Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  683  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
215263933--215264103
93
1.8
93
94
0
306
20
21
29
28
1.98
215271477--215271514
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
215273129--215273197
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
215279394--215279560
40
4.2
40
81
2
167
23
26
22
26
2.00
215279410--215279560
80
1.9
79
83
6
198
23
27
23
26
2.00
215287423--215287589
40
4.2
40
81
2
167
23
26
22
26
2.00
215287439--215287589
80
1.9
79
83
6
198
23
27
23
26
2.00
215292612--215292665
28
1.9
28
100
0
108
38
18
5
37
1.74
215293970--215294088
61
2.0
61
96
0
220
28
26
20
25
1.99
215295500--215295543
22
2.0
22
95
0
79
38
22
18
20
1.93
215298232--215298448
26
8.3
26
86
6
278
35
11
25
27
1.91
215299971--215300146
86
2.1
85
94
1
316
10
14
15
60
1.59
215302648--215302734
29
3.0
29
80
8
106
28
31
14
25
1.95
215302657--215302743
29
3.0
29
83
1
113
29
28
13
27
1.94
215302800--215302835
18
2.1
18
89
5
56
19
33
22
25
1.97
215302952--215302995
8
5.6
8
81
2
54
2
20
20
56
1.52
215304565--215304600
17
2.1
17
100
0
72
30
16
11
41
1.83
215307815--215307981
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
215315799--215315940
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
215315838--215315966
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
215321120--215321783
200
3.3
200
96
0
1247
42
6
11
39
1.68
215322031--215323036
136
7.5
134
94
2
1656
28
8
6
57
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
215322293--215322346
23
2.4
21
72
22
56
31
1
5
61
1.30
215322432--215322482
23
2.3
22
80
10
59
31
3
5
58
1.40
215322031--215323022
536
1.9
531
93
3
1713
28
8
6
57
1.52
215323411--215323439
10
2.7
11
94
5
51
62
3
0
34
1.12
215323499--215323542
20
2.3
19
80
4
52
0
27
0
72
0.85
215323513--215323537
6
4.2
6
100
0
50
0
16
0
84
0.63
215323572--215323608
12
2.8
13
92
8
58
0
29
0
70
0.88
215323571--215323620
22
2.3
20
83
12
64
0
32
0
68
0.90
215323574--215323618
14
3.4
12
87
12
54
0
31
0
68
0.89
215323810--215323844
10
3.5
10
85
14
54
11
8
5
74
1.22
215323809--215323845
11
3.5
11
78
14
51
10
8
5
75
1.17
215324103--215324150
16
3.0
16
100
0
96
18
12
6
62
1.50
215326943--215327078
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
215328565--215328619
26
2.1
26
86
6
76
38
23
14
23
1.92
215330918--215331013
47
2.0
47
97
0
183
25
12
30
32
1.92
215333054--215333095
19
2.2
20
86
4
59
26
19
7
47
1.74
215341188--215341340
44
3.5
43
80
11
136
36
23
22
17
1.95
215341224--215341599
86
4.3
86
82
3
434
36
22
22
19
1.95
215341136--215341433
130
2.3
129
82
8
329
35
22
23
18
1.95
215341798--215342013
44
4.9
44
72
8
154
30
18
24
26
1.98
215341798--215342068
132
2.1
132
85
2
366
32
17
23
26
1.97
215342019--215342164
45
3.3
44
83
2
175
34
13
27
24
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
215348081--215348119
19
2.0
20
90
10
62
35
5
0
58
1.20
215348105--215348156
18
2.9
18
74
5
52
57
1
0
40
1.10
215351837--215351862
13
2.0
13
100
0
52
46
0
0
53
1.00
215355161--215355370
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
215363294--215363503
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
215370770--215370948
40
4.4
40
80
3
189
25
24
26
23
2.00
215370770--215370962
80
2.4
80
82
2
217
26
24
26
22
2.00
215370891--215370974
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
215387077--215387298
64
3.4
64
79
6
232
23
29
14
31
1.95
215392741--215392838
31
3.4
31
73
16
109
19
19
12
48
1.79
215392741--215392859
6
19.3
6
66
17
57
19
18
12
49
1.79
215392772--215392838
25
2.7
25
85
0
98
19
20
10
49
1.77
215396701--215396966
114
2.3
114
84
3
336
23
20
23
32
1.98
215396663--215396908
38
6.4
38
87
5
327
24
22
23
29
1.99
215397071--215397115
19
2.3
20
92
7
83
24
13
28
33
1.93
215402000--215405516
7
501.4
7
96
2
6337
43
43
0
13
1.44
215405505--215405628
65
1.9
65
80
