Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  433  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133609172--133609356
40
4.6
40
91
1
282
23
21
28
26
1.99
133609168--133609388
80
2.8
79
83
4
266
26
20
26
26
1.99
133612351--133612525
46
3.8
46
79
7
219
28
26
21
22
1.99
133612356--133612526
93
1.8
93
94
0
306
28
28
21
22
1.99
133617839--133617973
46
3.0
43
76
15
123
29
27
20
22
1.98
133623665--133623845
40
4.6
40
84
2
231
25
20
25
27
1.99
133628571--133628696
46
2.7
46
97
0
234
28
27
23
20
1.99
133629116--133629175
30
2.0
30
90
0
93
30
25
8
36
1.85
133634307--133634382
37
2.1
37
97
0
143
26
11
28
32
1.92
133635277--133635302
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
133635299--133635357
26
2.3
26
82
5
66
22
22
20
35
1.96
133638573--133638673
29
3.5
29
91
1
159
25
26
13
33
1.94
133638573--133638682
57
1.9
58
88
1
168
26
25
13
34
1.93
133638572--133638702
58
2.3
57
84
6
165
26
26
13
32
1.94
133657998--133658182
40
4.7
40
82
9
202
28
21
24
25
1.99
133657998--133658182
79
2.3
80
82
11
229
28
21
24
25
1.99
133666001--133666183
39
4.6
39
84
9
189
26
21
26
25
2.00
133666001--133666183
79
2.3
78
80
11
205
26
21
26
25
2.00
133670591--133670740
67
2.2
67
89
2
239
29
22
28
20
1.98
133670674--133670725
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
133688398--133688566
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
133696354--133696478
37
3.2
38
82
5
144
24
25
22
28
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133700996--133701355
49
7.7
47
89
6
475
31
6
31
29
1.84
133703284--133703495
40
5.2
41
84
3
214
24
22
27
25
2.00
133703478--133703655
43
4.1
43
96
0
311
14
21
32
31
1.93
133707397--133707761
49
7.7
47
90
3
484
32
8
30
28
1.86
133715217--133715321
47
2.2
47
96
0
192
34
7
30
27
1.85
133717770--133717828
30
2.0
30
83
6
75
47
11
6
33
1.67
133723714--133723750
19
1.9
19
88
0
56
78
2
2
16
0.98
133725426--133725598
93
1.9
93
96
0
319
27
28
21
21
1.99
133725419--133725594
46
3.8
46
79
12
216
28
28
21
21
1.98
133728046--133728088
22
2.0
22
86
9
61
53
6
0
39
1.28
133735012--133735061
24
2.1
23
81
3
55
18
10
8
64
1.48
133738148--133738186
20
2.0
20
90
10
62
35
15
25
23
1.94
133738148--133738187
11
3.8
11
78
21
50
37
15
25
22
1.93
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Copy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Matches
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1.77
Indices
Period
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Copy
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3
84
30
25
3
40
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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