Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  554  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
172524214--172524380
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
172534161--172534270
55
2.1
54
83
11
138
38
18
15
28
1.91
172535457--172535623
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
172544282--172544402
43
2.8
43
75
5
127
30
16
22
30
1.96
172552143--172552272
43
3.0
43
81
6
147
25
16
27
30
1.97
172555809--172556150
27
12.7
27
85
0
407
37
19
17
25
1.93
172555789--172556150
54
6.7
54
88
2
496
37
19
17
25
1.94
172563195--172563401
24
8.6
24
96
0
342
20
17
25
36
1.95
172570926--172571128
24
8.6
24
92
4
315
20
18
25
35
1.95
172574860--172574888
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
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67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
172578047--172578230
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
172582473--172582622
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
172582497--172582680
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
172591313--172591378
29
2.3
28
84
5
78
30
24
1
43
1.63
172594590--172594698
54
2.0
54
92
0
182
46
13
13
25
1.80
172598316--172598426
34
3.3
34
93
0
186
30
20
18
29
1.97
172602561--172602633
29
2.5
29
93
0
101
26
31
16
26
1.96
172610297--172610370
29
2.6
29
88
0
94
25
33
16
24
1.95
172619619--172619653
2
17.5
2
100
0
70
51
0
0
48
1.00
172619627--172619725
39
2.5
39
80
4
110
53
4
5
37
1.42
172620243--172620277
14
2.4
14
90
9
52
5
0
25
68
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
172620242--172620282
16
2.5
17
81
18
52
4
2
21
70
1.18
172620273--172620307
15
2.3
15
90
9
54
0
8
2
88
0.61
172620953--172621608
88
7.8
83
71
15
358
36
18
16
27
1.93
172621121--172621182
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
172621280--172621314
14
2.6
14
90
4
54
51
5
14
28
1.65
172621334--172621525
77
2.5
78
86
3
253
32
17
18
31
1.94
172621576--172621920
116
2.9
121
83
9
454
36
22
15
25
1.93
172621831--172622300
72
6.6
71
85
6
596
34
20
16
28
1.94
172621821--172622999
216
5.1
217
76
15
1034
34
20
16
28
1.95
172622147--172622949
167
5.0
159
72
15
501
35
18
17
28
1.94
172622303--172622442
73
1.9
74
88
2
210
27
22
20
29
1.99
172622455--172622516
30
2.1
30
93
0
106
40
29
11
19
1.86
172622665--172623005
72
4.5
73
81
6
380
32
19
17
30
1.95
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28
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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