Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  701  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
221262980--221263161
39
4.6
39
87
2
240
23
30
22
24
1.99
221267417--221267570
39
3.9
39
86
0
191
23
31
22
22
1.98
221267447--221267570
39
3.2
39
90
1
194
25
32
20
22
1.98
221269375--221269518
39
3.7
40
84
0
175
23
29
22
23
1.99
221280458--221280660
64
3.1
66
84
9
197
32
16
29
22
1.95
221280482--221280724
64
3.8
64
79
13
252
30
16
30
23
1.96
221285053--221285260
40
5.2
39
83
6
231
24
22
27
25
2.00
221292947--221293052
40
2.7
40
93
0
176
25
20
28
25
1.99
221292980--221293087
40
2.7
40
82
0
117
25
25
27
22
2.00
221295922--221296145
27
8.3
27
82
3
184
37
20
8
32
1.84
221296069--221296414
27
12.8
27
88
2
419
29
22
7
40
1.82
221296258--221296478
54
4.1
54
83
0
127
32
23
7
36
1.83
221296123--221296458
81
4.1
81
80
6
196
30
22
7
39
1.82
221297654--221297701
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
221297745--221297803
20
3.0
20
92
0
100
35
11
20
32
1.89
221297854--221297997
24
6.0
23
91
6
209
29
22
22
25
1.99
221297854--221297997
47
3.0
46
90
7
209
29
22
22
25
1.99
221297854--221297997
71
2.0
72
89
6
222
29
22
22
25
1.99
221298188--221298282
31
3.1
31
98
0
181
38
15
22
23
1.92
221300677--221300829
27
5.7
26
84
2
144
40
21
8
29
1.83
221300824--221301168
27
12.8
27
87
3
383
28
22
7
41
1.81
221300679--221300899
54
4.1
54
76
6
144
36
21
9
33
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
221301093--221301232
54
2.6
54
80
0
127
35
22
7
35
1.82
221302409--221302456
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
221302500--221302556
19
3.0
20
84
7
82
35
10
21
33
1.87
221302607--221302773
24
7.0
24
93
4
259
29
22
22
25
1.99
221302964--221303055
30
3.1
29
92
6
157
39
14
22
23
1.91
221312107--221312290
39
4.8
38
80
12
166
27
22
27
23
1.99
221312151--221312335
39
4.8
38
77
11
160
23
23
29
23
1.99
221312152--221312335
76
2.4
78
81
4
203
23
23
29
23
1.99
221316448--221316531
43
2.0
43
83
9
109
29
28
16
25
1.97
221319010--221319177
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
221326624--221326662
21
1.9
20
94
5
69
25
20
17
35
1.95
221327030--221327195
40
4.2
40
82
3
185
24
27
22
26
2.00
221327046--221327155
39
2.8
39
87
4
141
23
29
23
23
1.99
221332803--221332917
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
221332803--221332936
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
221338925--221339039
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
221338925--221339058
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
221341296--221341424
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
221342853--221342883
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
221345091--221345126
17
2.2
16
86
13
56
36
5
11
47
1.63
221356257--221356321
20
3.2
20
71
16
60
24
23
15
36
1.93
221361323--221361506
40
4.6
39
76
9
158
27
25
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
221361323--221361506
80
2.3
80
77
9
187
27
25
19
27
1.99
221361304--221361508
40
5.1
39
77
7
155
26
25
20
27
1.99
221363903--221364005
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
221371918--221372020
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
221378624--221378725
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
221386887--221386985
27
3.5
28
87
4
128
30
27
14
28
1.95
221390686--221390721
17
2.1
17
100
0
72
30
11
5
52
1.59
221394989--221395036
15
3.3
15
73
5
53
43
25
0
31
1.55
221396058--221396106
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
221396928--221397094
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
221404059--221404107
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
221404930--221405096
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
221407201--221407320
25
5.0
24
88
9
174
28
22
20
29
1.98
221407368--221407431
20
3.3
20
80
12
89
32
21
10
34
1.89
221407374--221407430
17
3.1
18
78
14
71
33
22
10
33
1.88
