Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  608  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
190389551--190389651
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
190397724--190397764
20
2.0
20
85
0
55
39
14
0
46
1.45
190399355--190399578
27
8.3
28
80
7
207
30
14
16
37
1.90
190399354--190399544
81
2.4
81
83
3
249
31
14
16
37
1.89
190399904--190399957
18
3.0
18
89
5
74
20
16
12
50
1.78
190399904--190399957
6
8.8
6
78
17
58
20
16
12
50
1.78
190402805--190402879
27
2.7
28
74
12
73
34
28
6
30
1.83
190402812--190402883
28
2.6
26
78
10
72
30
27
5
36
1.80
190402912--190402996
28
3.0
28
77
0
98
27
23
10
38
1.87
190402950--190403015
28
2.4
28
84
0
78
27
24
7
40
1.82
190406008--190406152
40
3.6
40
86
4
202
25
25
26
22
2.00
190414031--190414175
40
3.6
40
86
4
202
25
25
26
22
2.00
190419115--190419289
40
4.5
40
91
5
270
23
24
28
24
2.00
190419115--190419289
78
2.2
80
90
6
270
23
24
28
24
2.00
190428723--190428932
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
190436858--190437067
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
190445325--190445406
29
2.8
29
98
0
155
25
30
14
29
1.95
190454751--190454851
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
190462682--190462782
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
190476142--190476430
47
6.1
47
88
3
398
32
10
30
27
1.90
190476404--190476540
46
3.0
46
89
0
202
34
8
31
25
1.86
190478478--190478634
68
2.3
67
80
5
165
42
18
13
26
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
190480961--190481008
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
190481051--190481111
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
190481161--190481302
24
6.0
24
91
5
209
28
22
22
26
1.99
190481161--190481303
71
2.0
71
89
5
218
29
22
22
25
1.99
190481517--190481580
31
2.1
31
94
2
112
40
14
21
23
1.90
190481494--190481573
24
3.1
24
70
27
65
36
17
23
22
1.95
190487553--190487600
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
190487644--190487705
20
3.3
19
84
4
81
33
12
22
30
1.92
190487752--190487891
24
6.0
24
87
9
191
28
22
22
26
1.99
190490163--190490232
28
2.5
28
88
9
99
27
14
27
31
1.95
190492973--190493039
26
2.6
26
95
0
116
25
26
20
26
1.99
190493261--190493345
32
2.7
32
90
3
129
35
16
23
24
1.95
190494363--190494389
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
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Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
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Score
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T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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1.98
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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