.0
77
96
0
285
32
27
7
32
1.85
180220465--180220596
29
4.6
29
86
0
156
30
15
30
24
1.95
180232129--180232257
40
3.3
39
79
7
145
23
29
24
23
1.99
180235490--180235526
16
2.2
17
90
4
58
51
29
5
13
1.63
180237007--180237099
28
3.3
28
80
3
98
26
16
30
26
1.96
180236997--180237075
28
2.8
28
83
5
97
29
13
27
29
1.95
180242504--180242727
124
1.8
124
86
1
324
30
10
24
35
1.88
180242722--180242852
40
3.2
40
81
5
149
23
24
29
22
1.99
180253385--180253418
5
6.6
5
86
6
50
82
0
17
0
0.67
180254669--180254885
40
5.5
40
83
6
239
23
23
27
25
2.00
180262716--180262932
40
5.5
40
90
3
307
22
23
29
24
1.99
180263842--180263876
15
2.4
15
95
4
63
48
11
17
22
1.79
180273600--180273673
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
180276587--180276769
40
4.7
39
86
8
239
24
21
27
26
1.99
180276587--180276769
77
2.3
80
85
8
241
24
21
27
26
1.99
180284614--180284794
40
4.5
39
78
8
177
23
22
28
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
180286330--180286512
40
4.6
40
91
2
280
24
22
26
26
2.00
180291785--180291810
13
2.0
13
100
0
52
30
0
7
61
1.24
180293170--180293390
40
5.6
40
93
1
365
23
23
26
27
2.00
180295312--180295351
16
2.5
15
84
11
53
82
10
0
7
0.84
180295312--180295355
24
1.9
22
86
9
61
81
9
0
9
0.87
180296741--180296790
18
2.8
18
73
11
57
30
4
8
58
1.45
180307016--180307182
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
180330817--180330871
17
3.5
17
68
31
59
21
27
1
49
1.60
180330814--180330869
29
1.9
29
100
0
112
23
26
3
46
1.68
180334846--180335093
40
6.2
40
84
1
282
26
23
25
25
2.00
180346380--180346509
40
3.2
40
82
4
165
23
28
24
23
2.00
180346380--180346543
40
4.1
40
78
4
145
21
28
25
25
1.99
180349391--180349480
41
2.2
40
78
7
90
31
16
25
26
1.97
180349455--180349632
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4.2
42
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4.7
40
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24
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23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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1.98
180440702--180440886
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2.3
80
79
7
198
26
28
21
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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3
242
29
34
23
12
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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