Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  345  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105914683--105914863
46
3.9
46
80
9
224
28
29
20
20
1.98
105918515--105918617
34
3.1
33
79
6
84
28
20
23
28
1.99
105920059--105920156
19
5.2
19
91
7
155
37
11
15
35
1.83
105920049--105920156
36
2.9
37
86
10
116
37
11
14
36
1.82
105920078--105920134
17
3.5
15
84
15
53
38
10
15
35
1.82
105920059--105920173
19
5.9
21
89
7
124
36
11
15
36
1.84
105925763--105925813
11
4.3
12
77
18
54
82
0
17
0
0.67
105925773--105925820
16
3.1
15
82
11
53
81
0
18
0
0.70
105925773--105925806
17
2.1
16
94
5
59
85
0
14
0
0.60
105925766--105925820
7
7.7
7
75
18
51
80
0
20
0
0.72
105926674--105927167
44
11.2
44
75
7
387
31
17
24
27
1.97
105926674--105927028
175
2.0
175
90
2
561
31
16
24
27
1.96
105926679--105927152
132
3.6
131
86
3
571
31
17
24
27
1.97
105927114--105927841
205
3.5
206
92
0
1172
30
18
22
28
1.97
105928242--105928301
17
3.2
19
86
13
88
38
10
16
35
1.82
105931194--105931228
16
2.1
17
89
5
54
74
11
0
14
1.08
105936038--105936078
18
2.3
18
84
12
50
39
0
4
56
1.21
105936247--105936314
6
11.3
6
79
4
57
45
1
4
48
1.31
105936384--105936417
18
1.9
18
88
5
52
38
0
2
58
1.13
105937877--105937910
10
3.3
10
88
8
50
32
0
2
64
1.08
105943802--105943865
31
2.1
31
84
0
83
25
20
15
39
1.92
105944059--105944296
24
10.0
24
90
3
356
26
21
23
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105944354--105944410
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
105944350--105944412
20
3.2
20
95
0
117
31
19
12
36
1.89
105944449--105944496
25
1.9
25
82
0
60
25
14
25
35
1.94
105945652--105945744
27
3.5
26
88
7
125
20
24
20
34
1.96
105945796--105946024
27
8.4
27
76
6
131
32
9
19
38
1.83
105945802--105946024
53
4.1
54
78
9
168
31
8
19
39
1.82
105946001--105946212
27
7.9
27
84
8
227
39
8
23
28
1.84
105946003--105946212
81
2.6
81
84
3
264
39
8
23
28
1.84
105946218--105946306
27
3.3
26
85
6
108
32
10
16
40
1.82
105946218--105946321
27
3.9
27
75
12
90
34
9
16
39
1.81
105949323--105949488
24
7.0
24
88
4
239
26
21
22
28
1.99
105949322--105949488
47
3.5
48
89
4
241
26
21
22
29
1.99
105949323--105949488
71
2.3
71
91
3
262
26
21
22
28
1.99
105949546--105949602
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
105949542--105949604
20
3.2
20
95
0
117
31
19
12
36
1.89
105949641--105949688
25
1.9
25
82
0
60
25
14
25
35
1.94
105950846--105950929
27
3.1
27
89
3
116
20
23
22
33
1.97
105950846--105950939
27
3.5
26
85
7
109
20
23
20
36
1.95
105950990--105951040
27
1.9
27
84
11
70
37
11
9
41
1.75
105951079--105951218
54
2.6
54
79
4
165
32
7
20
40
1.81
105950998--105951271
27
10.1
27
77
7
146
34
8
18
38
1.81
105951198--105951406
27
7.8
27
86
4
228
39
9
22
28
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
105951197--105951406
54
3.9
54
83
5
255
39
9
22
28
1.85
105951412--105951501
27
3.3
27
82
11
105
34
10
15
40
1.81
105953621--105953717
45
2.2
44
87
10
139
30
3
15
50
1.59
105957943--105958000
28
2.1
28
100
0
116
24
10
17
48
1.78
105960374--105960540
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
105968355--105968521
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
105971446--105971596
40
3.8
40
80
6
164
26
23
27
23
2.00
105971483--105971612
40
3.2
40
82
2
163
23
23
27
25
2.00
105979410--105979560
40
3.8
40
80
6
164
26
23
27
23
2.00
105979447--105979576
40
3.2
40
82
2
163
23
23
27
25
2.00
106003149--106003304
56
2.8
54
83
5
161
30
33
15
21
1.94
106010048--106010265
40
5.5
40
91
2
298
26
28
22
22
1.99
106012225--106012273
18
2.7
18
90
0
80
22
16
18
42
1.88
106018802--106018849
23
2.1
23
100
0
96
58
4
8
29
1.46
106021406--106021581
46
3.8
46
77
12
198
20
19
29
30
1.97
106021403--106021574
93
1.8
93
96
0
317
20
20
29
29
1.98
106028843--106029018
