Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  35  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9945643--9946069
87
4.9
87
92
0
701
32
25
15
27
1.95
9945763--9945984
41
5.2
41
63
23
125
33
25
14
26
1.94
9945643--9946218
174
3.2
174
90
3
837
31
25
15
27
1.96
9946055--9946084
15
2.0
15
100
0
60
46
20
20
13
1.83
9945968--9946171
102
2.0
102
96
0
372
33
24
16
25
1.96
9956141--9956190
25
2.0
25
100
0
100
28
28
24
20
1.99
9958341--9958528
10
19.6
10
68
19
82
59
2
4
34
1.31
9958341--9958489
37
4.1
36
71
19
103
59
2
4
33
1.32
9958344--9958489
71
2.1
67
78
15
156
58
2
4
33
1.33
9960513--9960555
22
2.0
22
85
0
59
27
23
25
23
2.00
9961145--9961214
31
2.3
31
87
0
95
68
4
8
18
1.32
9961148--9961216
14
4.6
14
70
18
50
69
4
8
17
1.31
9964851--9964879
6
4.8
6
100
0
58
48
0
0
51
1.00
9964843--9964877
12
2.8
13
86
8
54
42
0
0
57
0.99
9967652--9967689
16
2.3
17
86
4
51
50
0
5
44
1.24
9968549--9968668
35
3.3
35
86
9
170
36
12
15
35
1.85
9968546--9968668
54
2.3
54
98
0
237
37
12
14
35
1.84
9968546--9968654
18
6.4
15
80
17
76
37
11
14
35
1.83
9968546--9968668
19
6.8
19
87
10
195
37
12
14
35
1.84
9968546--9968691
17
7.7
22
84
12
88
36
10
15
36
1.82
9970907--9970940
16
2.1
17
88
5
52
52
14
14
17
1.74
9978297--9978332
18
2.1
18
89
5
56
16
27
38
16
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9978739--9978799
24
2.5
24
97
0
113
31
6
39
22
1.80
9980239--9980349
27
4.1
26
81
7
132
17
22
22
37
1.94
9982012--9982054
18
2.5
17
77
7
50
25
2
18
53
1.56
9986094--9986607
257
2.0
257
93
1
870
28
28
17
26
1.98
9989752--9989887
6
22.7
6
94
0
200
66
5
0
27
1.14
9989752--9989887
9
15.1
9
89
0
200
66
5
0
27
1.14
9991421--9991527
39
2.7
39
94
4
189
26
28
22
23
1.99
9991356--9991561
40
5.2
40
82
5
224
26
27
21
24
1.99
9991356--9991561
78
2.6
79
80
6
238
26
27
21
24
1.99
9999612--9999645
16
2.1
17
88
5
52
76
11
8
2
1.12
9999926--9999999
37
2.0
37
100
0
148
45
29
10
13
1.77
10001128--10001177
25
2.0
25
100
0
100
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8
24
1.52
10002499--10002544
20
2.3
20
81
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45
19
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28
1.75
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2
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2
100
0
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0
0
48
1.00
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43
1.9
43
92
0
139
36
27
18
18
1.94
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
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Period
Size
Copy
Number
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Indices
Period
Size
Copy
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25
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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