Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  386  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118891079--118891111
7
4.7
7
100
0
66
45
0
0
54
0.99
118892937--118892967
14
2.2
14
100
0
62
19
45
6
29
1.75
118893642--118893719
37
2.1
37
83
2
95
37
5
16
41
1.71
118895510--118895902
41
9.9
40
81
8
342
35
19
22
22
1.96
118895502--118895700
81
2.4
81
83
3
220
37
18
20
23
1.94
118895667--118895728
28
2.2
28
88
0
97
40
16
24
19
1.91
118895640--118895769
68
1.9
69
87
1
190
34
20
23
21
1.96
118895587--118895810
109
2.0
110
88
0
333
36
19
22
21
1.95
118895546--118895851
150
2.0
151
84
3
402
35
18
22
23
1.95
118895501--118895892
191
2.0
192
83
5
497
35
19
22
22
1.95
118896206--118896238
15
2.3
14
94
5
57
21
0
27
51
1.48
118896276--118896325
22
2.3
22
79
3
57
28
2
34
36
1.69
118896505--118896541
15
2.5
15
84
16
51
21
0
29
48
1.50
118897890--118897947
24
2.4
24
97
0
107
24
25
13
36
1.92
118901513--118901596
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
118904376--118904574
43
4.6
42
79
7
168
26
17
24
31
1.97
118906768--118906798
16
1.9
16
93
0
53
54
0
9
35
1.33
118923403--118923444
21
2.0
20
86
4
57
16
26
38
19
1.92
118924032--118924084
6
8.7
6
78
12
54
77
5
0
16
0.96
118927918--118927948
7
4.6
7
96
4
55
0
9
0
90
0.46
118927931--118927989
25
2.3
26
94
5
102
5
1
16
76
1.05
118928804--118928865
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118928889--118929050
88
1.8
88
85
2
227
35
19
17
26
1.94
118929014--118929478
76
5.9
79
74
14
262
32
18
17
30
1.94
118928637--118929403
249
3.1
242
83
8
894
35
19
17
28
1.94
118929084--118929393
168
1.9
166
84
6
421
32
19
19
29
1.96
118929223--118929573
75
4.7
75
87
3
442
32
18
17
31
1.94
118929223--118929573
151
2.4
147
85
3
454
32
18
17
31
1.94
118929527--118929622
49
2.0
49
97
0
183
32
18
16
32
1.94
118929455--118929694
121
2.0
121
92
0
399
33
17
16
32
1.92
118929579--118929717
72
1.9
73
97
1
262
32
16
16
34
1.92
118929767--118929872
54
1.9
55
83
5
135
39
19
13
27
1.89
118929852--118929885
13
2.5
13
90
4
50
58
8
11
20
1.59
118929723--118930350
140
4.5
140
96
1
1141
37
20
16
24
1.93
118929907--118930012
54
1.9
54
83
9
135
37
18
15
28
1.91
118930047--118930152
54
1.9
54
83
9
135
37
20
15
26
1.92
118930143--118930167
13
1.9
13
100
0
50
64
0
12
24
1.27
118930187--118930292
54
1.9
54
85
9
144
37
19
15
27
1.92
118930283--118930448
72
2.3
72
87
6
248
42
20
15
22
1.89
118947601--118947760
29
5.5
29
82
4
180
26
16
31
25
1.97
118952126--118952237
40
2.8
40
81
8
129
24
27
24
24
2.00
118955385--118955456
34
2.1
35
82
7
85
20
25
11
43
1.85
118956812--118956942
65
2.0
65
100
0
262
41
16
15
25
1.88
118956945--118957001
26
2.2
26
83
3
69
26
19
19
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118960314--118960367
20
2.7
20
73
0
54
29
22
27
20
1.98
118963338--118963545
55
3.9
54
86
4
267
21
25
18
35
1.95
118963524--118963645
47
2.6
47
90
0
190
24
23
14
36
1.93
118963784--118963868
44
1.9
44
83
4
109
24
22
14
38
1.91
118966825--118966853
11
2.7
11
94
5
51
6
37
0
55
1.27
118968657--118968867
43
4.9
43
74
12
146
31
27
16
25
1.96
118968778--118968867
45
2.0
44
84
2
117
34
24
17
23
1.96
118970400--118970714
47
6.7
47
76
12
237
28
19
29
22
1.98
118970406--118970716
140
2.2
140
82
6
353
28
19
29
22
1.98
118970401--118970718
94
3.4
94
76
11
273
28
19
29
22
1.98
118975050--118975180
40
3.3
39
77
8
147
25
28
21
24
1.99
118983076--118983226
40
3.8
39
82
2
142
23
27
22
25
2.00
118983076--118983226
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
118986613--118986820
40
5.2
40
84
4
233
25
22
26
25
2.00
118994653--118994833
40
4.5
39
83
6
186
27
22
26
23
1.99
119002254--119002323
27
2.5
28
86
2
97
32
25
14
27
1.94
119002331--119002437
42
2.5
42
96
0
196
22
33
14
28
1.94
119009482--119009551
