Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  217  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64879311--64879362
26
2.0
26
85
7
70
36
1
15
46
1.57
64882200--64882285
43
2.0
43
90
0
136
20
18
31
29
1.97
64890105--64890129
13
1.9
13
100
0
50
0
48
28
24
1.52
64891092--64891212
46
2.7
43
88
6
161
21
33
19
25
1.97
64891092--64891263
93
1.9
91
83
11
226
22
31
18
27
1.97
64900765--64900886
47
2.6
47
93
0
199
25
22
13
38
1.91
64906736--64906819
27
3.1
27
81
11
84
19
23
21
35
1.96
64908687--64908776
38
2.4
38
100
0
180
24
12
28
34
1.91
64909373--64909558
40
4.7
40
83
5
216
24
20
26
28
1.99
64909373--64909581
40
5.2
40
80
7
194
25
20
25
28
1.99
64911484--64911622
24
5.8
24
95
0
242
20
16
25
36
1.94
64911483--64911644
72
2.2
72
87
2
227
23
16
24
35
1.95
64919063--64919201
24
5.8
24
98
0
260
20
17
26
35
1.94
64919062--64919223
72
2.2
72
90
2
245
22
17
25
34
1.96
64929592--64929692
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
64937518--64937618
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
64945533--64945597
34
1.9
34
90
0
103
32
20
18
29
1.96
64949903--64949969
30
2.2
30
84
5
82
20
20
14
43
1.88
64950519--64950859
150
2.3
150
81
5
384
29
15
17
37
1.91
64950511--64950935
75
5.6
75
73
7
288
28
15
17
38
1.90
64950396--64950921
76
7.0
75
71
7
276
28
15
18
37
1.91
64954100--64954221
61
2.0
61
100
0
244
42
14
18
24
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64956298--64956361
19
3.1
21
86
6
60
37
18
9
34
1.83
64956315--64956376
19
3.2
19
93
4
97
35
16
9
38
1.81
64957112--64957608
84
6.0
84
89
4
776
23
22
23
30
1.99
64957129--64957599
41
11.3
43
65
17
208
24
22
23
30
1.99
64958572--64958613
8
5.5
8
86
11
61
0
16
0
83
0.65
64958566--64958637
22
3.4
22
83
9
96
0
15
0
84
0.62
64961141--64961173
2
17.0
2
87
6
50
0
45
0
54
0.99
64961145--64961179
12
2.9
12
91
0
52
0
40
0
60
0.97
64964228--64964287
17
3.2
18
86
13
77
35
15
10
40
1.80
64977575--64977620
23
2.0
23
100
0
92
8
21
26
43
1.81
64980865--64980896
16
2.0
16
100
0
64
12
6
0
81
0.87
64981809--64981999
96
2.0
97
86
1
267
28
12
26
32
1.93
64982656--64982693
20
1.9
20
88
0
58
21
5
2
71
1.19
64982785--64982838
27
2.0
27
100
0
108
18
25
3
51
1.62
64988395--64988432
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
64994694--64994762
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
64997181--64997352
93
1.8
93
91
0
281
29
29
20
20
1.98
64997173--64997348
46
3.8
46
78
10
196
30
28
20
20
1.98
65001837--65001900
31
2.1
31
90
0
101
23
25
15
35
1.94
65002092--65002234
24
6.0
24
91
4
209
26
22
22
28
1.99
65002092--65002233
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
65002091--65002234
71
2.0
72
89
4
220
26
22
22
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65002284--65002344
20
3.0
20
92
0
104
32
21
11
34
1.89
65009861--65009990
47
2.8
47
85
0
161
22
16
28
33
1.95
65014003--65014102
43
2.3
43
92
0
164
40
18
13
29
1.87
65014018--65014228
110
1.9
110
82
1
262
40
17
13
28
1.87
65014132--65014389
43
6.0
43
86
0
248
40
15
17
26
1.89
65014443--65014477
18
1.9
18
100
0
70
28
28
0
42
1.56
65016272--65016430
66
2.4
66
81
2
167
27
28
22
21
1.99
65031011--65031542
44
12.1
44
83
2
559
31
12
26
29
1.93
65033386--65033427
17
2.6
16
81
7
50
33
4
0
61
1.17
65033370--65033484
10
11.1
10
68
22
60
32
6
0
60
1.27
65033370--65033477
7
14.6
7
68
21
60
31
6
0
62
1.21
65033348--65033483
29
4.5
29
70
21
86
31
5
2
61
1.30
65038769--65038807
19
2.1
19
85
0
51
28
7
0
64
1.21
65043018--65043127
50
2.2
50
91
0
184
37
16
24
21
1.93
65043234--65043307
37
2.0
37
97
0
139
36
5
6
51
1.51
65045224--65045253
15
2.0
15
100
0
60
33
