Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  611  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
191200144--191200191
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
191203671--191203936
40
6.8
40
93
4
436
22
19
30
26
1.98
191203671--191203936
117
2.3
117
91
5
439
22
19
30
26
1.98
191203671--191203936
77
3.4
79
93
3
416
22
19
30
26
1.98
191204681--191204778
41
2.4
41
80
11
112
24
25
24
25
2.00
191204723--191204806
40
2.1
40
80
8
91
25
27
27
20
1.99
191207551--191207781
49
4.7
49
98
0
426
29
9
31
29
1.89
191207842--191207928
37
2.3
36
94
5
147
20
19
33
26
1.97
191210541--191210672
57
2.3
58
84
3
171
28
28
19
23
1.98
191210680--191210914
40
5.9
40
92
1
384
26
26
22
24
2.00
191212407--191212549
46
3.1
46
83
1
178
25
30
9
34
1.87
191212523--191212692
47
3.6
47
89
3
236
26
30
10
32
1.90
191212613--191212687
22
3.3
22
64
29
57
25
30
13
30
1.94
191212672--191212711
19
2.1
19
100
0
80
27
30
10
32
1.89
191212625--191212824
66
3.0
66
95
0
364
27
30
11
32
1.91
191212563--191212846
113
2.5
117
79
13
324
26
29
10
32
1.90
191222078--191222262
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
191222079--191222270
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
191222078--191222295
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
191223219--191223247
15
1.9
15
100
0
58
58
13
6
20
1.58
191230076--191230260
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
191230077--191230268
40
4.8
40
79
7
151
24
24
28
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
191230076--191230293
79
2.7
79
79
6
183
24
23
27
24
2.00
191232181--191232350
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
191242182--191242391
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
191249712--191249892
78
2.3
80
84
7
237
25
27
22
24
2.00
191249710--191249892
40
4.7
40
84
10
218
25
27
22
24
2.00
191253506--191253935
40
10.8
40
91
1
637
24
27
22
24
2.00
191256678--191256885
40
5.2
40
88
0
292
23
21
28
26
1.99
191257961--191258036
37
2.0
38
89
2
118
27
25
19
27
1.99
191258183--191258319
46
3.0
46
86
0
193
24
31
9
34
1.88
191258293--191258484
47
4.1
47
93
0
303
26
30
10
32
1.91
191265371--191265488
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
191265339--191265502
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
191272844--191273040
71
2.8
68
90
4
245
34
17
28
20
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191272909--191273026
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191272877--191273040
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2.3
71
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0
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1.99
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
191308684--191308890
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2.1
209
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2.7
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23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
A
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T
Entropy
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4.7
40
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5
227
26
26
21
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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