27
2.5
28
86
2
97
32
25
14
27
1.94
119009559--119009665
42
2.5
42
96
0
196
22
33
14
28
1.94
119013376--119013562
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
119013399--119013562
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
119013399--119013596
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119020873--119021059
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
119020896--119021059
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
119020896--119021093
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
119025832--119026146
47
6.7
47
72
12
184
24
27
19
27
1.99
119027173--119027208
18
2.1
17
89
5
54
25
16
8
50
1.73
119032961--119033087
44
2.8
44
78
7
148
25
27
20
26
1.99
119032961--119033177
47
4.7
47
71
15
166
23
27
20
28
1.99
119039133--119039177
20
2.4
19
82
10
56
11
31
31
26
1.91
119039142--119039192
20
2.5
20
96
0
93
13
33
29
23
1.93
119040135--119040308
47
3.7
46
78
6
172
23
29
19
27
1.98
119043633--119043735
28
3.7
28
82
0
134
26
15
33
25
1.95
119043633--119043752
56
2.1
57
84
1
152
29
15
32
23
1.95
119044989--119045076
18
4.9
18
98
1
169
38
11
21
28
1.88
119051417--119051441
13
1.9
13
100
0
50
32
8
28
32
1.86
119057138--119057167
14
2.1
15
93
6
53
56
13
10
20
1.65
119060095--119060312
40
5.5
40
91
2
318
25
27
22
23
2.00
119071434--119071617
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
119071474--119071662
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
119074552--119074625
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
119074609--119074684
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
119074552--119074684
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
119090053--119090178
40
3.2
39
80
6
139
21
25
24
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119089992--119090178
80
2.3
80
78
12
204
22
27
24
25
2.00
119095826--119095933
53
2.1
53
91
3
175
39
12
26
20
1.89
119106000--119106079
27
3.0
27
85
5
108
35
18
25
21
1.96
119107681--119107802
43
2.9
42
80
8
140
27
15
24
32
1.95
119111511--119111561
24
2.2
23
82
3
57
21
21
9
47
1.79
119111633--119111887
55
4.8
53
79
9
236
21
25
17
36
1.94
119115364--119115432
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
119119655--119119723
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
119133593--119133664
34
2.2
33
82
7
83
25
25
22
27
2.00
119142191--119142266
22
3.3
22
67
16
64
30
10
31
27
1.90
119142169--119142341
47
3.7
47
93
0
283
32
6
31
28
1.84
119142183--119142255
25
3.0
25
66
18
73
31
8
30
30
1.86
119144323--119144634
43
7.3
43
95
0
534
14
22
30
32
1.93
119144763--119144856
28
3.3
27
73
8
80
22
18
31
27
1.97
119148320--119148395
22
3.3
22
67
16
64
30
10
31
27
1.90
119148298--119148470
47
3.7
47
93
0
283
32
6
31
28
1.84
119148312--119148384
25
3.0
25
66
18
73
31
8
30
30
1.86
119152191--119152297
40
2.7
40
83
11
130
23
25
29
21
1.99
119152147--119152329
40
4.6
39
74
8
129
26
23
27
22
1.99
119152191--119152338
80
1.9
80
81
2
181
22
24
30
22
1.99
119155558--119155612
27
2.0
27
96
0
101
23
18
10
47
1.80
119157900--119158109
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119166015--119166224
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
119170016--119170045
14
2.1
14
93
0
51
40
0
6
53
1.27
119171502--119171585
43
2.0
43
81
13
102
26
29
19
25
1.98
119188647--119188698
16
3.3
15
79
10
59
59
1
0
38
1.08
119193647--119193765
41
2.9
41
86
2
141
28
26
22
22
1.99
119194006--119194265
27
9.7
27
80
3
224
28
7
21
42
1.80
119194032--119194318
81
3.6
79
76
9
249
28
7
21
42
1.80
119194031--119194320
54
5.4
53
78
4
170
28
7
21
41
1.81
119194310--119194380
27
2.6
27
88
0
115
32
22
11
33
1.90
119213075--119213251
40
4.5
39
90
4
275
22
23
28
24
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770