Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  479  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147909661--147909824
40
4.1
40
80
6
188
25
21
28
25
1.99
147914675--147914882
40
5.2
39
81
1
200
25
26
23
25
2.00
147914675--147914881
80
2.6
80
82
5
231
25
26
23
25
2.00
147918673--147918741
27
2.5
28
90
2
104
28
14
27
28
1.95
147924274--147924437
40
4.1
40
80
6
188
25
21
28
25
1.99
147931960--147932054
29
3.3
29
74
14
81
27
14
31
26
1.95
147931981--147932055
29
2.6
29
87
8
100
28
16
30
25
1.96
147941238--147941432
40
4.8
40
80
6
189
24
22
27
26
2.00
147941238--147941444
80
2.6
80
79
9
242
23
23
27
26
2.00
147945130--147945598
49
9.5
49
93
1
767
29
27
9
33
1.88
147945130--147945598
198
2.4
198
93
0
816
29
27
9
33
1.88
147953851--147954014
40
4.1
40
80
6
188
25
21
28
25
1.99
147960961--147961144
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
147969035--147969135
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
147969035--147969217
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
147973044--147973192
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
147973085--147973192
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
147981161--147981309
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
147981202--147981309
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
147986924--147987086
71
2.3
71
98
1
319
19
28
17
34
1.94
147986924--147987120
71
2.8
70
90
4
258
20
28
17
33
1.95
147991946--147992091
40
3.7
40
83
0
166
23
27
21
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
147991978--147992129
40
3.8
40
83
3
162
22
26
22
28
1.99
147997160--147997775
47
13.4
47
84
9
741
32
8
30
28
1.86
147997215--147997290
22
3.3
22
66
16
64
31
10
28
28
1.90
147997160--147997775
94
6.7
94
89
4
916
32
8
30
28
1.86
147997160--147997775
141
4.5
141
87
5
898
32
8
30
28
1.86
147997481--147997536
16
3.4
16
68
18
51
32
3
30
33
1.75
147997466--147997535
34
2.1
34
100
0
140
28
5
32
32
1.81
147997278--147997723
222
2.0
222
92
0
748
31
8
30
28
1.86
147997231--147997770
269
2.0
269
91
0
882
32
8
30
28
1.86
148000245--148000318
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
148000302--148000377
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
148000245--148000377
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
148008120--148008193
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
148008177--148008252
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
148008120--148008252
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
148011937--148012112
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
148011933--148012104
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
148015024--148015092
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
148015015--148015102
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
148017480--148017655
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
148017476--148017647
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
148019277--148019343
33
2.0
33
88
5
100
31
20
19
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148026741--148026948
40
5.2
39
82
3
202
25
25
23
25
2.00
148026741--148026946
80
2.6
81
82
4
231
25
26
23
24
2.00
148037459--148037633
48
3.6
48
82
1
181
29
30
16
24
1.96
148040918--148041090
49
3.5
50
86
3
226
23
26
19
30
1.98
148041841--148041891
20
2.7
18
82
14
59
37
21
0
41
1.54
148043818--148044132
47
6.7
47
93
0
504
28
30
8
32
1.86
148043868--148044165
141
2.1
137
87
6
395
32
28
7
32
1.85
148049223--148049291
27
2.5
28
90
2
104
28
28
14
27
1.95
148050629--148050666
20
2.1
18
85
14
51
10
15
0
73
1.09
148056999--148057147
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
148057040--148057147
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
148063464--148063573
39
2.8
38
88
4
148
21
29
23
25
1.99
148071547--148071657
40
2.8
40
88
0
159
21
28
23
26
1.99
148072763--148072865
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
148084240--148084342
