Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  200  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59839497--59839780
40
7.2
40
87
6
411
25
23
29
21
1.99
59847726--59847961
40
5.9
40
88
3
343
25
24
28
22
1.99
59856095--59856157
31
2.1
31
90
3
101
23
23
15
36
1.94
59856349--59856491
24
6.0
24
91
4
209
26
22
22
28
1.99
59856349--59856490
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
59856348--59856491
71
2.0
72
89
4
220
26
22
22
29
1.99
59856541--59856601
20
3.0
20
92
0
104
32
21
11
34
1.89
59856643--59856690
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
59859472--59859644
46
3.7
46
77
10
190
22
19
26
31
1.98
59868538--59868568
6
5.2
6
92
0
53
16
3
0
80
0.83
59871383--59871433
25
2.0
25
81
7
59
33
13
31
21
1.92
59876498--59876656
40
4.0
40
92
0
264
22
22
29
26
1.99
59876820--59876870
25
2.0
25
81
7
59
33
13
31
21
1.92
59890171--59890204
14
2.5
14
90
4
52
32
0
11
55
1.36
59893825--59893871
17
2.7
17
75
15
51
42
10
12
34
1.78
59896058--59896101
13
3.2
15
84
15
60
15
18
6
59
1.58
59899732--59899778
24
2.0
24
86
0
67
31
25
17
25
1.97
59899822--59899880
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
59899826--59899880
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
59899931--59900049
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
59899931--59900049
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
59900240--59900364
31
4.1
31
96
2
234
38
16
22
23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59900240--59900364
61
2.0
62
96
1
234
38
16
22
23
1.93
59904444--59904502
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
59904448--59904502
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
59904553--59904671
24
5.0
24
88
5
170
28
21
22
26
1.99
59904553--59904671
47
2.5
48
89
5
170
28
21
22
26
1.99
59904900--59904940
20
2.0
20
100
0
82
34
19
19
26
1.96
59904869--59904971
51
2.0
51
98
0
197
35
17
21
25
1.95
59907001--59907033
14
2.4
14
90
10
50
18
21
6
54
1.64
59908483--59908522
19
2.1
19
90
0
62
32
15
0
52
1.43
59913109--59913142
16
2.0
17
88
11
52
29
29
35
5
1.81
59917520--59917583
31
2.1
31
100
0
128
42
23
6
28
1.78
59924161--59924208
17
2.8
17
75
15
53
39
8
16
35
1.79
59930982--59931059
28
2.8
27
80
5
93
32
28
12
26
1.93
59936322--59936393
25
3.1
22
78
21
69
36
4
0
59
1.17
59936418--59936549
15
9.1
15
66
24
52
34
3
0
61
1.19
59936438--59936547
23
5.0
21
65
21
57
32
3
0
62
1.18
59942795--59942833
19
2.1
19
100
0
78
35
30
15
17
1.91
59948603--59948733
67
2.0
67
90
0
208
32
11
29
26
1.91
59948807--59948853
21
2.2
21
100
0
94
38
14
36
10
1.81
59948670--59948828
44
3.6
44
90
2
239
32
13
29
25
1.93
59948719--59948916
109
1.8
109
94
2
353
30
14
30
24
1.95
59948767--59948899
65
2.0
65
92
0
221
34
14
31
19
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59948832--59948916
44
1.9
44
95
0
152
29
14
29
27
1.95
59948589--59948942
153
2.3
155
84
6
459
31
13
29
25
1.94
59950450--59950492
15
2.7
15
85
7
50
32
2
0
65
1.06
59950452--59950507
17
3.5
16
79
15
55
30
3
0
66
1.09
59950452--59950504
14
3.7
15
72
18
51
30
3
0
66
1.10
59950552--59950602
22
2.3
22
82
0
66
33
3
0
62
1.13
59952307--59952889
303
1.9
303
97
0
1103
39
21
5
33
1.77
59952953--59952984
16
2.0
16
93
0
55
9
6
34
50
1.60
59981843--59981960
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
59981811--59981974
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
59989414--59989531
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
59989382--59989545
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
59994472--59994508
19
1.9
19
88
0
56
72
10
2
13
1.21
59994947--59995061
55
2.1
56
83
8
146
34
21
24
19
1.96
59994972--59995061
27
3.2
27
85
7
119
32
23
24
20
1.98