221407370--221407448
37
2.1
37
83
4
97
32
22
10
34
1.88
221414975--221415038
31
2.1
31
93
0
110
23
23
15
37
1.93
221415243--221415349
24
4.4
24
89
4
162
28
20
19
30
1.97
221415224--221415349
49
2.6
48
85
8
168
27
20
19
31
1.97
221415406--221415458
9
5.4
9
75
16
52
37
20
7
33
1.81
221415398--221415464
20
3.3
20
89
0
107
34
20
10
34
1.87
221415410--221415453
15
2.9
15
81
18
56
34
20
9
36
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
221417715--221417742
14
2.0
14
100
0
56
28
28
0
42
1.56
221420026--221420126
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
221420026--221420176
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99
221420022--221420193
40
4.4
38
77
10
161
29
21
26
23
1.99
221427938--221428108
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
221433604--221433677
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
221433661--221433736
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
221433604--221433736
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
221441476--221441549
29
2.6
29
95
0
139
27
14
31
27
1.95
221441533--221441608
29
2.6
29
78
0
89
22
19
35
22
1.96
221441476--221441608
58
2.3
58
80
2
133
24
17
33
24
1.96
221449349--221449471
29
4.2
29
89
4
158
25
28
15
30
1.96
221449311--221449471
58
2.8
58
81
0
160
24
32
14
27
1.95
221456254--221456414
29
5.6
29
85
2
171
24
32
15
27
1.95
221459932--221460154
40
5.6
40
84
5
274
25
24
27
22
2.00
221459932--221460190
80
3.3
79
84
4
317
25
23
26
23
2.00
221459932--221460154
120
1.9
119
86
6
326
25
24
27
22
2.00
221463645--221463786
40
3.5
40
85
0
167
23
28
22
26
1.99
221463677--221463828
40
3.8
40
82
5
155
22
25
23
28
1.99
221471758--221471902
40
3.7
40
83
1
166
24
27
22
26
1.99
221471790--221471940
40
3.8
40
82
6
155
22
25
22
29
1.99
221473665--221473736
29
2.5
28
86
6
92
30
15
26
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
221481508--221481608
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
221481537--221481612
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
221484115--221484791
96
6.8
105
73
18
481
34
5
3
56
1.40
221484223--221484791
96
5.8
92
80
16
502
34
5
3
56
1.40
221484357--221484498
41
3.3
41
66
14
117
36
4
2
55
1.36
221484353--221484495
46
3.2
46
66
11
136
34
4
2
57
1.35
221484480--221484509
14
2.2
14
94
5
53
30
0
3
66
1.07
221484056--221484800
203
3.8
189
82
14
762
34
5
3
56
1.39
221484393--221484791
96
3.9
103
87
9
563
33
5
3
56
1.40
221484698--221484722
5
5.0
5
100
0
50
20
0
0
80
0.72
221484609--221484759
48
3.2
46
67
16
128
30
5
3
59
1.39
221485007--221485128
43
2.8
42
75
8
120
47
16
0
35
1.52
221489955--221490086
29
4.6
29
84
1
140
25
17
32
25
1.97
221497681--221497812
29
4.6
29
84
1
140
25
17
32
25
1.97
221501075--221501103
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
221501513--221501565
21
2.5
21
78
6
63
30
16
50
1
1.56
221501799--221501873
31
2.3
32
86
4
98
12
5
21
61
1.50
221514618--221514766
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
221514659--221514766
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
221517546--221517590
23
1.9
24
82
13
58
37
6
24
31
1.81
221518344--221518511
40
4.2
40
80
3
196
25
22
27
25
2.00
221527715--221527772
25
2.3
25
100
0
116
29
25
6
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
221529492--221529670
40
4.4
40
82
3
198
25
24
26
24
2.00
221529492--221529670
80
2.2
81
87
3
254
25
24
26
24
2.00
221529613--221529696
40
2.1
40
82
4
98
26
27
26
20
1.99
221529526--221529696
80
2.1
80
81
2
191
26
24
25
23
2.00
221533144--221533329
40
4.7
40
80
5
171
29
23
25
22
1.99
221533144--221533296
80
1.9
79
85
1
207
28
22
26
22
1.99
221533148--221533329
79
2.3
80
80
0
204
28
24
25
21
1.99
221535485--221535653
40
4.2
40
78
4
164
23
26
21
28
1.99
221550314--221550484
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
221558326--221558500
39
4.5
39
82
8
169
27
22
26
23
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770