8
146
37
34
18
9
1.84
215405521--215405645
22
5.8
22
75
10
91
37
32
20
9
1.85
215405545--215405592
23
2.1
23
84
3
62
45
27
14
12
1.81
215425660--215425742
39
2.1
39
86
0
121
20
18
39
21
1.92
215428215--215428243
12
2.4
12
100
0
58
55
31
0
13
1.39
215431347--215431497
40
3.8
40
77
10
139
26
23
27
22
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
215431385--215431513
40
3.3
39
76
13
138
24
24
27
24
2.00
215439391--215439520
40
3.3
39
78
11
147
23
24
26
24
2.00
215443408--215443473
30
2.2
29
86
5
96
33
21
6
39
1.78
215443421--215443497
30
2.6
30
95
0
136
24
25
5
44
1.75
215445098--215445258
82
2.0
82
98
0
313
26
9
18
44
1.81
215450735--215450791
6
9.5
6
100
0
114
84
0
0
15
0.63
215455410--215455434
13
1.9
13
100
0
50
44
0
8
48
1.32
215460074--215460110
9
4.1
9
89
0
56
27
10
13
48
1.75
215460162--215460194
9
3.7
9
91
0
57
39
24
12
24
1.89
215460162--215460196
18
1.9
18
100
0
70
37
22
11
28
1.89
215462477--215462503
12
2.2
12
100
0
54
70
14
0
14
1.17
215462477--215462511
13
2.8
13
91
4
54
65
20
0
14
1.26
215469145--215469273
46
2.8
46
95
0
222
19
21
29
29
1.98
215476195--215476370
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
215476192--215476363
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
215483300--215483475
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
215483297--215483468
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
215487683--215487866
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
215487723--215487911
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
215489318--215489439
43
2.9
41
80
7
154
27
25
18
28
1.98
215490467--215490491
13
1.9
13
100
0
50
52
16
0
32
1.44
215491176--215491229
28
1.9
28
100
0
108
48
12
11
27
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
215495424--215495582
43
3.7
42
78
5
151
34
26
15
23
1.94
215498108--215498275
27
6.2
27
75
4
133
26
22
18
32
1.97
215500039--215500205
40
4.2
40
81
5
178
25
26
22
25
2.00
215500055--215500202
80
1.9
79
84
4
199
24
27
22
25
2.00
215504564--215504901
24
14.1
24
96
0
579
20
18
24
35
1.95
215511867--215512206
24
14.1
24
94
1
565
20
18
24
35
1.95
215517439--215517611
46
3.7
46
79
10
208
22
21
27
28
1.99
215517436--215517606
93
1.8
93
94
0
306
22
21
28
28
1.99
215521066--215521176
40
2.8
40
86
9
147
21
28
26
23
1.99
215521050--215521213
40
4.1
40
77
4
136
21
27
25
25
2.00
215529997--215530097
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
215554526--215554853
48
6.9
48
92
0
550
35
6
27
31
1.81
215554994--215555095
37
2.8
37
95
1
179
23
20
31
24
1.98
215556370--215556655
40
7.2
40
92
0
455
24
21
28
25
1.99
215556817--215556867
25
2.0
25
81
7
59
33
13
31
21
1.92
215561827--215562051
40
5.7
40
87
5
296
25
20
26
27
1.99
215561840--215562084
79
3.1
79
84
6
248
26
20
26
26
1.99
215570860--215570960
28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
215578665--215578765
28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
215583345--215583542
40
4.9
40
91
4
287
25
26
21
27
1.99
215590405--215590503
28
3.5
29
80
6
105
30
26
15
28
1.96
215594413--215594608
40
4.9
40
88
6
260
24
26
21
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
215594413--215594608
79
2.5
78
84
10
263
24
26
21
28
1.99
215598711--215598743
2
16.5
2
93
0
57
51
3
0
45
1.16
215598836--215598908
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
215606652--215606688
2
18.5
2
88
0
56
51
2
2
43
1.30
215606781--215606853
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
215614170--215614341
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
215614163--215614338
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
215615311--215615575
40
6.7
40
88
6
360
23
19
29
27
1.98
215615310--215615595
80
3.6
80
88
3
400
23
19
29
28
1.98
215615306--215615595
118
2.4
119
88
5
433
23
19
28
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770