Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  723  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
228751361--228751738
71
5.0
73
80
6
384
33
19
16
30
1.94
228751767--228751910
73
1.9
74
87
5
211
28
21
18
31
1.97
228751768--228751927
73
2.1
74
83
8
200
32
20
18
29
1.96
228751921--228752094
74
2.3
77
83
6
219
32
19
18
28
1.96
228752074--228752108
14
2.5
14
90
0
52
57
5
20
17
1.60
228752098--228752525
74
5.9
74
70
14
295
35
22
17
25
1.95
228752084--228752538
71
6.3
72
70
11
299
37
21
16
24
1.94
228752538--228752800
70
3.8
70
84
5
345
38
22
14
25
1.91
228752538--228752800
141
1.9
140
89
2
411
38
22
14
25
1.91
228752377--228752967
262
2.3
256
94
2
1031
37
22
14
25
1.93
228755339--228755728
195
2.0
195
98
0
762
25
23
20
30
1.99
228756226--228756354
39
3.2
40
74
6
118
51
4
6
37
1.48
228756856--228756895
16
2.3
18
87
12
57
5
0
35
60
1.19
228760232--228760384
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
228768247--228768399
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
228773193--228773375
48
3.8
48
94
1
303
32
7
27
33
1.84
228773358--228773500
47
3.0
47
93
2
234
32
10
30
27
1.90
228773402--228773477
22
3.2
24
66
23
70
30
11
32
25
1.91
228773467--228773528
32
2.0
31
90
3
97
30
6
32
30
1.83
228773498--228773679
47
3.9
47
91
0
285
32
6
31
29
1.83
228773420--228773575
78
2.0
79
91
1
251
31
8
31
28
1.87
228773379--228773622
125
1.9
126
89
0
382
32
7
30
29
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
228776291--228776612
40
8.1
40
92
0
509
24
22
27
24
2.00
228779766--228779947
48
3.8
48
94
2
305
31
6
26
34
1.82
228779766--228779947
95
1.9
96
92
4
305
31
6
26
34
1.82
228779876--228780219
47
7.3
47
91
2
449
32
9
29
28
1.88
228779976--228780050
22
3.3
22
66
23
64
30
12
32
25
1.92
228782356--228782604
40
6.2
40
89
2
376
25
23
28
22
1.99
228782356--228782604
119
2.1
120
89
2
376
25
23
28
22
1.99
228790530--228790699
40
4.2
40
84
3
225
25
24
28
21
1.99
228800015--228800046
13
2.5
13
94
0
55
15
6
28
50
1.68
228802437--228802515
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
228803155--228803186
2
16.0
2
93
0
55
46
0
3
50
1.17
228804404--228804475
35
2.1
35
100
0
144
33
18
27
20
1.96
228805954--228806125
93
1.8
93
91
0
281
27
28
21
22
1.99
228805947--228806127
46
3.9
46
76
9
170
28
28
20
22
1.99
228813349--228813427
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
228814064--228814099
2
18.0
2
88
0
54
44
2
2
50
1.31
228817022--228817177
42
3.6
43
73
17
142
29
28
20
21
1.98
228817022--228817187
46
3.7
45
74
19
161
28
27
21
21
1.99
228831258--228831366
24
4.6
23
85
7
137
33
23
17
24
1.96
228831258--228831366
48
2.3
48
91
3
175
33
23
17
24
1.96
228837369--228837540
46
3.7
46
73
9
179
30
27
20
22
1.98
228840205--228840285
25
3.2
25
70
18
69
38
2
3
55
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
228842175--228842205
15
2.0
16
93
6
55
77
0
6
16
0.97
228843760--228843829
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
228843760--228843841
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
228851565--228851634
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
228851565--228851646
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
228859364--228859433
27
2.5
28
95
2
124
28
14
27
30
1.95
228859364--228859445
27
3.0
27
85
8
78
29
15
24
30
1.96
228863898--228864064
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
228865587--228865661
34
2.2
34
92
0
123
33
21
4
41
1.72
228865814--228865993
35
5.1
35
81
0
198
41
19
10
28
1.85
228876179--228876217
12
3.2
12
88
0
51
10
25
38
25
1.87
228886487--228886559
29
2.5
29
100
0
146
28
15
28
27
1.96
228886650--228886676
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
228894443--228894515
29
2.5
29
100
0
146
28
15
28
27
1.96
228894606--228894630
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
228897518--228897616
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
228905196--228905294
28
3.5
28
81
9
112
29
25
16
29
