Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  306  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93551289--93552004
315
2.3
310
89
4
1088
29
1
23
44
1.64
93552404--93552521
35
3.3
35
93
3
191
38
11
14
35
1.83
93552997--93553058
17
3.7
17
76
22
60
38
1
0
59
1.07
93553006--93553072
16
4.2
16
73
19
59
37
1
0
61
1.05
93553039--93553087
26
1.9
25
83
4
62
36
4
0
59
1.17
93556316--93556348
2
17.0
2
93
6
59
51
0
48
0
1.00
93557722--93557811
24
3.8
24
95
1
155
34
27
17
20
1.95
93557794--93557864
28
2.6
28
91
8
110
29
33
15
21
1.94
93565605--93565718
24
4.8
24
96
1
203
35
27
17
20
1.95
93565701--93565774
29
2.6
29
97
0
139
28
32
14
24
1.95
93569819--93569861
13
3.5
12
87
12
61
83
0
13
2
0.74
93569823--93569870
21
2.3
20
86
10
62
79
0
16
4
0.89
93570740--93570914
44
4.0
44
73
8
158
31
16
23
28
1.96
93570913--93571382
237
2.0
238
91
0
762
33
18
18
29
1.95
93570909--93571368
119
3.9
119
92
0
751
33
18
18
29
1.95
93571306--93571907
83
7.2
83
93
1
990
31
20
20
27
1.97
93572301--93572417
17
6.5
17
87
7
153
36
11
14
37
1.82
93572301--93572417
35
3.3
35
95
3
198
36
11
14
37
1.82
93572301--93572417
54
2.2
53
86
9
157
36
11
14
37
1.82
93572900--93572959
17
3.5
17
74
21
63
33
1
0
65
1.03
93572901--93572959
16
3.5
16
76
23
59
33
1
0
64
1.04
93572936--93572985
26
1.9
26
83
0
64
36
4
0
60
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93575069--93575111
3
14.7
3
90
4
61
60
0
39
0
0.97
93576256--93576292
13
2.8
13
95
0
65
43
0
18
37
1.51
93579146--93579261
42
2.7
43
87
2
180
26
13
30
29
1.94
93582411--93582443
15
2.1
16
94
5
59
84
0
3
12
0.72
93587673--93587720
22
2.1
23
85
11
64
66
6
6
20
1.36
93587800--93587839
21
1.9
21
89
0
62
70
5
2
22
1.19
93587878--93587915
12
3.2
12
88
0
58
63
0
2
34
1.09
93589740--93590122
44
8.7
43
67
14
201
29
16
23
30
1.96
93589806--93590148
44
7.8
43
70
11
212
29
18
22
29
1.98
93589594--93590122
88
6.0
87
80
5
571
29
17
22
31
1.96
93590076--93590389
143
2.2
143
81
5
384
29
23
18
28
1.98
93600634--93600721
46
1.9
46
85
0
122
29
25
14
30
1.95
93601119--93601222
53
2.0
53
90
3
165
51
9
15
23
1.72
93602810--93602994
49
3.8
49
78
3
219
28
24
20
27
1.99
93602804--93603000
100
2.0
98
90
2
313
28
24
20
26
1.99
93605960--93606202
49
4.9
49
84
3
326
28
27
18
25
1.98
93605973--93606202
99
2.3
98
87
2
327
28
27
18
25
1.98
93606848--93606906
30
2.0
29
83
9
75
28
27
6
37
1.82
93610225--93610622
47
8.5
47
93
1
645
28
30
8
32
1.87
93610275--93610353
25
3.3
25
66
16
76
30
29
6
34
1.82
93610394--93610516
22
5.3
22
62
18
61
26
30
10
32
1.90
93615504--93615675
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93615496--93615671
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
93618056--93618144
30
3.0
30
80
8
101
57
15
16
10
1.65
93618056--93618135
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
93618067--93618144
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
11
1.67
93621094--93621265
93
1.8
93
96
0
317
27
30
22
20
1.98
93621086--93621261
46
3.8
46
81
10
232
28
29
21
20
1.98
93623642--93623730
30
3.0
30
79
11
94
56
15
17
10
1.67
93623642--93623724
15
5.6
14
73
10
58
55
16
18
9
1.68
93623653--93623730
15
5.2
15
75
9
70
55
15
17
11
1.69
93628078--93628244
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
93636086--93636252
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
93638047--93638084
20
1.9
20
88
0
58
52
15
7
23
1.69
93639532--93639599
25
2.7
24
80
13
66
30
4
2
61
1.30
93646312--93646359
24
2.0
24
100
0
96
29
16
16
37
1.91
93647584--93647634
20
2.5
20
84
6
59
25
0
11
62
1.29
93672629--93672735
47
2.3
47
81
4
126
28
31
8
31
