Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  278  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84265105--84265271
46
3.6
46
79
8
130
26
18
29
24
1.98
84269621--84269790
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
84277717--84277926
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
84279709--84279891
68
2.7
66
89
5
235
34
14
27
23
1.93
84279735--84279891
68
2.3
67
94
1
269
32
14
29
24
1.94
84286367--84286535
46
3.6
46
81
6
180
21
29
20
27
1.98
84288237--84288343
29
3.7
29
88
0
142
28
16
32
22
1.96
84295079--84295293
40
5.4
40
93
1
351
26
28
22
21
1.99
84295970--84296012
22
2.0
21
81
4
50
37
18
6
37
1.78
84300181--84300281
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
84300210--84300285
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
84308039--84308139
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
84308068--84308143
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
84311736--84311799
25
2.6
25
97
0
119
26
29
12
31
1.93
84312445--84312488
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
84317677--84317747
30
2.4
30
85
0
88
42
11
26
19
1.85
84317732--84317837
30
3.5
30
75
7
108
32
13
25
29
1.93
84317793--84317895
30
3.4
30
79
2
109
35
9
30
24
1.87
84321098--84321127
14
2.1
14
93
0
51
43
16
0
40
1.48
84321450--84321605
43
3.6
45
75
13
123
29
25
16
28
1.97
84323344--84323588
40
6.1
40
86
2
316
26
27
22
23
2.00
84323344--84323588
80
3.1
80
92
1
384
26
27
22
23
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84327695--84327739
18
2.5
18
96
0
81
40
26
4
28
1.75
84328296--84328383
6
14.3
6
78
13
72
44
12
20
22
1.85
84328296--84328389
31
3.0
31
88
0
134
44
12
20
22
1.85
84328814--84329011
27
7.3
27
87
3
206
24
19
18
36
1.94
84328828--84329009
54
3.4
54
85
3
249
25
19
18
36
1.95
84328815--84329009
81
2.4
81
87
3
268
25
20
18
36
1.95
84328991--84329092
27
3.8
27
70
5
71
32
8
21
37
1.84
84328869--84329038
81
2.1
79
79
8
182
27
17
18
36
1.93
84329041--84329271
27
8.6
27
78
4
126
32
9
19
38
1.84
84329041--84329271
81
2.9
81
83
3
243
32
9
19
38
1.84
84329113--84329306
27
7.2
27
84
0
226
33
8
18
39
1.81
84329301--84329370
27
2.6
27
86
0
95
28
22
17
31
1.96
84329130--84329333
81
2.5
81
81
3
196
32
10
18
38
1.85
84333581--84333751
43
4.0
43
72
11
143
23
16
25
33
1.96
84336961--84337137
46
3.9
44
78
11
194
21
21
27
29
1.99
84336958--84337129
93
1.8
93
91
0
281
20
22
28
28
1.99
84341765--84341796
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
84343307--84343523
39
5.5
39
80
9
237
23
20
26
29
1.98
84343307--84343511
77
2.6
77
86
2
286
22
19
27
30
1.98
84343456--84343539
40
2.1
39
84
2
105
17
19
28
34
1.95
84349218--84349275
28
2.1
28
83
0
71
44
12
13
29
1.80
84360087--84360267
40
4.6
40
90
2
276
23
20
30
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84368074--84368254
40
4.6
40
90
2
276
23
20
30
25
1.99
84370074--84370106
8
4.0
8
92
7
57
12
0
0
87
0.53
84370073--84370105
9
3.8
9
92
8
59
9
0
0
90
0.44
84370073--84370106
17
2.0
17
100
0
68
11
0
0
88
0.52
84373388--84373426
20
2.0
19
85
5
51
41
2
7
48
1.45
84377156--84377304
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
84377197--84377304
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
84381441--84381601
29
5.6
29
84
1
171
24
16
32
25
1.96
84389359--84389518
29
5.6
29
84
3
171
25
16
32
25
1.96
84392306--84392369
31
2.1
30
88
2
92
23
23
15
37
1.93
84392576--84392704
24
5.4
24
93
2
206
27
21
20
29
1.98
84392576--84392704
47
2.7
48
91
3
206
27
21
20
29
1.98
84392753--84392819
20
3.3
20
93
0
116
32
20
11
34
1.90
84392753--84392808
11
5.5
11
71
16
57
32
19
12
35
1.89
84392856--84392903
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
84394180--84394242
28
2.2
29
82
2
74
34
15
28
20
