Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  270  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81428272--81428404
50
2.7
50
87
3
189
29
27
16
26
1.97
81434854--81435032
40
4.5
39
92
4
277
27
27
21
22
1.99
81447021--81447248
40
5.7
40
85
4
264
25
28
22
23
2.00
81447021--81447205
79
2.3
80
88
0
264
25
28
23
22
1.99
81449964--81450049
43
2.0
43
90
0
136
33
22
12
31
1.91
81456333--81456449
43
2.7
43
87
0
162
35
25
14
24
1.94
81458317--81458492
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
81458313--81458484
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
81461444--81461512
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
81461435--81461522
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
81463902--81464077
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
81463898--81464069
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
81467804--81467963
29
5.5
29
82
4
180
25
31
16
26
1.97
81475970--81476129
29
5.5
29
82
4
180
25
30
17
26
1.97
81477964--81478171
40
5.2
39
78
3
175
26
25
22
25
2.00
81477967--81478164
80
2.5
80
80
4
195
27
24
21
26
1.99
81484191--81484369
49
3.6
49
88
0
250
30
26
17
26
1.97
81484191--81484369
99
1.8
98
87
1
268
30
26
17
26
1.97
81484354--81484396
20
2.2
20
100
0
86
34
27
16
20
1.94
81488722--81488925
48
4.2
48
91
1
320
25
30
18
24
1.98
81494845--81494922
37
2.1
37
100
0
156
20
32
19
28
1.97
81495025--81495147
49
2.5
49
95
0
219
29
33
10
26
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81498249--81498347
41
2.4
41
80
11
114
24
24
25
26
2.00
81498831--81499313
29
16.7
29
96
1
826
24
33
17
25
1.96
81501325--81501402
37
2.1
37
100
0
156
20
32
19
28
1.97
81501505--81501627
49
2.5
49
95
0
219
29
33
10
26
1.90
81517263--81517309
22
2.1
22
92
7
78
48
21
0
29
1.50
81517065--81517406
27
12.8
27
83
3
370
40
22
11
25
1.88
81518859--81519041
40
4.6
40
82
3
233
25
24
22
26
2.00
81520768--81520793
10
2.6
10
100
0
52
11
34
34
19
1.88
81520951--81521041
47
1.9
47
88
0
137
25
29
18
26
1.98
81524994--81525120
47
2.7
45
78
13
134
29
18
29
23
1.97
81526121--81526314
85
2.3
85
90
1
291
20
18
32
27
1.96
81533191--81533588
49
8.2
49
97
0
728
33
8
27
30
1.86
81533580--81533779
48
4.2
47
85
5
258
35
6
26
32
1.81
81533580--81533779
96
2.1
96
90
1
312
35
6
26
32
1.81
81533819--81533909
37
2.4
37
96
1
164
23
18
32
25
1.97
81538122--81538359
49
4.8
50
80
7
270
26
17
27
28
1.97
81538219--81538302
28
3.2
28
64
25
74
22
15
32
29
1.95
81540435--81540587
46
3.3
46
74
8
139
29
18
29
22
1.97
81542448--81542564
43
2.7
43
90
3
193
32
25
16
25
1.96
81546564--81546735
93
1.8
93
91
0
281
27
29
20
22
1.99
81546556--81546731
46
3.8
46
79
7
194
28
28
20
22
1.98
81546607--81546750
46
3.1
47
73
16
129
30
27
19
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81550071--81550181
27
4.1
26
86
4
132
20
22
20
36
1.96
81558202--81558304
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
81565930--81566032
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
81568157--81568195
19
2.1
19
85
0
51
71
7
5
15
1.26
81568658--81568747
27
3.2
27
76
7
83
32
24
23
20
1.98
81571457--81571555
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
81575101--81575160
29
2.1
29
100
0
120
35
11
10
43
1.75
81578583--81578625
22
2.0
22
90
0
68
69
2
16
11
1.28
81578852--81578876
7
3.6
7
100
0
50
12
0
28
60
1.32
81579748--81579815
27
2.5
28
87
2
102
27
11
27
32
1.92
81582085--81582261
27
6.6
27
81
10
186
42
16
16
23
1.88
81582084--81582261
81
2.2
81
83
9
229
42
16
16
24
1.88
81582590--81582666
18
4.3
18
78
6
93
22
18
19
40
1.92
81582659--81582743
34
2.5
34
88
0
125
25
21
24
28
1.99
81585871--81586058
27
7.3
27
80
11
173
44
19
14
20
1.86
