Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  474  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146321329--146321463
41
3.4
39
82
7
139
28
15
25
30
1.96
146322313--146322471
79
2.0
79
93
0
273
23
24
29
22
1.99
146329413--146329562
37
4.1
37
92
0
237
28
30
18
23
1.97
146329709--146329844
48
2.8
48
95
2
236
30
28
6
33
1.83
146329813--146330023
93
2.3
94
98
0
406
26
29
12
31
1.93
146329859--146329932
22
3.3
22
65
20
62
27
29
13
29
1.94
146329813--146330031
47
4.7
47
93
1
377
26
28
12
32
1.92
146335392--146335554
70
2.3
71
97
1
310
34
18
28
19
1.95
146342467--146342630
71
2.3
71
97
0
310
34
18
28
18
1.95
146344768--146344868
28
3.5
30
79
6
109
30
14
25
28
1.95
146352563--146352662
28
3.5
28
80
10
98
29
15
27
29
1.96
146355523--146355706
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
146355563--146355751
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
146363608--146363791
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
146363648--146363836
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
146365744--146365869
62
2.0
62
98
0
243
27
22
26
23
1.99
146378601--146378638
19
2.0
19
100
0
76
47
15
10
26
1.78
146378904--146379092
40
4.7
40
85
7
267
24
28
22
24
2.00
146378904--146379092
80
2.4
80
90
3
317
24
28
22
24
2.00
146385154--146385306
40
3.8
40
79
5
148
25
28
23
22
2.00
146390015--146390203
39
4.8
39
92
3
308
24
29
22
23
1.99
146392580--146392653
29
2.6
29
95
0
139
27
31
14
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146392521--146392653
58
2.3
58
80
2
133
24
33
17
24
1.96
146398857--146399064
40
5.2
40
81
1
175
22
26
23
27
1.99
146398911--146399064
80
1.9
80
86
0
218
22
26
22
27
1.99
146407996--146408131
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
146409908--146410192
135
2.1
137
97
1
538
24
19
24
31
1.98
146413898--146414033
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
146415810--146416096
137
2.1
137
96
0
520
24
18
24
32
1.97
146417102--146417134
16
2.1
16
100
0
66
24
45
6
24
1.75
146433362--146433419
29
2.0
30
86
3
82
41
6
6
44
1.58
146435455--146435498
23
1.9
23
100
0
88
52
9
0
38
1.33
146439880--146439914
16
2.2
16
90
5
54
88
2
8
0
0.61
146453460--146453664
71
2.9
71
87
6
290
30
17
23
28
1.97
146453371--146453822
230
2.0
231
96
1
836
29
17
22
31
1.96
146453690--146453823
71
1.9
71
90
0
214
30
16
23
29
1.96
146453539--146454132
159
3.8
159
93
3
967
28
17
22
31
1.96
146454005--146454238
68
3.5
66
83
14
261
29
18
22
29
1.97
146455166--146455199
16
2.2
16
89
5
52
88
2
8
0
0.62
146455301--146455374
36
2.1
37
92
7
134
27
40
2
29
1.70
146456058--146456095
19
2.0
19
89
0
58
36
0
2
60
1.11
146459275--146459354
29
2.7
29
86
5
108
27
32
15
25
1.95
146467173--146467252
29
2.7
29
86
5
108
27
32
15
25
1.95
146471532--146471562
16
1.9
16
100
0
62
12
6
32
48
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146474893--146475068
46
3.9
43
75
15
151
29
29
19
21
1.98
146474900--146475068
91
1.8
91
92
3
286
28
29
20
21
1.98
146477438--146477526
30
3.0
30
79
11
94
56
15
17
10
1.67
146477438--146477520
15
5.6
14
73
10
58
55
16
18
9
1.68
146477449--146477526
15
5.2
15
75
9
70
55
15
17
11
1.69
146480431--146480601
93
1.8
93
87
2
254
30
29
18
22
1.97
146484320--146484440
57
2.1
59
82
3
147
26
18
7
47
1.74
146488715--146488886
93
1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
146488708--146488883
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
146495613--146495665
26
2.0
27
96
3
99
32
18
15
33
1.92
146495892--146495934
17
2.5
17
100
0
86
11
25
41
20
1.86
146499476--146499576
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
146507429--146507529
28
3.5
28
86
6
114
29
26
13
29
1.94
146510493--146510570
29
2.7
29
85
0
102
26
16
33
23
1.96
146517660--146517737
29
2.7
29
83
0
102
26
17
33
21
1.96
146519283--146519538
