Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  313  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95588188--95588218
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
95588185--95588224
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
95588457--95588664
55
3.8
54
81
6
233
21
26
17
34
1.96
95588455--95588654
108
1.8
110
88
4
307
22
26
18
34
1.96
95588410--95588664
55
4.8
52
79
8
223
20
25
17
36
1.94
95589071--95589325
55
4.8
54
77
10
242
21
25
16
36
1.94
95588390--95590369
662
3.0
662
97
0
3710
29
22
12
36
1.91
95589733--95589987
55
4.8
54
74
10
215
22
24
16
36
1.94
95594232--95594439
40
5.2
39
84
1
218
25
25
22
25
2.00
95594232--95594437
80
2.6
81
84
3
247
25
26
22
25
2.00
95600802--95600950
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
95600843--95600950
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
95606097--95606168
29
2.5
28
88
6
101
30
16
26
26
1.97
95615784--95615848
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
95615949--95615983
2
17.5
2
93
0
61
45
0
2
51
1.16
95623429--95623493
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
95623594--95623628
2
17.5
2
93
0
61
45
0
2
51
1.16
95624999--95625149
80
1.9
80
83
5
198
22
26
23
27
2.00
95624999--95625149
40
3.8
40
82
6
164
22
26
23
27
2.00
95627406--95627507
43
2.4
44
82
12
108
30
13
23
32
1.93
95627802--95627843
18
2.3
18
95
0
75
26
16
21
35
1.94
95629269--95629318
16
3.1
16
88
0
73
30
2
28
40
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95629711--95629740
14
2.2
13
94
5
51
76
0
20
3
0.92
95631073--95631123
20
2.5
20
84
6
59
27
27
15
29
1.96
95633740--95633880
6
22.3
6
73
18
67
73
2
17
7
1.18
95633720--95633778
20
3.2
18
77
22
52
71
0
18
10
1.14
95633740--95633798
13
4.5
13
78
18
61
76
0
16
6
1.00
95633744--95633880
20
6.8
20
69
17
79
72
2
16
7
1.19
95633847--95633880
17
1.9
17
88
5
50
73
0
14
11
1.10
95635840--95635901
22
2.8
22
80
0
70
16
22
25
35
1.94
95635865--95635907
22
2.0
22
95
0
77
11
30
27
30
1.92
95642353--95642561
55
3.9
53
79
6
213
34
14
25
24
1.94
95642361--95642560
108
1.8
110
86
4
289
34
15
26
24
1.95
95648395--95648442
11
4.6
11
80
12
57
35
12
18
33
1.89
95654730--95654826
30
3.2
30
72
2
97
26
27
14
30
1.95
95660900--95660976
39
2.0
39
89
0
118
28
25
19
25
1.99
95666418--95666543
46
2.7
46
92
0
207
30
26
21
21
1.98
95666420--95666562
46
3.1
45
85
4
128
29
27
20
21
1.98
95666965--95667024
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
95672047--95672190
39
3.7
39
90
0
234
27
28
20
23
1.99
95672033--95672197
78
2.1
78
89
0
249
28
27
19
24
1.99
95676560--95676616
30
2.0
28
86
6
78
14
29
3
52
1.58
95677672--95677776
10
10.0
10
72
18
54
19
4
7
68
1.32
95677695--95677784
22
4.1
22
73
9
60
20
4
8
66
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95677705--95677784
22
3.6
22
79
3
81
20
3
8
67
1.33
95677682--95677781
33
3.1
32
84
8
114
21
4
9
66
1.37
95678906--95679040
67
2.1
65
81
13
154
41
15
8
34
1.78
95682671--95682850
40
4.5
40
90
1
245
26
26
22
25
2.00
95682671--95682850
79
2.3
80
87
0
245
26
26
22
25
2.00
95682671--95682893
40
5.6
39
80
7
175
26
26
22
25
2.00
95687192--95687302
27
4.1
27
82
5
118
38
19
23
18
1.93
95687192--95687302
54
2.1
53
82
1
132
38
19
23
18
1.93
95688701--95688778
26
3.1
26
85
7
115
21
42
2
33
1.67
95688703--95688775
24
3.0
24
89
4
101
23
41
2
32
1.69
95691397--95691525
40
3.2
40
83
6
154
24
22
27
25
2.00
95702147--95702248
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
95716365--95716527
70
2.3
71
98
1
319
19
28
17
35
1.94
95726318--95726382
32
2.0
32
100
0
130
38
21
18
21
1.93
95726737--95726765
12
2.3
13
94
5
51
24
17
6
51
1.69
95727729--95727781
27
1.9
28
88
3
81
20
28
18
32
1.97
95727762--95727826