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
148097249--148097278
14
2.1
15
93
6
53
13
10
13
63
1.52
148105897--148106020
22
5.6
23
71
17
93
39
18
19
22
1.92
148115052--148115280
38
6.1
39
87
8
348
20
24
30
24
1.99
148118617--148118955
123
2.8
123
96
0
606
30
10
25
33
1.90
148118924--148119167
40
6.1
40
88
1
301
24
21
26
27
1.99
148123371--148123828
47
9.7
47
88
0
607
27
29
9
32
1.89
148123681--148123756
22
3.3
22
67
22
66
25
28
13
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148126316--148126356
20
2.0
20
85
9
55
46
17
7
29
1.74
148130386--148130429
21
2.1
21
100
0
88
50
20
9
20
1.75
148134332--148134449
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
148134300--148134463
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
148144402--148144536
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
148144348--148144537
58
3.3
58
77
4
179
24
33
16
26
1.96
148152370--148152504
29
4.7
29
86
3
155
23
31
15
29
1.95
148152316--148152505
58
3.3
58
77
4
179
24
33
16
26
1.96
148156797--148156866
27
2.6
27
88
4
97
24
28
14
32
1.94
148171905--148172067
39
4.2
39
91
0
245
23
20
31
24
1.98
148179249--148179416
29
5.8
29
90
0
257
25
15
30
27
1.96
148185464--148185578
29
4.0
29
82
8
121
29
29
13
26
1.95
148185834--148185871
16
2.4
16
86
0
58
10
18
21
50
1.76
148190064--148190273
40
5.3
41
85
4
236
23
22
27
26
2.00
148192917--148193028
43
2.6
43
74
5
118
32
25
14
27
1.95
148195443--148195599
42
3.9
41
79
6
167
33
25
13
27
1.93
148207194--148207377
40
4.6
40
82
4
174
28
22
26
23
1.99
148217672--148217921
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
148225845--148226094
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
148228822--148228893
29
2.5
29
91
6
112
30
13
26
29
1.94
148235145--148235214
27
2.5
28
97
2
133
28
12
27
31
1.93
148240702--148240788
24
3.6
24
96
0
165
21
17
25
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148240702--148240810
48
2.3
48
91
3
175
24
17
23
33
1.96
148240702--148240810
24
4.5
24
90
2
157
24
17
23
33
1.96
148248373--148248459
24
3.6
24
95
0
156
21
16
25
36
1.94
148248373--148248481
24
4.5
24
89
2
148
24
16
23
34
1.95
148248373--148248481
48
2.3
48
90
3
166
24
16
23
34
1.95
148253646--148253715
27
2.5
28
97
2
133
28
12
27
31
1.93
148257408--148257550
39
3.7
39
90
2
234
22
30
20
26
1.99
148257368--148257549
77
2.3
79
89
2
269
23
29
22
24
1.99
148263470--148263498
13
2.2
13
100
0
58
6
37
31
24
1.82
148265388--148265530
39
3.7
39
90
2
234
22
30
20
26
1.99
148265348--148265529
77
2.3
79
89
2
269
23
29
22
24
1.99
148274758--148274926
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
148281012--148281037
12
2.2
12
100
0
52
19
7
42
30
1.79
148287040--148287211
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
148287032--148287207
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
148289591--148289679
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
148289591--148289670
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
148289602--148289679
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
148292566--148292737
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
148292558--148292733
46
3.8
46
80
12
225
28
28
21
21
1.98
148297666--148297913
27
9.2
27
86
0
334
32
19
22
25
1.97
148298056--148298142
27
3.2
27
80
0
84
20
20
20
37
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
148298224--148298269
21
2.1
22
88
4
67
6
4
52
36
1.47
148298347--148298455
33
3.3
33
89
0
164
29
20
25
24
1.99
148306466--148306525
30
2.0
30
90
0
93
38
8
25
28
1.84
148306999--148307126
46
2.8
46
95
0
229
20
23
28
27
1.99
148310107--148310264
39
4.1
39
95
0
280
26
22
24
25
2.00
148312636--148312661
13
2.0
13
100
0
52
15
0
30
53
1.42
148318469--148318586
23
5.1
23
94
5
204
29
21
19
29
1.97
148318643--148318699
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
148318631--148318701
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
148318636--148318690
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770