Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  301  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91858689--91858763
18
3.7
22
85
10
74
36
9
16
38
1.80
91859007--91859040
18
1.9
17
88
5
50
29
0
0
70
0.87
91870730--91871024
78
3.8
78
86
2
396
32
17
23
26
1.96
91870730--91871024
156
1.9
156
88
2
450
32
17
23
26
1.96
91870964--91871187
45
4.9
45
76
7
202
32
15
25
26
1.95
91870964--91871202
90
2.6
90
79
5
259
32
15
25
27
1.95
91871543--91871633
19
4.9
19
88
8
143
38
12
14
35
1.83
91871543--91871656
19
5.8
22
84
10
78
37
10
14
36
1.81
91871923--91871956
17
2.0
17
88
0
50
29
0
0
70
0.87
91876080--91876112
16
2.1
16
100
0
66
48
6
12
33
1.65
91882766--91882845
20
4.0
19
83
8
88
62
1
0
36
1.03
91882766--91882830
29
2.2
30
86
2
96
63
0
0
36
0.95
91882766--91882831
10
6.7
10
87
3
89
62
0
0
37
0.96
91882834--91882878
22
2.1
22
87
4
65
55
4
0
40
1.20
91887258--91887295
20
1.9
20
84
10
51
55
5
2
36
1.37
91887437--91887492
25
2.3
25
84
3
69
64
3
1
30
1.21
91888055--91888124
36
1.9
37
82
8
90
48
1
2
47
1.25
91888941--91888979
12
3.3
11
86
13
51
66
5
2
25
1.25
91889656--91889710
25
2.1
27
83
16
71
38
12
5
43
1.66
91893558--91894113
44
12.1
44
75
8
362
30
19
15
34
1.93
91893599--91893863
146
1.8
146
79
3
309
30
21
13
33
1.93
91893804--91894061
140
1.8
140
84
1
356
30
19
16
33
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91893743--91894113
89
4.1
89
77
9
372
29
19
15
35
1.93
91897279--91897331
28
1.9
27
84
3
70
26
26
18
28
1.98
91897293--91897427
60
2.2
59
83
8
157
25
25
20
27
1.99
91899739--91899774
3
12.0
3
87
0
54
63
5
0
30
1.17
91901993--91902164
43
4.0
42
72
11
143
32
22
16
28
1.95
91903227--91903253
13
2.1
13
100
0
54
48
22
0
29
1.51
91907160--91907207
12
4.2
11
85
15
62
70
4
2
22
1.15
91907162--91907210
3
16.7
3
76
19
50
69
4
2
24
1.17
91907368--91907409
4
10.5
4
94
0
75
52
26
0
21
1.47
91907905--91907960
26
2.1
28
90
6
89
39
12
3
44
1.60
91912513--91912613
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
91982827--91982872
16
2.8
17
83
6
58
13
15
19
52
1.75
92009895--92009947
26
2.0
26
100
0
106
15
32
22
30
1.94
92018463--92018493
14
2.2
14
94
0
53
35
32
9
22
1.87
92027736--92027772
2
18.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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1.98
Indices
Period
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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