Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  538  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
167308262--167308425
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
167308262--167308459
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
167313621--167313659
19
2.1
19
95
4
71
25
12
28
33
1.93
167323372--167323805
119
3.6
119
91
0
645
32
19
19
28
1.96
167323733--167323914
83
2.2
83
89
0
274
32
17
18
31
1.94
167325739--167325786
18
2.6
19
80
12
55
25
2
6
66
1.26
167326963--167327003
21
1.9
22
85
5
57
26
21
7
43
1.79
167327806--167327881
40
1.9
40
89
5
118
19
13
30
36
1.90
167333101--167333137
17
2.2
17
90
0
56
51
8
8
32
1.61
167333727--167333846
46
2.5
48
82
4
136
31
20
23
25
1.98
167339220--167339300
21
4.0
20
81
9
83
64
4
4
25
1.34
167339240--167339300
3
20.0
3
79
3
68
65
3
3
27
1.24
167339422--167339496
4
18.5
4
77
8
71
70
4
4
21
1.20
167339442--167339511
25
2.8
25
84
6
88
70
5
4
20
1.26
167339423--167339495
37
2.0
37
83
5
94
69
4
4
21
1.22
167341134--167341172
12
3.2
12
88
3
51
38
15
15
30
1.88
167342265--167342324
15
4.1
15
74
8
61
50
5
13
31
1.63
167342375--167342405
3
10.3
3
92
0
53
64
0
0
35
0.94
167342608--167342726
47
2.5
47
71
14
111
57
3
4
35
1.35
167343348--167343412
3
21.3
3
93
3
112
64
0
3
32
1.09
167345047--167345222
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
167345044--167345215
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
167352619--167352794
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
167352616--167352787
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
167356366--167356568
24
8.6
24
92
4
306
20
18
25
35
1.95
167364105--167364311
24
8.6
24
95
0
324
20
18
25
35
1.96
167366095--167366572
44
10.9
44
87
2
593
26
30
15
26
1.96
167368755--167368861
37
2.9
37
90
2
162
27
32
17
22
1.96
167369014--167369110
50
1.9
50
89
4
151
28
25
8
37
1.85
167369068--167369260
47
4.1
47
88
2
237
27
28
10
33
1.90
167381500--167381525
9
2.9
9
100
0
52
42
0
0
57
0.98
167382180--167382497
131
2.4
130
83
2
361
33
18
19
28
1.96
167382280--167382533
131
1.9
130
91
0
418
32
18
19
29
1.95
167388884--167388965
29
2.8
29
98
0
155
29
14
30
25
1.95
167396111--167396192
29
2.8
29
98
0
155
29
14
30
25
1.95
167409957--167410120
40
4.1
40
80
6
188
25
21
28
25
1.99
167412559--167412731
46
3.7
46
76
10
181
30
26
20
23
1.98
167412564--167412734
93
1.8
93
89
0
270
29
27
20
22
1.99
167416448--167416502
15
3.7
15
82
7
76
10
14
12
61
1.56
167416444--167416502
30
2.0
30
90
6
93
10
13
16
59
1.61
167420523--167420633
28
4.0
28
79
12
113
28
16
30
24
1.96
167426435--167426547
27
4.2
27
88
3
149
19
25
21
33
1.97
167426434--167426543
55
2.0
55
87
5
161
20
25
20
34
1.96
167433090--167433240
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
167441064--167441211
39
3.8
40
76
14
139
26
24
27
21
1.99
167441065--167441211
78
1.9
78
83
8
192
26
24
27
21
1.99
167448374--167448557
40
4.6
40
78
4
147
22
24
29
23
1.99
167450930--167451269
47
7.3
47
87
7
480
29
30
7
31
1.86
167450980--167451058
25
3.3
25
66
16
67
31
30
5
32
1.79
167451115--167451247
41
3.1
40
79
19
160
30
30
7
31
1.85
167450972--167451247
88
3.1
88
88
9
430
29
31
7
31
1.86
167455378--167455564
40
4.7
40
91
0
295
24
27
21
26
1.99
167457719--167457797
25
3.3
25
66
16
67
31
30
5
32
1.79
167457669--167457971
49
6.3
49
93
3
474
29
31
8
31
1.86
167469275--167469317
15
2.9
14
83
10
50
65
11
20
2
1.36
167470461--167470507
8
5.9
8
82
9
51
61
0
0
38
0.96
167472043--167472214
93
1.8
93
89
0
272
22
20
29
28
1.98
167472044--167472221
46
3.8
46
76
7
180
21
20
28
29
1.98
167478108--167478284
40
4.5
40
86
4
218
23
23
27
24
2.00
167490873--167491080
9
22.6
9
72
10
116
37
1
12
47
1.51
