Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  635  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
199212232--199212395
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
199219362--199219479
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
199219330--199219493
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
199226401--199226598
71
2.8
70
92
3
294
33
17
28
20
1.95
199226467--199226584
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
199226435--199226598
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
199229786--199229868
31
2.7
31
87
3
116
30
22
15
31
1.95
199230088--199230157
25
2.8
25
91
0
104
24
21
25
28
1.99
199231037--199231117
26
3.0
27
79
13
87
34
7
16
41
1.76
199231095--199231217
27
4.6
27
75
10
110
27
6
22
43
1.78
199231030--199231165
55
2.5
54
78
7
132
32
7
18
41
1.78
199231094--199231217
54
2.3
55
81
5
146
28
6
22
42
1.78
199231119--199231217
27
3.7
26
77
5
117
28
7
23
41
1.80
199231249--199231313
27
2.4
27
89
0
94
43
10
21
24
1.84
199235917--199236033
46
2.5
46
90
0
189
30
19
26
23
1.98
199235917--199236064
46
3.2
45
83
6
183
30
18
26
24
1.98
199242952--199243050
28
3.5
29
82
6
114
28
15
26
30
1.96
199244729--199244782
27
2.0
27
81
0
63
27
20
18
33
1.96
199246305--199246490
40
4.7
40
87
5
227
25
26
22
24
2.00
199251798--199251846
23
2.0
24
88
7
73
14
12
16
57
1.66
199254506--199254577
27
2.6
27
73
6
63
30
20
16
31
1.95
199256101--199256286
40
4.7
40
87
5
227
26
26
22
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
199259312--199259381
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
199267372--199267557
40
4.7
40
89
5
245
26
26
21
25
1.99
199270523--199270599
32
2.4
33
80
6
86
31
3
2
62
1.27
199282698--199282811
43
2.7
43
95
0
210
35
26
16
21
1.94
199282882--199283001
43
2.8
44
84
2
143
29
23
23
24
1.99
199282915--199283001
44
2.0
43
90
2
138
28
22
22
25
1.99
199283013--199283300
44
6.6
42
69
10
134
36
20
22
20
1.95
199283187--199283554
87
4.2
87
71
9
216
35
21
21
21
1.96
199285165--199285406
3
79.3
3
71
15
131
31
7
2
59
1.36
199285740--199285808
3
24.0
3
73
8
63
31
4
1
62
1.24
199285740--199285808
20
3.5
20
82
4
77
31
4
1
62
1.24
199288465--199288520
3
18.7
3
92
0
94
30
1
0
67
1.01
199290349--199290484
26
5.2
26
97
0
236
33
5
24
36
1.78
199292260--199292545
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136
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199297814--199297980
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4.2
40
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24
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23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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28
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199343585--199344003
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
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199359527--199359858
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Period
Size
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
A
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19
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5
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45
10
2
40
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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