Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  569  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
177393594--177393746
78
2.0
78
80
5
175
25
18
27
28
1.98
177395861--177395907
22
2.1
22
100
0
94
38
31
12
17
1.87
177402080--177402240
38
4.2
38
93
1
250
33
27
19
19
1.96
177402080--177402269
76
2.5
78
87
6
271
32
26
21
20
1.98
177410152--177410270
38
3.1
38
81
4
132
33
24
19
22
1.97
177412146--177412214
24
2.9
24
91
2
113
14
10
11
63
1.51
177413411--177413560
38
3.9
38
90
3
221
24
30
21
24
1.99
177423175--177423236
27
2.3
27
86
10
99
19
9
27
43
1.82
177425038--177425138
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
177432998--177433098
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
177435438--177435462
12
2.1
12
100
0
50
68
0
32
0
0.90
177435979--177436016
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
177442293--177442361
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
177443969--177444006
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
177451489--177451619
46
2.8
48
82
14
175
22
19
27
29
1.98
177454538--177454606
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
177454529--177454616
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
177456998--177457172
97
1.8
93
91
4
287
21
22
29
27
1.99
177457002--177457180
46
3.8
46
78
15
195
21
21
29
27
1.99
177458571--177458642
28
2.6
28
95
2
128
19
9
27
43
1.82
177475234--177475593
94
3.8
93
78
5
348
26
19
29
23
1.98
177475468--177475593
49
2.6
48
81
8
139
28
19
29
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
177475231--177475593
47
7.7
47
70
9
179
26
19
30
23
1.98
177476347--177476471
54
2.3
55
80
6
130
19
24
30
25
1.98
177477253--177477325
34
2.1
34
82
5
94
30
19
23
27
1.98
177480825--177480857
16
2.1
16
88
5
50
57
3
0
39
1.14
177480978--177481072
30
3.1
29
75
19
84
44
4
1
50
1.28
177481059--177481122
19
3.4
19
84
4
85
68
1
0
29
0.99
177481059--177481118
6
9.8
6
94
3
93
70
1
0
28
0.97
177485925--177485999
36
2.1
37
97
2
143
36
17
0
46
1.48
177505340--177505450
44
2.6
42
80
7
125
23
19
24
32
1.98
177507192--177507328
43
3.2
43
77
10
111
27
24
20
27
1.99
177507691--177507728
11
3.5
11
80
20
53
23
21
21
34
1.97
177507691--177507731
21
2.0
21
100
0
82
21
19
19
39
1.93
177507962--177507990
13
2.2
13
100
0
58
27
0
10
62
1.28
177507987--177508638
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26
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22
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20
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Period
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Copy
Number
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31
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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