40
6
20
1.78
65050133--65050175
19
2.3
19
88
8
61
46
4
0
48
1.22
65044900--65097866
507
102.1
511
76
12
36998
34
14
15
35
1.88
65055209--65055251
19
2.3
19
88
8
61
46
4
0
48
1.22
65064374--65064416
19
2.2
20
84
15
56
44
4
0
51
1.22
65065774--65066104
41
8.1
41
86
3
418
34
22
22
20
1.96
65066693--65066744
7
7.4
7
91
0
68
19
0
48
32
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65066661--65066744
21
4.0
21
75
10
73
17
0
47
34
1.48
65066663--65066803
7
19.9
7
72
9
63
20
0
39
39
1.58
65067275--65067324
21
2.3
21
80
13
57
76
2
2
20
0.99
65067861--65067896
16
2.2
16
100
0
72
38
5
22
33
1.77
65074340--65074394
19
3.1
18
82
10
60
23
3
3
69
1.21
65074644--65074789
43
3.4
43
86
0
193
23
22
28
25
1.99
65074945--65076152
514
2.3
515
95
0
2136
35
12
15
36
1.86
65078811--65078867
26
2.2
26
96
0
105
38
26
7
28
1.82
65080251--65080293
19
2.3
19
88
8
61
46
4
0
48
1.22
65081269--65081311
19
2.2
20
84
15
56
44
9
0
46
1.35
65081780--65081821
19
2.3
19
84
12
52
45
7
0
47
1.30
65083803--65083844
19
2.3
18
88
12
59
47
4
0
47
1.23
65079202--65097866
506
36.8
510
94
2
32822
35
13
14
35
1.86
65087846--65087887
19
2.3
18
88
12
59
47
4
0
47
1.23
65089359--65089401
19
2.3
19
88
8
61
46
4
0
48
1.22
65090374--65090413
18
2.2
18
86
8
55
42
5
0
52
1.23
65091890--65091929
18
2.2
18
86
8
55
42
5
0
52
1.23
65092391--65092432
19
2.3
19
84
12
52
45
7
0
47
1.30
65096946--65096988
18
2.3
19
88
11
63
46
2
0
51
1.13
65101286--65101395
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
65106710--65106900
40
4.8
40
82
3
197
25
23
26
24
2.00
65106711--65106900
80
2.4
80
81
7
217
25
23
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65109251--65109368
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
65109219--65109382
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
65116595--65116712
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
65116563--65116726
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
65123971--65124034
32
2.0
32
100
0
128
34
3
31
31
1.73
65124003--65124189
49
3.8
49
97
0
347
31
8
30
29
1.87
65124291--65124478
37
5.3
37
88
10
293
26
19
31
21
1.97
65124336--65124431
29
3.0
30
85
14
122
27
19
30
22
1.98
65124299--65124478
66
2.6
68
90
7
274
27
19
31
22
1.98
65127444--65127651
55
3.9
54
84
4
249
22
24
17
36
1.94
65127841--65127927
44
2.0
44
86
4
122
24
26
13
35
1.93
65135122--65135329
55
3.9
54
81
5
231
22
23
17
36
1.95
65135308--65135429
47
2.6
47
96
0
217
25
24
13
36
1.91
65136187--65136246
29
2.0
30
87
3
86
35
23
6
35
1.81
65137775--65137813
14
2.6
16
88
8
55
41
2
20
35
1.66
65137999--65138164
45
3.7
45
76
7
149
21
15
28
34
1.94
65138997--65139075
15
5.3
15
92
3
124
12
13
15
58
1.64
65138997--65139084
30
2.9
30
89
3
124
12
13
15
57
1.65
65138997--65139084
45
2.0
45
86
4
124
12
13
15
57
1.65
65140962--65141030
35
2.0
35
100
0
138
36
14
17
31
1.90
65141373--65141513
40
3.5
40
93
1
221
22
29
23
24
1.99
65144094--65144202
27
4.0
27
86
3
132
34
18
23
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65144098--65144202
55
1.9
55
86
5
151
35
17
23
23
1.95
65148980--65149016
18
2.1
18
89
0
56
32
35
5
27
1.79
65154325--65154393
27
2.5
28
92
2
113
26
14
30
28
1.95
65154325--65154405
27
3.0
27
83
8
67
27
16
27
29
1.97
65156003--65156184
78
2.3
80
84
6
237
24
21
26
26
2.00
65156004--65156186
40
4.6
39
81
10
212
24
21
27
26
2.00
65158372--65158459
27
3.3
26
82
7
86
38
21
21
18
1.93
65158562--65158624
26
2.4
26
89
7
92
28
7
26
36
1.85
65160057--65160126
29
2.4
29
85
4
97
27
28
15
28
1.96
65164403--65164469
33
2.0
33
100
0
134
20
26
17
34
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770