34
1.9
33
84
3
85
26
24
23
26
2.00
95743317--95743524
53
3.9
53
79
2
236
37
18
24
20
1.94
95748356--95748605
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
95756529--95756778
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
95762880--95762950
35
2.0
35
97
0
133
33
12
16
36
1.87
95769780--95769814
18
1.9
18
94
0
61
34
14
22
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95773919--95774100
78
2.3
81
84
6
239
25
27
22
24
2.00
95773917--95774100
40
4.7
40
83
8
234
26
27
22
23
2.00
95778484--95778649
43
3.8
43
78
6
176
22
18
26
32
1.97
95778473--95778642
86
2.0
86
85
5
229
22
18
26
32
1.97
95804273--95804442
41
4.2
40
74
18
161
27
27
22
22
1.99
95812618--95812787
41
4.2
40
74
18
161
27
27
22
22
1.99
95819384--95819667
48
6.1
49
86
10
400
31
29
7
32
1.84
95819386--95819655
139
1.9
137
93
5
461
31
29
7
31
1.85
95822668--95822851
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
95822708--95822896
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
95830366--95830549
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
95830406--95830594
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
95832789--95833286
40
12.8
40
91
5
786
27
26
19
26
1.99
95832867--95832923
28
2.0
28
100
0
114
26
24
21
28
1.99
95835172--95835258
37
2.3
36
90
5
129
27
34
18
19
1.95
95835327--95835628
49
6.1
49
94
2
516
29
26
9
34
1.88
95849326--95849624
49
6.3
49
90
8
478
33
8
28
30
1.86
95849480--95849547
22
3.3
22
63
32
60
29
11
29
29
1.92
95849473--95849602
39
3.1
39
80
19
170
30
9
28
31
1.88
95849424--95849602
88
2.0
88
97
0
340
31
8
29
30
1.88
95850639--95850717
39
2.0
39
100
0
158
44
7
15
32
1.74
95856226--95856355
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95864285--95864414
40
3.3
39
83
4
163
23
25
28
23
1.99
95875565--95875634
27
2.5
28
97
2
133
28
12
27
31
1.93
95888613--95888730
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
95888581--95888744
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
95893621--95893690
27
2.5
28
97
2
133
28
12
27
31
1.93
95897100--95897331
126
1.8
126
93
0
401
26
28
21
23
1.99
95899648--95899673
11
2.4
11
100
0
52
30
23
15
30
1.95
95901802--95901831
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
95908719--95908830
27
4.2
26
84
7
134
37
23
23
16
1.93
95908719--95908830
54
2.1
54
86
3
154
37
23
23
16
1.93
95910072--95910113
22
1.9
22
85
0
57
66
2
23
7
1.28
95914054--95914348
47
6.3
47
91
0
455
27
28
8
35
1.85
95924771--95924873
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
95932510--95932570
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
95932620--95932691
24
3.0
24
79
6
83
27
20
22
29
1.99
95932883--95932946
31
2.1
31
87
0
92
35
17
23
23
1.95
95937619--95937942
49
6.5
49
91
3
513
34
9
26
29
1.88
95937619--95937942
102
3.2
100
96
2
589
34
9
26
29
1.88
95937619--95937942
151
2.2
149
92
3
535
34
9
26
29
1.88
95937991--95938077
37
2.3
36
94
5
147
20
19
33
26
1.97
95944003--95944036
8
4.1
8
96
3
59
61
23
0
14
1.33
95949572--95949626
21
2.5
22
85
2
67
20
30
30
18
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95952172--95952236
28
2.3
28
86
0
85
35
27
6
30
1.81
95952340--95952429
27
3.2
28
81
7
112
18
24
24
32
1.97
95952350--95952440
27
3.2
28
81
4
94
20
26
20
31
1.98
95952340--95952454
55
2.1
56
82
8
137
18
24
22
34
1.96
95952888--95952926
19
2.1
19
85
0
51
15
5
7
71
1.26
95956695--95956875
40
4.6
40
80
9
201
26
27
21
24
1.99
95956697--95956875
78
2.3
80
82
6
222
26
27
21
24
1.99
95963312--95963376
28
2.3
28
91
0
103
32
27
9
30
1.88
95963482--95963571
27
3.2
27
82
4
99
18
24
24
32
1.97
95963492--95963582
27
3.2
28
79
4
76
20
26
20
31
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770