79
3.2
79
80
6
243
25
20
27
26
1.99
146519284--146519505
39
5.6
39
81
8
236
24
21
27
26
1.99
146519283--146519538
78
3.2
78
79
6
223
25
20
27
26
1.99
146526498--146526728
79
2.9
79
82
5
245
24
21
27
26
1.99
146526498--146526721
40
5.7
40
82
6
260
24
21
27
26
1.99
146532386--146532531
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
146532418--146532569
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146540506--146540651
40
3.7
40
84
0
175
24
27
21
26
2.00
146540538--146540689
40
3.8
40
84
5
164
23
25
22
28
1.99
146545140--146545361
39
5.7
40
82
9
253
23
22
27
26
1.99
146545259--146545380
40
3.1
37
83
10
129
23
22
27
25
2.00
146552359--146552622
40
6.7
40
84
5
304
24
22
26
26
2.00
146559606--146559828
40
5.7
40
86
6
287
24
22
27
26
2.00
146559606--146559828
79
2.8
80
85
6
287
24
22
27
26
2.00
146563818--146563948
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
146563818--146563948
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
146571760--146571890
30
4.5
30
86
8
171
32
13
25
28
1.94
146571760--146571890
58
2.2
58
86
4
174
32
13
25
28
1.94
146577983--146578021
5
7.8
5
83
11
53
79
0
2
17
0.84
146577984--146578014
9
3.3
9
91
8
53
77
0
3
19
0.90
146582022--146582072
26
2.0
26
88
0
75
41
9
1
47
1.48
146584136--146584186
26
2.0
26
96
0
93
41
11
1
45
1.52
146584305--146584353
24
2.0
24
100
0
98
12
16
24
46
1.81
146586258--146586308
26
2.0
26
92
0
84
41
13
1
43
1.55
146587882--146588049
40
4.2
40
79
1
158
22
27
23
26
2.00
146587898--146588047
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
146595063--146595230
40
4.2
40
80
1
167
23
27
23
25
2.00
146595079--146595228
80
1.9
80
83
5
196
22
27
24
26
2.00
146599457--146599565
40
2.7
40
83
8
141
23
24
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146603904--146604217
72
4.4
70
83
4
376
53
14
7
24
1.66
146604546--146604649
26
4.0
26
93
0
181
33
7
25
33
1.84
146609140--146609323
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
146609180--146609368
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
146623976--146624015
13
2.8
15
85
14
66
35
0
0
65
0.93
146626783--146626811
14
2.1
14
100
0
58
27
13
6
51
1.66
146630978--146631046
21
3.3
21
87
2
95
11
24
8
55
1.64
146633412--146633505
18
5.4
18
92
3
131
28
9
25
36
1.87
146641754--146641781
14
2.0
14
100
0
56
14
14
0
71
1.15
146641778--146641856
5
14.2
6
80
17
66
32
2
16
48
1.60
146641779--146641860
11
7.5
11
69
23
50
32
2
17
47
1.60
146641815--146641860
20
2.2
21
92
7
85
32
0
19
47
1.50
146650034--146650095
32
1.9
32
96
0
115
38
22
9
29
1.86
146654212--146654255
22
2.0
22
100
0
88
54
4
22
18
1.61
146656488--146656531
21
2.1
21
83
8
54
63
2
9
25
1.35
146671635--146671704
27
2.5
28
88
2
106
31
25
14
28
1.95
146675916--146675963
25
1.9
25
91
0
78
35
20
14
29
1.93
146675998--146676069
20
3.7
19
83
10
92
36
12
19
31
1.89
146676114--146676184
26
2.8
26
91
4
119
26
23
21
28
1.99
146681782--146681900
43
2.8
42
76
8
125
31
26
18
24
1.98
146691374--146692797
709
2.0
710
96
0
2656
33
12
17
36
1.87
146693316--146693340
11
2.3
11
100
0
50
28
0
20
52
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
146698089--146698228
49
2.8
49
78
5
138
30
15
24
29
1.96
146700369--146700393
13
1.9
13
100
0
50
40
4
16
40
1.67
146703380--146703457
29
2.7
29
85
0
102
26
16
33
23
1.96
146707720--146707890
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
146713279--146713337
29
2.0
29
100
0
118
30
20
22
27
1.98
146715724--146715893
39
4.4
38
75
13
143
29
21
25
23
1.99
146718828--146718861
18
1.9
17
94
5
59
8
17
8
64
1.47
146720067--146720123
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
146720065--146720135
20
3.5
20
94
0
124
35
11
21
32
1.89
146720076--146720130
11
5.4
11
70
16
55
36
12
20
30
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770