Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  240  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71817931--71818021
17
5.2
18
81
5
105
31
14
23
30
1.94
71817931--71818021
35
2.6
35
84
5
121
31
14
23
30
1.94
71820552--71820584
13
2.5
13
95
0
57
24
0
0
75
0.80
71823723--71823766
19
2.3
19
92
0
70
47
6
9
36
1.62
71829357--71829415
31
1.9
30
89
3
91
27
11
11
49
1.74
71832984--71833025
21
2.0
22
85
4
59
57
21
16
4
1.58
71834446--71834516
3
23.7
3
88
5
108
32
4
0
63
1.14
71834961--71835017
27
2.0
28
83
12
73
28
10
7
54
1.60
71835098--71835168
13
5.5
12
70
20
54
35
4
7
53
1.48
71835084--71835168
28
3.2
27
82
9
104
35
5
5
52
1.50
71835126--71835185
11
5.5
11
74
21
63
35
3
6
55
1.43
71835084--71835185
15
7.4
13
69
23
50
35
4
5
53
1.46
71835524--71835608
3
28.7
3
81
2
100
31
5
0
62
1.19
71838803--71838836
17
2.0
17
94
0
59
17
2
0
79
0.86
71838942--71839098
10
15.7
10
66
21
53
35
3
0
61
1.14
71838940--71838986
21
2.2
21
85
7
60
31
4
0
63
1.13
71838953--71839005
21
2.7
20
85
5
63
33
1
0
64
1.05
71838942--71839020
20
3.8
21
71
20
60
31
5
0
63
1.16
71838939--71839112
78
2.2
77
80
11
178
33
3
0
62
1.12
71838965--71839112
80
1.9
77
82
10
183
34
2
0
62
1.09
71840158--71840185
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
71847258--71847300
22
2.0
22
100
0
86
32
32
0
34
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71848687--71848722
17
2.1
17
90
10
56
80
0
16
2
0.83
71848885--71848922
19
2.0
19
100
0
76
15
10
15
57
1.64
71853809--71853851
15
2.6
16
85
10
52
41
0
0
58
0.98
71858624--71858706
41
2.0
41
97
0
157
39
13
16
30
1.87
71866454--71866487
16
2.1
16
94
0
59
47
5
5
41
1.52
71866731--71866835
45
2.3
45
96
1
192
40
11
15
32
1.83
71879691--71879737
20
2.3
21
85
7
62
36
0
2
61
1.08
71879650--71879743
32
3.1
31
76
8
77
40
1
2
56
1.18
71892000--71892032
2
16.5
2
93
0
57
51
0
0
48
1.00
71892197--71892224
13
2.2
13
100
0
56
60
0
0
39
0.97
71896122--71896165
22
2.0
21
82
8
52
22
18
2
56
1.52
71898751--71898788
19
2.0
19
100
0
76
52
0
10
36
1.36
71907338--71907378
22
1.9
21
90
5
64
65
0
9
24
1.22
71907688--71907862
30
5.8
30
88
1
219
27
47
4
21
1.68
71908422--71908497
25
2.9
27
76
7
84
38
5
2
53
1.37
71908532--71908578
25
2.0
24
87
8
69
38
8
2
51
1.45
71908730--71908777
16
3.1
15
90
6
69
31
2
2
64
1.16
71908730--71908776
8
5.9
8
85
7
60
31
2
2
63
1.18
71910329--71910364
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
71918691--71918720
13
2.3
13
100
0
60
13
13
6
66
1.43
71918919--71918946
13
2.2
13
100
0
56
14
14
7
64
1.48
71918543--71919859
230
5.8
232
90
6
2021
26
17
21
34
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71918848--71919023
85
2.1
85
88
4
257
27
15
19
37
1.92
71919072--71919859
159
5.1
151
75
19
679
26
17
21
35
1.95
71918543--71919859
451
2.9
457
90
6
2019
26
17
21
34
1.95
71919403--71919812
72
5.5
73
77
16
403
27
16
22
33
1.95
71919528--71919697
87
2.0
86
87
4
245
25
17
20
36
1.94
71919632--71919848
74
2.9
73
87
7
307
26
16
22
34
1.95
71919473--71919772
161
1.9
159
91
2
494
27
17
22
33
1.96
71919833--71919868
14
2.8
14
80
20
51
16
11
5
66
1.40
71923282--71923408
38
3.3
39
74
6
116
24
24
26
24
2.00
71926012--71926038
14
1.9
14
100
0
54
11
0
29
59
1.32
71926470--71926502
12
2.8
12
90
0
57
24
36
24
15
1.93
71930634--71930707
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
71930691--71930766
29
2.6
29
77
4
82
22
21
35
21
1.96
71936301--71936471
93
1.8
93
92
0
288
28
28
21
22
1.99
71936293--71936468
46
3.8
46
78
10
205
29
27
20
22
1.98
71942635--71942752
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
71942603--71942766
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