1.94
84405132--84405157
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
84405474--84405625
82
1.9
82
100
0
304
41
1
25
30
1.67
84405718--84405814
27
3.6
27
94
1
167
28
13
25
31
1.94
84405718--84405826
54
2.0
55
89
5
168
29
14
23
32
1.94
84418070--84418277
40
5.2
40
82
2
202
25
23
25
25
2.00
84418072--84418277
80
2.6
80
83
3
236
25
23
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84426810--84426973
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
84426810--84427007
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
84433928--84434091
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
84433928--84434125
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
84437662--84437741
34
2.4
34
85
4
99
25
25
25
25
2.00
84438293--84438326
16
2.0
18
88
11
54
20
38
29
11
1.88
84441629--84441655
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
84443635--84443695
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
84449266--84449491
94
2.4
93
83
8
271
26
20
30
22
1.98
84449313--84449489
47
3.8
47
80
9
200
27
20
31
20
1.98
84451693--84451821
51
2.6
51
86
4
183
27
20
24
27
1.99
84451693--84451834
49
2.8
51
84
4
191
28
19
23
28
1.98
84453909--84453958
24
2.1
24
96
0
91
34
8
10
48
1.66
84459816--84460037
46
4.8
48
81
7
192
27
18
29
24
1.98
84459816--84460037
94
2.4
95
82
10
237
27
18
29
24
1.98
84468230--84468279
22
2.4
19
84
15
64
44
2
0
54
1.11
84468230--84468276
16
2.9
15
79
20
51
44
2
0
53
1.12
84468972--84469027
8
7.0
8
76
8
51
37
1
1
58
1.19
84474590--84474679
29
3.1
29
88
1
137
25
15
31
27
1.96
84476887--84477167
50
5.6
50
77
6
266
31
24
17
26
1.97
84476885--84477163
151
1.8
150
87
4
409
31
25
16
25
1.97
84484915--84484987
29
2.5
29
100
0
146
31
15
28
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84484974--84485046
29
2.5
29
84
0
92
28
17
26
27
1.98
84492154--84492226
29
2.5
29
100
0
146
31
15
28
24
1.95
84492213--84492285
29
2.5
29
84
0
92
28
17
26
27
1.98
84507366--84507664
48
6.2
48
93
0
490
32
26
5
35
1.80
84513869--84514041
46
3.8
46
78
10
192
20
21
29
28
1.98
84521285--84521459
46
3.8
46
80
11
214
20
20
29
29
1.97
84521282--84521452
92
1.9
92
96
0
315
20
21
29
28
1.98
84524121--84524151
8
3.9
8
100
0
62
0
38
22
38
1.54
84525842--84526153
47
6.6
46
72
13
208
24
27
19
28
1.99
84525842--84526210
47
7.8
46
70
11
187
24
27
19
28
1.98
84525842--84526211
94
3.9
94
78
7
331
24
27
19
28
1.98
84526545--84526630
30
2.9
30
92
0
136
26
27
16
29
1.97
84528466--84528561
23
4.2
22
73
6
75
26
20
18
34
1.96
84528522--84528598
22
3.3
23
82
8
86
28
23
18
29
1.97
84528476--84528602
46
2.8
44
80
7
119
27
19
17
35
1.94
84540356--84540513
43
3.7
41
75
8
138
25
17
25
31
1.97
84540395--84540505
42
2.6
43
81
4
136
25
18
24
31
1.98
84540344--84540505
85
1.9
85
82
8
204
25
16
24
32
1.96
84542298--84542327
15
2.0
15
100
0
60
26
33
20
20
1.97
84551694--84551762
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
84551685--84551772
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
84554133--84554313
46
3.9
46
81
9
233
20
21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84554135--84554305
93
1.8
93
96
0
315
20
22
29
27
1.98
84585619--84585676
26
2.3
26
90
3
91
18
24
1
55
1.52
84603011--84603059
24
2.0
24
84
0
62
28
40
14
16
1.87
84624571--84624604
18
1.9
17
88
5
50
8
20
17
52
1.71
84688468--84688643
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
84688465--84688636
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
84695976--84696151
46
3.8
46
79
14
200
19
20
30
29
1.97
84695973--84696144
93
1.8
93
93
2
301
20
20
30
28
1.98
84704225--84704336
40
2.8
40
89
2
136
23
16
24
35
1.95
84704229--84704357
40
3.2
40
85
4
127
24
15
24
35
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770