81585880--81585921
19
2.3
18
84
8
57
45
16
11
26
1.82
81586391--81586448
18
3.2
18
71
9
55
25
15
17
41
1.89
81586442--81586536
34
2.8
34
90
0
127
27
20
25
27
1.99
81592186--81592317
29
4.6
29
81
1
131
24
32
17
25
1.97
81599969--81600041
28
2.6
28
93
2
128
26
31
15
27
1.95
81599911--81600041
29
4.6
29
81
2
131
24
32
17
25
1.97
81605384--81605534
40
3.8
39
84
2
151
23
27
22
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81605384--81605534
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
26
2.00
81613327--81613493
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
81632649--81632741
44
2.1
46
84
8
120
36
25
4
33
1.76
81634821--81634864
13
3.4
13
78
12
54
50
4
6
38
1.50
81642122--81642195
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
81651962--81652082
39
3.1
39
95
0
215
20
25
31
22
1.98
81662683--81662895
107
2.0
108
95
0
383
42
8
5
43
1.58
81663726--81663763
19
2.0
19
89
0
58
52
0
2
44
1.14
81665026--81665170
27
5.3
27
77
4
121
28
25
12
33
1.92
81665039--81665159
27
4.4
27
79
1
125
31
26
12
29
1.93
81665026--81665159
55
2.4
55
80
3
153
29
26
12
31
1.93
81672811--81672955
37
3.9
37
88
0
218
25
33
17
23
1.97
81673013--81673863
48
17.7
48
93
0
1342
31
27
6
34
1.83
81676597--81676630
17
2.0
17
88
11
52
26
17
11
44
1.83
81690889--81691029
57
2.4
58
82
1
158
32
23
16
27
1.96
81690921--81691029
58
1.9
57
84
1
146
33
23
15
27
1.95
81695376--81695593
29
7.6
29
85
5
275
35
22
16
25
1.94
81695549--81695601
26
2.0
26
85
7
72
41
22
13
22
1.88
81695658--81695835
88
2.0
88
100
0
356
22
28
14
34
1.94
81702877--81702918
21
2.0
21
95
0
75
21
33
26
19
1.97
81704906--81704944
20
1.9
21
85
15
55
51
20
0
28
1.48
81709012--81709161
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81709036--81709219
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
81709357--81709427
35
2.0
35
100
0
142
25
8
33
32
1.86
81710337--81710373
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
81715732--81715782
19
2.8
17
81
18
59
43
1
11
43
1.52
81716921--81716972
19
2.7
19
96
0
95
23
26
25
25
2.00
81716833--81716972
38
3.7
38
69
4
104
20
22
25
31
1.98
81722313--81722521
29
7.3
29
75
10
153
27
16
24
31
1.96
81722313--81722522
59
3.7
58
76
9
148
28
16
24
31
1.96
81722362--81722521
28
5.7
27
72
12
108
28
16
25
29
1.97
81724868--81724987
39
3.1
39
84
5
154
29
20
25
25
1.99
81730699--81730859
29
5.6
29
93
0
259
26
31
14
27
1.95
81730670--81730859
58
3.3
58
89
0
263
25
32
15
26
1.95
81730670--81730859
87
2.2
87
87
0
263
25
32
15
26
1.95
81738785--81738904
29
3.7
34
89
9
134
26
30
13
29
1.94
81738821--81738904
29
2.9
29
100
0
168
27
32
14
26
1.95
81746270--81746333
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
81746525--81746643
47
2.5
48
86
8
154
26
22
21
28
1.99
81746525--81746643
24
5.0
24
85
9
154
26
22
21
28
1.99
81746689--81746773
20
4.2
20
95
0
143
32
21
11
34
1.89
81746694--81746768
11
7.4
11
68
17
63
30
20
13
36
1.91
81748283--81748416
40
3.3
40
85
0
160
23
27
22
26
1.99
81757963--81758144
40
4.6
39
78
6
125
26
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81757993--81758144
40
3.8
40
84
5
164
24
27
21
26
1.99
81760994--81761036
20
2.2
19
83
4
50
16
37
25
20
1.93
81772979--81773104
19
6.9
19
86
10
192
37
15
10
37
1.81
81772979--81773096
35
3.3
35
92
3
191
37
14
11
37
1.81
81773501--81774412
207
4.4
207
93
0
1504
29
23
17
29
1.97
81774423--81774870
85
5.3
85
88
7
666
24
22
23
30
1.99
81775816--81775856
7
5.7
7
86
13
57
0
14
0
85
0.60
81781541--81781658
35
3.3
35
91
3
182
35
14
12
37
1.84
81781541--81781674
54
2.5
54
85
8
186
35
14
12
37
1.84
81781541--81781666
19
6.9
19
84
10
183
35
15
11
37
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770