71947814--71948133
47
6.7
46
76
9
243
25
21
30
21
1.99
71947780--71948092
94
3.3
94
80
7
330
25
21
30
22
1.98
71947770--71948133
141
2.5
144
81
5
400
26
21
29
21
1.99
71949589--71949671
43
1.9
43
83
13
109
26
18
26
28
1.98
71952603--71952642
16
2.3
18
84
16
50
32
0
30
37
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
71953327--71953408
33
2.4
34
80
8
105
28
17
23
31
1.96
71953327--71953421
32
2.9
30
75
12
82
26
18
25
29
1.98
71959810--71959892
43
1.9
43
83
13
109
24
18
28
28
1.98
71960948--71960976
14
2.0
15
93
6
51
31
6
13
48
1.69
71970899--71971087
33
5.8
33
78
6
143
39
17
22
20
1.93
71970937--71971117
97
1.9
97
81
2
220
39
18
22
20
1.93
71970902--71971117
64
3.3
65
76
8
183
39
17
21
21
1.92
71978089--71978264
40
4.4
40
79
5
185
24
25
25
25
2.00
71978071--71978263
80
2.4
80
81
2
208
22
25
24
26
2.00
71980043--71980075
8
4.0
8
96
4
57
63
24
0
12
1.28
71988084--71988182
28
3.5
29
83
6
114
30
27
15
27
1.96
71997138--71997297
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
71999336--71999434
28
3.5
29
80
6
105
31
27
14
27
1.95
72013248--72013506
68
3.9
64
76
14
233
30
16
29
24
1.96
72014591--72014617
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
72018542--72018708
39
4.3
39
89
3
255
21
26
20
31
1.98
72023631--72023692
30
2.1
30
96
0
115
29
29
22
19
1.98
72028085--72028128
22
2.0
22
86
8
63
34
13
20
31
1.92
72028387--72028535
40
3.7
40
91
3
246
25
27
22
24
2.00
72035546--72035689
40
3.6
40
94
2
238
25
28
23
22
1.99
72038263--72038433
93
1.8
93
93
2
299
30
26
19
22
1.98
72038258--72038429
46
3.7
45
75
16
172
31
26
19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72038848--72038907
30
2.0
30
86
0
84
30
26
8
35
1.86
72045810--72045978
92
1.8
91
96
1
311
28
28
21
21
1.98
72045805--72045974
46
3.7
45
81
11
220
28
28
21
21
1.99
72045807--72045994
46
4.1
46
73
18
151
28
28
20
21
1.98
72046384--72046443
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
72051857--72051890
17
1.9
18
94
5
61
26
0
14
58
1.36
72053700--72053731
14
2.4
13
90
10
55
18
6
12
62
1.50
72058469--72058531
33
1.9
33
100
0
126
38
12
19
30
1.89
72080209--72080374
40
4.2
40
75
4
140
22
27
23
25
2.00
72082325--72082423
28
3.5
29
83
6
114
30
27
15
27
1.96
72090238--72090263
13
2.0
13
100
0
52
23
0
30
46
1.53
72093903--72093949
22
2.1
22
100
0
94
53
17
21
8
1.70
72103193--72103372
76
2.3
81
85
6
246
25
27
22
24
2.00
72111336--72111499
40
4.1
40
79
10
167
26
28
21
23
1.99
72111348--72111444
39
2.5
40
86
1
133
25
29
20
23
1.99
72111348--72111499
79
1.9
80
81
6
184
26
28
21
23
1.99
72123564--72123733
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
72131658--72131827
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
72133380--72133416
18
2.1
19
90
10
60
16
24
37
21
1.93
72141119--72141197
26
3.0
27
75
3
88
32
26
7
32
1.85
72141105--72141190
27
3.2
27
72
8
77
31
30
8
30
1.86
72141316--72141383
27
2.5
27
85
0
91
32
23
14
29
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
72141307--72141385
27
3.0
26
80
9
88
27
25
13
32
1.94
72141502--72141602
50
2.0
50
84
3
132
26
23
13
35
1.93
72143828--72143931
43
2.5
42
83
9
131
26
24
16
32
1.96
72149920--72150040
46
2.6
46
94
0
206
20
20
28
30
1.98
72154393--72154418
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
72163031--72163056
13
2.0
13
100
0
52
23
46
0
30
1.53
72166647--72166763
43
2.8
42
77
2
135
23
15
27
33
1.95
72169776--72169855
27
3.0
27
86
0
106
32
18
21
27
1.97
72169845--72170151
27
11.4
27
77
12
179
42
17
8
31
1.79
72169845--72170151
54
5.7
54
80
5
257
42
17
8
31
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770