Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  670  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
210743684--210743854
93
1.8
93
91
2
281
21
19
29
29
1.98
210749405--210749535
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
210749405--210749535
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
210755835--210755965
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
210755835--210755965
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
210762769--210762799
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
210766226--210766326
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
210774175--210774275
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
210782865--210782942
29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
210795915--210795974
27
2.2
27
82
5
68
25
18
20
36
1.94
210800962--210801112
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
210800999--210801128
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
210807752--210807955
39
5.2
40
94
4
353
26
26
23
23
2.00
210807752--210807955
79
2.6
79
96
2
367
26
26
23
23
2.00
210809331--210809356
13
2.0
13
100
0
52
61
7
0
30
1.24
210815867--210816112
118
2.1
113
91
6
395
28
26
21
23
1.99
210815867--210816112
39
6.3
39
91
7
378
28
26
21
23
1.99
210817476--210817501
13
2.0
13
100
0
52
61
7
0
30
1.24
210825022--210825099
29
2.7
29
83
0
102
21
33
17
26
1.96
210832698--210832775
29
2.7
29
83
0
102
21
33
17
26
1.96
210836579--210836727
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
210836620--210836727
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
210844668--210844816
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
210844709--210844816
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
210848247--210848417
93
1.8
93
93
0
297
29
28
20
21
1.98
210848242--210848414
46
3.7
46
77
13
201
30
27
20
21
1.98
210850018--210850126
27
4.1
27
85
2
123
47
20
11
20
1.81
210850080--210850185
27
4.0
27
87
3
117
41
19
16
22
1.90
210853420--210853535
27
4.3
27
83
2
126
38
19
18
22
1.93
210853933--210853997
34
1.9
34
87
0
94
27
21
24
26
1.99
210855531--210855632
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
210855734--210855766
16
2.0
17
88
5
50
36
24
0
39
1.56
210863450--210863518
27
2.6
27
86
9
88
27
27
14
30
1.95
210865819--210865884
1
66.0
1
78
0
69
1
6
3
89
0.63
210865815--210865885
11
6.4
11
80
16
76
1
8
2
87
0.70
210865819--210865884
28
2.4
28
85
5
82
1
6
3
89
0.63
210871352--210871426
29
2.6
29
89
4
107
25
30
17
26
1.97
210871345--210871452
29
3.8
29
77
9
78
25
32
14
26
1.95
210879217--210879296
29
2.7
29
86
5
108
27
32
15
25
1.95
210881430--210881594
40
4.2
39
79
6
165
23
27
23
26
2.00
210889416--210889582
40
4.2
40
80
2
167
24
26
22
26
2.00
210895631--210895682
25
2.0
26
85
3
70
25
13
23
38
1.91
210897163--210897246
26
3.2
26
96
0
150
35
23
5
34
1.80
210902920--210903029
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
210903943--210903981
3
12.7
3
94
5
69
64
0
0
35
0.94
210903875--210903981
16
6.9
16
71
20
70
58
1
3
35
1.26
210904073--210904109
2
18.5
2
88
0
56
48
2
2
45
1.30
210904265--210904321
2
30.0
2
79
10
57
52
7
0
40
1.28
210905130--210905165
14
2.5
15
95
4
65
16
5
13
63
1.47
210905129--210905166
15
2.5
16
87
12
62
15
5
13
65
1.43
210905127--210905201
33
2.3
33
84
8
100
12
5
18
64
1.46
210905129--210905197
15
4.5
15
69
26
56
13
5
18
62
1.50
210905606--210905674
35
2.0
35
97
0
129
20
13
50
15
1.77
210906384--210906530
54
2.9
50
80
12
183
34
19
16
29
1.94
210906587--210907175
147
4.1
140
92
4
980
31
20
15
32
1.94
210906686--210907175
70
6.9
70
94
3
863
31
20
15
32
1.94
210906587--210907175
217
2.7
217
97
2
1093
31
20
15
32
1.94
210916034--210916261
46
5.0
46
90
1
332
39
14
23
22
1.91
210921210--210921261
20
2.5
21
87
6
79
53
7
0
38
1.30
210921778--210921813
11
3.2
12
88
11
58
47