1.87
93672725--93672775
19
2.4
21
84
12
61
35
23
5
35
1.79
93672678--93672813
73
1.9
70
89
8
211
33
26
8
32
1.86
93678738--93678783
24
2.0
23
86
4
65
39
21
21
17
1.93
93678796--93678836
21
2.0
21
90
0
64
39
21
24
14
1.91
93678846--93678896
24
2.2
24
82
10
61
31
21
29
17
1.96
93681815--93681978
42
3.8
42
78
6
168
26
17
25
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93682422--93682460
19
2.1
19
100
0
78
15
10
30
43
1.80
93686946--93686987
2
21.0
2
100
0
84
50
0
0
50
1.00
93687642--93687858
49
4.5
49
89
3
343
30
28
6
34
1.82
93689117--93689145
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
93694511--93694652
41
3.6
39
83
4
126
30
23
16
28
1.96
93694547--93694652
41
2.6
41
89
0
158
33
23
16
27
1.95
93695224--93695281
27
2.1
27
81
6
64
29
36
18
15
1.92
93702706--93702827
54
2.3
54
90
5
185
34
13
24
27
1.93
93708196--93708538
46
7.5
46
96
0
605
36
15
25
22
1.93
93708512--93708558
20
2.3
20
96
3
85
36
8
29
25
1.86
93708466--93708603
66
2.1
65
94
2
240
38
13
25
23
1.90
93708420--93708648
112
2.0
113
92
2
381
37
14
26
21
1.92
93708374--93708696
158
2.0
158
88
2
479
39
14
25
21
1.91
93708540--93708707
46
3.7
46
82
4
187
41
15
23
19
1.89
93709820--93709861
3
14.0
3
100
0
84
66
0
0
33
0.92
93720728--93720910
39
4.6
39
86
0
231
22
30
22
24
1.99
93728712--93728893
39
4.6
39
87
2
240
23
30
22
24
1.99
93736624--93736739
36
3.2
35
83
11
160
21
31
20
26
1.98
93736593--93736732
39
3.7
38
84
10
187
22
30
21
26
1.99
93740186--93740350
40
4.2
40
80
5
167
24
26
22
26
2.00
93740202--93740310
39
2.8
39
84
6
132
23
29
22
23
1.99
93743578--93743735
43
3.7
42
70
15
117
24
17
25
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93746050--93746106
23
2.5
23
100
0
114
42
22
7
28
1.80
93747130--93747217
20
4.4
20
76
2
72
36
18
9
36
1.82
93747360--93747426
23
2.9
23
84
6
82
34
17
22
25
1.96
93749483--93749667
40
4.7
40
88
6
243
27
27
21
24
1.99
93757583--93757766
40
4.6
40
89
5
248
26
27
21
24
1.99
93758364--93758453
38
2.4
38
100
0
180
34
28
12
24
1.91
93772548--93772573
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
93773163--93773226
24
2.6
25
87
4
87
32
31
15
20
1.94
93773261--93773605
94
3.7
94
93
1
577
38
18
12
30
1.88
93780749--93780812
24
2.7
24
82
4
76
32
29
15
21
1.95
93780847--93781191
94
3.7
94
95
1
604
38
18
11
30
1.87
93782680--93782893
46
4.6
46
79
9
211
27
18
30
24
1.98
93788168--93788297
40
3.2
40
83
4
165
23
28
24
23
2.00
93791368--93791392
13
1.9
13
100
0
50
24
24
32
20
1.98
93791610--93791669
19
3.4
19
65
21
58
40
11
3
45
1.57
93791605--93791668
33
1.9
33
100
0
128
39
10
3
46
1.55
93794937--93795143
53
3.8
53
76
9
204
37
17
23
21
1.94
93802293--93802496
53
3.8
52
77
7
194
37
18
23
21
1.94
93807629--93807740
40
2.8
40
82
8
138
23
24
28
24
2.00
93807629--93807779
40
3.8
39
78
9
128
23
23
28
25
1.99
93817612--93817698
25
3.3
26
82
6
88
21
19
17
41
1.90
93817690--93817809
55
2.2
54
85
4
161
40
15
11
32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93817690--93817809
27
4.4
27
86
6
161
40
15
11
32
1.83
93823208--93823246
16
2.4
15
87
12
51
0
23
0
76
0.78
93824484--93824595
27
4.2
26
78
7
98
17
21
20
40
1.92
93833757--93833846
27
3.3
27
78
7
92
16
21
23
38
1.92
93840617--93840762
40
3.7
39
84
1
157
24
27
22
25
2.00
93840649--93840800
40
3.8
40
84
5
164
23
25
23
28
1.99
93848619--93848804
40
4.6
41
78
6
155
23
25
23
28
1.99
93852918--93853018
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
93852918--93853068
40
3.8
40
84
4
180
28
22
25
23
1.99
93852914--93853085
40
4.4
38
77
10
161
29
21
26
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770