1.96
228911194--228911344
40
3.8
40
80
6
164
26
22
27
23
2.00
228916563--228916708
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
228916595--228916746
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
228924677--228924822
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
228924709--228924859
40
3.8
40
84
6
164
23
25
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
228933692--228933794
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
228941491--228941593
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
228949280--228949382
29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
228954922--228955024
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
228960343--228960514
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
228960336--228960511
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
228967926--228968097
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
228967919--228968094
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
228973072--228973174
29
3.6
28
81
5
116
21
16
33
29
1.95
228975980--228976138
43
3.7
43
79
5
169
32
25
15
27
1.95
228979353--228979397
22
2.0
22
91
0
72
31
8
13
46
1.74
228980421--228980840
217
1.9
217
93
0
714
35
18
20
25
1.95
228984392--228984559
40
4.2
40
76
1
140
24
26
21
27
1.99
228989926--228990056
40
3.3
40
82
0
145
25
16
25
33
1.95
228990866--228990892
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
228992888--228992948
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
228995412--228995541
40
3.3
39
83
4
163
23
28
25
23
1.99
229002935--229003115
39
4.6
39
88
2
231
23
31
22
23
1.98
229002965--229003115
77
1.9
79
92
5
254
23
31
21
23
1.98
229011025--229011206
39
4.6
39
89
0
247
23
31
21
23
1.98
229011055--229011207
39
3.9
39
92
0
252
23
32
20
23
1.98
229023116--229023330
46
4.7
46
91
1
317
39
15
23
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
229028409--229028573
46
3.7
46
96
2
300
37
15
24
23
1.93
229028551--229028589
16
2.4
16
100
0
78
35
15
25
23
1.94
229028508--229028627
59
2.0
61
87
8
174
41
15
23
20
1.89
229033713--229033969
46
5.7
46
90
4
371
39
15
23
21
1.91
229033663--229033969
92
3.5
87
86
6
406
39
15
23
22
1.92
229033671--229033969
133
2.3
127
86
7
386
39
15
23
21
1.91
229034686--229034815
60
2.2
59
84
8
165
28
19
25
26
1.99
229041537--229041642
45
2.4
45
83
3
151
42
15
18
23
1.88
229053401--229053564
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
229053401--229053598
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
229060980--229061143
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
229060980--229061177
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
229069318--229069429
44
2.5
45
87
5
158
39
20
18
21
1.93
229069384--229069441
23
2.5
23
88
5
82
43
22
17
17
1.88
229069308--229069477
22
7.3
23
76
13
129
36
19
20
23
1.95
229070889--229070928
17
2.2
17
86
8
53
42
7
5
45
1.54
229073728--229074062
27
12.6
27
84
6
407
28
22
8
40
1.84
229073728--229074062
80
4.2
80
83
6
396
28
22
8
40
1.84
229075386--229075442
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
229075384--229075446
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
229075500--229075687
24
8.0
24
89
5
269
29
22
21
26
1.99
229075879--229075942
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
229078784--229079116
53
6.3
54
85
5
430
28
23
9
39
1.85
229078784--229079116
27
12.6
27
87
4
439
28
23
9
39
1.85
229080438--229080494
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
229080436--229080498
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
229080552--229080739
24
8.0
23
90
6
274
29
22
21
26
1.99
229080930--229080993
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
229083838--229084173
132
2.5
134
87
4
491
27
23
9
38
1.86
229083838--229084173
27
12.6
27
87
4
459
27
23
9
38
1.86
229083869--229084184
80
4.0
80
84
6
327
28
23
8
39
1.84
229085494--229085550
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770