167490873--167491111
62
3.9
63
75
7
222
38
1
12
47
1.51
167490873--167491080
18
11.3
18
73
10
134
37
1
12
47
1.51
167490849--167491052
105
1.9
105
86
3
286
38
0
12
48
1.48
167490873--167491084
27
8.0
27
72
12
143
38
1
12
47
1.51
167491185--167491240
15
3.8
15
78
21
73
53
0
0
46
1.00
167491417--167491466
24
2.1
23
92
3
82
48
12
14
26
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
167491548--167492828
371
3.5
371
99
0
2503
39
10
14
36
1.80
167493858--167493897
21
1.9
21
94
0
71
47
12
10
30
1.74
167495897--167496171
134
2.1
134
93
1
471
50
18
10
20
1.75
167499027--167499087
14
4.4
13
78
12
50
45
31
1
21
1.61
167499060--167499094
15
2.3
15
90
0
52
42
37
0
20
1.52
167499528--167499821
113
2.6
114
80
5
299
27
21
19
31
1.97
167499607--167499891
113
2.5
110
78
9
274
28
21
18
31
1.97
167499866--167499963
41
2.4
41
87
1
135
27
23
23
25
2.00
167505563--167505648
2
44.0
2
76
9
70
41
3
2
52
1.31
167505800--167505856
3
19.0
3
96
0
105
33
1
0
64
1.04
167506678--167506711
16
2.1
17
88
5
52
55
8
11
23
1.63
167507284--167507381
42
2.3
43
80
18
114
65
2
5
27
1.25
167507349--167507412
33
1.9
32
84
9
83
64
4
4
26
1.33
167507480--167507538
3
19.0
3
74
19
50
61
3
1
33
1.23
167507480--167507538
7
9.5
6
72
20
50
61
3
1
33
1.23
167507460--167507542
36
2.4
34
80
9
98
59
2
3
34
1.28
167507460--167507538
16
4.6
16
77
16
70
60
2
3
32
1.28
167507461--167507547
16
5.1
17
73
20
67
59
2
2
35
1.22
167509168--167509303
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
167510773--167510825
26
2.0
27
82
7
65
35
24
15
24
1.94
167511072--167511358
137
2.1
137
98
0
556
24
19
25
31
1.98
167515036--167515171
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
167516641--167516692
25
2.0
26
82
10
63
36
23
15
25
1.93
167516940--167517226
137
2.1
137
98
0
556
24
19
25
31
1.98
167518397--167518701
131
2.3
131
84
2
371
27
19
19
33
1.96
167519446--167519499
26
2.1
26
96
0
99
29
18
16
35
1.93
167519990--167520035
23
2.0
24
91
4
76
45
13
6
34
1.69
167523765--167523829
32
2.0
32
96
0
121
32
6
23
38
1.79
167525608--167525889
134
2.1
135
96
2
523
25
18
24
31
1.97
167528387--167528427
21
1.9
22
85
5
57
34
46
2
17
1.61
167530407--167530512
24
4.4
24
92
5
178
28
21
20
29
1.98
167530567--167530617
9
5.4
9
77
9
57
37
21
7
33
1.82
167530559--167530623
20
3.3
20
85
8
98
33
21
10
33
1.88
167530565--167530622
18
3.1
18
87
5
80
34
22
10
32
1.88
167530568--167530629
18
3.3
18
81
4
70
35
20
8
35
1.83
167530660--167530707
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
167533115--167540131
534
13.1
540
95
3
12482
36
18
11
33
1.86
167537144--167537201
30
2.0
30
90
9
95
41
20
10
27
1.85
167541058--167541172
55
2.1
56
82
8
137
34
22
24
18
1.96
167541083--167541172
27
3.2
27
81
7
101
32
24
24
18
1.97
167541278--167541342
28
2.3
28
86
5
87
30
7
26
35
1.84
167542350--167542382
12
2.6
13
85
9
50
45
0
45
9
1.35
167544856--167545021
24
7.0
24
88
4
230
25
21
23
28
1.99
167544855--167545021
47
3.5
48
87
4
232
25
21
23
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
167544856--167545022
71
2.3
71
90
3
255
25
21
23
28
1.99
167545079--167545135
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
167545067--167545137
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
167545072--167545126
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
167545174--167545221
25
2.0
24
83
4
60
25
18
25
31
1.98
167548774--167548939
24
7.0
24
88
4
239
26
21
22
28
1.99
167548773--167548939
47
3.5
48
89
4
241
26
21
22
29
1.99
167548774--167548940
71
2.3
71
91
3
264
26
21
23
28
1.99
167548997--167549053
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
167548985--167549055
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770