Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  633  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
198547777--198547855
15
5.4
15
77
10
83
58
13
17
10
1.63
198547788--198547864
15
5.2
15
75
9
77
55
15
16
11
1.68
198550808--198550978
93
1.8
93
96
0
315
27
29
22
20
1.98
198550800--198550980
46
3.9
46
81
9
233
27
29
21
20
1.98
198552943--198553011
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
198554224--198554264
17
2.3
18
87
4
57
24
7
19
48
1.74
198555378--198555421
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
198558466--198558506
17
2.3
18
87
4
57
24
7
19
48
1.74
198559619--198559662
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
198561452--198561520
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
198568452--198568620
46
3.7
46
77
10
182
24
19
26
29
1.98
198568845--198568882
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
198572640--198572803
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
198572640--198572837
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
198578944--198579021
31
2.6
30
88
7
115
32
26
16
24
1.96
198578944--198579027
30
2.8
31
89
5
120
29
27
15
27
1.96
198580366--198580529
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
198580366--198580563
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
198582008--198582085
25
3.2
25
80
3
70
26
17
23
32
1.97
198582015--198582084
25
2.8
25
82
2
88
25
20
25
28
1.99
198583009--198583238
27
8.4
27
79
7
160
32
8
19
39
1.82
198582986--198583265
54
5.1
54
76
7
226
32
8
20
38
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
198582963--198583251
81
3.6
81
70
9
219
31
8
19
40
1.82
198583082--198583311
27
8.5
27
75
8
146
34
7
20
37
1.81
198588585--198588743
43
3.7
43
78
3
151
26
16
23
33
1.96
198590913--198591080
43
3.9
44
81
4
173
27
14
24
33
1.94
198592498--198592613
29
4.0
29
81
8
130
25
30
15
28
1.96
198592489--198592600
58
1.9
58
85
3
154
25
31
15
27
1.95
198597182--198597279
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
198606099--198606247
39
3.8
38
78
8
131
22
26
24
26
2.00
198614057--198614205
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
198614098--198614205
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
198620686--198620869
40
4.6
40
81
2
172
28
22
26
22
1.99
198620726--198620914
80
2.4
80
77
5
184
24
22
29
23
1.99
198626518--198626646
39
3.3
40
85
4
165
24
28
22
24
1.99
198627550--198627700
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Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
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G
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(0-2)
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1.95
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22
25
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2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
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T
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
Indels
Score
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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Entropy
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25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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