Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  180  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53824620--53824728
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
53831649--53831688
22
1.9
20
90
10
62
45
17
0
37
1.49
53833691--53833720
15
2.0
15
93
0
51
46
3
6
43
1.46
53833927--53833992
34
2.0
33
82
8
80
40
3
1
54
1.25
53837117--53837185
22
3.3
22
69
22
76
18
11
10
59
1.60
53837115--53837198
40
2.1
40
97
2
161
19
9
9
61
1.53
53841729--53841916
49
3.8
49
85
2
259
29
26
18
26
1.98
53841734--53841921
100
1.9
100
93
0
322
29
26
19
25
1.98
53851146--53851202
30
1.9
30
92
0
96
31
21
17
29
1.96
53858053--53858228
46
3.8
46
78
12
198
20
21
29
28
1.98
53858050--53858220
93
1.8
93
92
0
288
20
21
29
28
1.98
53860747--53860964
46
4.8
45
78
6
172
24
20
31
22
1.98
53860846--53861001
46
3.5
43
83
10
145
23
19
31
25
1.98
53861934--53861991
28
2.1
28
80
6
64
18
10
15
55
1.68
53864382--53864555
46
3.8
46
78
13
194
20
21
28
29
1.98
53864379--53864549
93
1.8
93
92
0
288
20
21
29
28
1.98
53868007--53868070
30
2.2
29
91
2
101
35
21
17
25
1.95
53869185--53869318
24
5.6
24
84
3
153
32
32
13
22
1.92
53869916--53869948
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
53870661--53870694
17
2.0
17
88
0
50
35
5
2
55
1.39
53872791--53872971
40
4.6
40
88
3
251
26
23
25
24
2.00
53880702--53880957
40
6.5
40
88
4
351
24
23
26
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
53891686--53892079
47
8.4
47
92
0
608
32
8
30
28
1.86
53891742--53891863
22
5.3
22
62
14
57
31
9
30
27
1.89
53900248--53900279
14
2.4
13
90
10
55
62
12
6
18
1.50
53904599--53904645
22
2.1
22
100
0
94
46
0
21
31
1.51
53909812--53909895
27
3.1
27
86
5
116
20
22
23
33
1.97
53916442--53916474
18
1.9
18
88
11
52
39
6
36
18
1.75
53917325--53917376
27
1.9
27
84
0
68
42
11
13
32
1.80
53917840--53917950
55
2.0
55
83
0
141
17
27
27
27
1.97
53929998--53930172
46
3.8
45
88
1
242
22
21
26
30
1.99
53930004--53930172
92
1.8
92
89
2
268
22
20
26
30
1.98
53941665--53941702
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
53949621--53949662
21
2.0
21
85
0
57
19
40
16
23
1.91
53952471--53952495
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
53955445--53955611
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
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4.5
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53970182--53970312
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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1.84

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