0
52
0
1.00
210921780--210921823
11
4.1
11
88
8
56
43
0
56
0
0.99
210931000--210931183
40
4.6
40
81
2
172
28
22
26
22
1.99
210931040--210931228
80
2.4
80
77
5
184
24
22
29
23
1.99
210934845--210935146
68
4.6
66
67
18
180
29
15
28
25
1.96
210934759--210935155
198
2.0
198
98
0
776
28
16
28
26
1.97
210934766--210935248
198
2.4
195
88
5
580
30
16
28
25
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
210938128--210938217
37
2.4
36
88
3
135
25
33
16
24
1.96
210938140--210938211
36
2.0
37
94
2
128
22
34
18
25
1.96
210938313--210938478
49
3.4
49
94
0
278
28
32
9
28
1.89
210941781--210941840
29
2.1
29
96
0
111
25
31
15
28
1.95
210943234--210943426
39
4.9
39
90
0
251
23
31
21
23
1.98
210943264--210943426
39
4.2
39
93
0
263
24
31
20
23
1.98
210951160--210951352
39
4.9
39
90
0
251
23
31
21
23
1.98
210951190--210951352
39
4.2
39
93
0
263
24
31
20
23
1.98
210954905--210955072
40
4.2
40
85
5
207
26
28
22
23
1.99
210954905--210955072
80
2.1
80
87
4
241
26
28
22
23
1.99
210959479--210959627
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
210959520--210959627
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
210966170--210966337
40
4.2
40
85
5
198
26
27
22
23
1.99
210966170--210966337
80
2.1
80
86
4
232
26
27
22
23
1.99
210967997--210968173
39
4.5
39
88
2
239
19
22
28
29
1.98
210971415--210971519
43
2.5
43
84
7
135
27
19
21
31
1.97
210976513--210976546
17
2.0
17
94
0
59
23
38
5
32
1.79
210983529--210983745
24
9.1
24
96
1
375
36
25
17
20
1.94
210991536--210991774
24
10.0
24
96
0
415
36
24
17
21
1.94
210994538--210994598
11
5.5
11
73
13
54
32
0
3
63
1.10
210996774--210996989
46
4.7
46
91
0
306
40
15
23
21
1.91
210996724--210996989
138
2.0
130
86
5
370
39
15
23
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211000470--211000535
32
2.1
32
100
0
132
46
31
6
15
1.70
211014011--211014140
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
211014027--211014177
40
3.8
40
77
7
139
22
25
23
27
2.00
211018923--211018970
17
2.6
18
75
15
53
79
2
14
4
0.98
211020126--211020218
29
3.2
29
87
0
123
33
16
27
22
1.95
211020126--211020231
29
3.7
29
82
5
115
30
16
31
22
1.95
211025987--211026023
2
19.0
2
88
5
58
45
0
2
51
1.15
211027927--211028057
29
4.5
29
77
7
115
24
16
32
26
1.96
211030377--211030501
43
2.9
43
89
0
187
12
24
32
30
1.92
211031146--211031196
23
2.2
23
100
0
102
33
0
17
49
1.47
211038885--211039056
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
211038878--211039053
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
211048601--211048790
40
4.8
39
79
4
166
25
28
22
23
1.99
211048678--211048828
40
3.8
40
84
6
164
23
25
22
28
1.99
211052239--211052372
60
2.2
63
77
9
143
29
25
17
27
1.97
211052393--211052438
20
2.3
20
82
14
60
28
28
17
26
1.98
211052405--211052448
19
2.2
20
84
4
54
34
25
18
22
1.96
211056573--211056749
40
4.4
41
88
8
233
24
19
28
27
1.99
211060299--211060469
24
7.1
24
95
0
288
21
17
25
36
1.95
211068228--211068398
24
7.1
24
95
0
288
21
17
25
36
1.95
211076945--211077094
41
3.6
41
77
10
162
22
22
28
27
1.99
211076925--211077094
41
4.2
40
74
18
161
22
22
27
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
211085922--211086070
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
211085963--211086070
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
211094036--211094184
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
211094077--211094184
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
211101374--211101404
12
2.6
12
94
0
53
0
12
0
87
0.55
211108019--211108122
29
3.6
29
85
2
136
25
31
15
27
1.95
211109809--211109863
29
1.9
28
85
3
74
23
23
20
32
1.98
211112892--211113008
43
2.8
41
74
7
117
30
23
16
29
1.96
211120148--211120315
40
4.2
41
80
5
184
25
22
27
25
2.00
211120148--211120315
80
2.1
80
83
5
207
25
22
27
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770