59997826--59997949
45
2.8
45
87
0
185
36
19
24
20
1.95
59997826--59998028
45
4.5
45
82
0
172
37
16
24
21
1.94
59997957--59998181
46
4.9
46
92
1
326
40
14
23
21
1.90
60008968--60009045
38
2.1
38
100
0
156
43
17
12
25
1.85
60013054--60013086
17
1.9
17
88
11
50
69
3
0
27
1.03
60013341--60013398
22
2.6
22
84
7
73
43
17
3
36
1.66
60013389--60013459
35
2.0
36
94
2
126
36
14
9
39
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60013377--60013467
19
4.9
19
88
8
143
37
15
8
38
1.78
60013822--60014015
45
4.3
45
86
1
255
25
28
13
31
1.94
60013830--60013998
89
1.9
89
90
0
266
26
30
13
29
1.94
60014029--60014245
78
2.8
78
85
2
301
24
24
19
30
1.98
60014129--60014762
297
2.1
298
94
0
1117
26
23
18
31
1.98
60015925--60015962
19
2.0
19
100
0
76
26
15
31
26
1.96
60027954--60028049
27
3.5
28
94
4
169
18
9
27
44
1.80
60029661--60029698
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
60030548--60030738
46
4.1
47
91
1
262
19
23
15
42
1.88
60030548--60030738
93
2.1
92
87
3
267
19
23
15
42
1.88
60031541--60031589
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
60032412--60032578
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
60037803--60037872
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
60037803--60037884
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
60045571--60045596
10
2.6
10
100
0
52
26
11
42
19
1.85
60047280--60047346
33
2.0
33
97
0
125
34
23
10
31
1.89
60048428--60048460
16
2.1
16
94
0
57
9
27
27
36
1.87
60059330--60059445
43
2.7
40
78
13
115
29
25
18
25
1.98
60059912--60059956
21
2.1
21
95
0
81
60
15
2
22
1.46
60065763--60065934
87
2.0
87
97
0
326
40
14
8
37
1.76
60067443--60067489
12
4.0
11
81
18
51
44
8
0
46
1.33
60067446--60067504
24
2.5
24
76
17
61
40
8
0
50
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60070834--60070977
49
2.9
49
81
4
182
28
27
18
25
1.98
60074144--60074371
50
4.6
50
82
8
248
28
26
19
25
1.98
60084872--60084923
27
2.0
25
85
7
68
30
3
5
59
1.39
60085087--60085205
56
2.1
56
96
0
220
21
23
6
47
1.74
60086238--60086272
2
17.5
2
93
0
61
51
2
0
45
1.16
60087359--60087611
68
3.8
65
77
9
203
24
29
16
30
1.96
60090864--60090935
31
2.3
31
82
0
81
23
25
34
16
1.95
60092222--60092289
25
2.7
26
84
6
86
41
10
16
32
1.82
60096681--60096743
31
1.9
31
84
9
81
23
9
30
36
1.87
60098935--60099022
43
2.1
42
93
2
149
37
6
14
40
1.73
60098952--60099021
21
3.3
21
66
9
61
40
8
12
38
1.74
60099032--60099144
56
2.0
56
92
0
190
38
17
8
35
1.81
60099642--60099666
3
8.3
3
100
0
50
64
0
0
36
0.94
60100947--60101018
28
2.5
29
86
4
101
26
13
15
44
1.84
60103364--60103485
46
2.6
46
83
7
131
22
29
18
28
1.98
60105547--60105658
40
2.8
40
89
2
163
27
21
24
26
1.99
60105563--60105734
40
4.3
40
88
4
186
26
19
25
28
1.99
60110737--60110942
40
5.2
40
87
3
260
26
28
21
23
1.99
60118813--60119019
80
2.6
80
90
1
328
26
28
21
23
1.99
60118813--60119019
40
5.2
40
88
2
285
26
28
21
23
1.99
60125086--60125173
40
2.2
40
91
0
140
30
19
21
28
1.97
60125105--60125278
40
4.3
40
87
4
217
24
18
27
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60129958--60130101
46
3.1
46
82
8
125
31
18
27
22
1.97
60129958--60130121
47
3.5
47
80
10
135
29
18
28
23
1.98
60131411--60131442
12
2.6
13
90
9
50
50
25
6
18
1.70
60131887--60132221
88
3.9
86
84
5
250
28
25
17
28
1.97
60131988--60132235
44
5.6
44
90
1
390
29
26
15
28
1.96
60131988--60132238
132
1.9
132
93
1
432
29
26
15
28
1.96
60135679--60135703
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
60137707--60137767
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
60142492--60142744
44
5.8
44
86
3
339
30
23
15
31
1.95
60144376--60144415
22
1.9
22
90
10
66
12
40
30
17
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770