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
106028840--106029011
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
106032720--106032776
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
106032718--106032788
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
106032729--106032783
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
106032834--106033021
23
8.0
23
89
5
263
28
21
21
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106041408--106041624
40
5.5
39
79
6
186
25
20
27
27
1.99
106045133--106045563
49
8.9
49
94
2
755
34
9
27
29
1.87
106045555--106045706
48
3.2
48
98
0
286
33
5
28
32
1.81
106045689--106045891
100
2.0
100
99
0
397
29
14
26
29
1.95
106045846--106045936
37
2.4
37
94
1
155
24
18
31
25
1.97
106047935--106047991
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
106047933--106048003
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
106047944--106047998
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90
106048047--106048258
24
9.0
24
89
4
301
26
23
21
28
1.99
106048049--106048237
23
8.1
23
91
3
290
26
23
21
28
1.99
106048048--106048237
70
2.7
70
91
4
294
27
23
21
28
1.99
106050320--106050427
38
2.8
38
94
1
189
23
22
14
39
1.91
106050343--106050444
31
3.1
31
88
9
132
23
21
15
39
1.92
106050636--106050707
24
3.0
24
84
10
85
26
25
20
27
1.99
106050758--106050817
20
3.0
20
90
0
102
31
20
11
36
1.88
106050860--106050907
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
106058614--106058721
38
2.8
38
94
1
189
23
22
14
39
1.91
106058637--106058737
38
3.1
31
87
11
123
23
21
14
39
1.91
106058675--106058737
31
2.1
31
93
3
110
23
22
14
39
1.91
106058929--106059000
24
3.0
24
84
10
85
26
25
20
27
1.99
106059049--106059106
18
3.0
20
85
10
93
32
18
10
37
1.85
106059149--106059196
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106067831--106067881
24
2.0
26
82
14
63
35
13
13
37
1.85
106069448--106069549
28
3.6
28
75
7
100
28
16
31
23
1.96
106069459--106069609
56
2.7
55
82
8
180
27
15
31
25
1.96
106069652--106069750
32
3.1
32
88
0
126
40
10
20
29
1.85
106072333--106072377
23
2.0
23
82
8
56
17
26
31
24
1.97
106073107--106073140
17
2.0
17
94
0
59
64
20
5
8
1.43
106074264--106074312
25
2.0
26
84
8
66
24
16
20
38
1.92
106075798--106075903
25
4.2
26
89
3
162
36
22
6
33
1.80
106075798--106075903
51
2.1
51
91
3
169
36
22
6
33
1.80
106077486--106077525
19
2.0
22
85
14
59
32
47
2
17
1.61
106077587--106077726
27
5.2
28
90
5
184
35
22
24
17
1.96
106078115--106078144
16
1.9
15
93
6
51
3
20
23
53
1.60
106079314--106079449
26
5.2
26
94
0
236
36
25
5
33
1.78
106079786--106079825
15
2.7
15
84
0
53
67
22
10
0
1.20
106084576--106084619
21
2.1
21
83
8
54
56
0
2
40
1.11
106087561--106087634
28
2.6
27
77
10
67
58
2
8
31
1.41
106091674--106091807
26
5.2
26
88
0
214
34
5
23
35
1.80
106091674--106091807
52
2.6
52
97
0
250
34
5
23
35
1.80
106093593--106093876
137
2.1
137
97
0
532
25
17
25
32
1.97
106094672--106094713
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
106094717--106094781
31
2.1
30
83
13
80
26
12
4
56
1.55
106097969--106097993
7
3.6
7
100
0
50
72
0
16
12
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
106099705--106099747
2
20.5
2
90
9
68
46
0
4
48
1.22
106107993--106108044
25
2.0
26
85
10
72
25
11
23
40
1.88
106109523--106109578
26
2.2
26
100
0
112
35
26
7
30
1.83
106111222--106111273
8
6.5
8
82
8
61
63
1
1
32
1.16
106111221--106111277
24
2.4
24
82
8
80
63
1
3
31
1.22
106111426--106111490
25
2.8
24
83
6
80
52
6
7
33
1.55
106111479--106111542
32
2.0
31
84
3
83
56
3
4
35
1.36
106111509--106111567
25
2.4
25
79
0
64
59
1
5
33
1.29
106111607--106111652
25
1.9
25
86
8
69
60
0
4
34
1.16
106111718--106111787
33
2.1
33
94
0
122
15
47
32
4
1.65

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770