Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  494  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
152896813--152897219
138
3.0
138
90
6
628
39
7
5
46
1.57
152900227--152900304
29
2.7
29
81
0
93
21
32
17
28
1.96
152908083--152908155
29
2.6
29
80
2
85
21
32
17
27
1.96
152912564--152912601
6
6.5
6
93
6
69
84
0
15
0
0.63
152920073--152920132
27
2.3
26
85
2
75
35
20
23
21
1.96
152920129--152920164
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
152920199--152920250
27
2.0
26
84
3
68
34
21
26
17
1.95
152921900--152922067
45
3.8
45
82
1
185
27
16
11
44
1.82
152921900--152922030
44
3.0
44
85
1
181
28
18
9
44
1.80
152921901--152922067
89
1.9
89
82
0
208
27
16
11
44
1.82
152927050--152927233
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
152927090--152927278
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
152941667--152941784
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
152941635--152941798
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
152944911--152945018
26
4.2
26
91
0
180
35
24
8
32
1.85
152949906--152950113
40
5.2
40
82
2
229
25
23
26
24
2.00
152951471--152951550
41
2.0
41
92
2
135
31
25
18
25
1.98
152953383--152953430
22
2.1
23
85
11
64
72
4
8
14
1.23
152959352--152959398
20
2.3
20
92
7
78
36
10
19
34
1.86
152959446--152959553
25
4.4
24
84
10
121
27
21
22
28
1.99
152959457--152959565
49
2.2
51
83
9
136
24
24
22
28
1.99
152978003--152978212
40
5.2
40
88
2
305
21
28
24
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
152990536--152990702
40
4.2
41
80
5
164
24
26
22
26
2.00
152991527--152991572
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
152995301--152995440
44
3.3
42
80
4
136
28
16
22
32
1.95
153005075--153005138
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
153005330--153005448
24
5.0
24
85
9
154
26
24
21
27
1.99
153005330--153005448
47
2.5
48
89
8
172
26
24
21
27
1.99
153005499--153005558
20
3.0
20
90
0
102
31
20
11
36
1.88
153009067--153009334
50
5.4
50
79
3
288
30
26
17
26
1.97
153009067--153009344
100
2.8
100
85
2
317
30
26
16
26
1.97
153011822--153011963
24
6.0
24
90
5
218
28
21
21
28
1.99
153011843--153011962
23
5.1
23
93
3
204
29
20
21
28
1.98
153011843--153011964
47
2.6
47
97
0
226
28
20
22
28
1.98
153012021--153012077
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
153012009--153012079
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
153012014--153012068
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
153019923--153020111
24
8.0
24
89
5
287
28
21
21
28
1.99
153019944--153020110
23
7.1
23
91
3
271
29
20
21
28
1.98
153019944--153020112
47
3.6
47
96
0
311
28
20
21
28
1.98
153020169--153020225
9
5.9
9
73
15
51
35
21
8
35
1.84
153020157--153020227
20
3.5
20
94
0
124
32
21
11
35
1.89
153020162--153020216
11
5.4
11
70
16
55
30
20
12
36
1.90
153020264--153020311
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153024266--153024487
124
1.8
122
83
3
293
31
11
23
32
1.90
153024446--153024596
40
3.8
40
77
11
141
26
24
27
21
2.00
153024447--153024596
80
1.9
80
84
5
205
26
24
27
21
1.99
153032797--153033066
131
2.1
121
85
6
342
27
25
17
29
1.98
153037172--153037992
87
9.4
87
89
3
1179
33
21
24
20
1.97
153038045--153038251
45
4.5
45
75
8
164
32
17
21
28
1.96
153038265--153038622
88
4.1
88
88
0
509
29
25
19
25
1.98
153040010--153040487
3
159.3
3
70
11
180
30
7
3
58
1.41
153040219--153040261
22
2.0
22
90
0
68
27
6
2
62
1.33
153042448--153042619
84
2.0
87
92
6
287
27
15
18
38
1.90
153046020--153046425
210
1.9
210
85
1
562
31
22
14
32
1.93
153050314--153050346
17
2.1
16
88
11
50
30
0
0
69
0.88
153050393--153050451
21
2.8
22
80
7
61
22
0
8
69
1.15
153052245--153052281
10
3.7
10
86
13
58
18
8
2
70
1.25
153052805--153052830
12
2.2
12
100
0
52
7
15
30
46
1.74
153052836--153053051
41
5.4
41
90
1
296
33
23
25
17
1.96
153053209--153053253
14
3.2
14
80
0
54
26
0
24
48
1.51
153053224--153053320
49
2.0
46
88
5
140
29
4
25
40
1.74
153053803--153053979
41
4.3
40
82
5
178
39
21
22
16
1.92
153053833--153053980
41
3.6
41
83
5
185
39
20
22
16
1.91
153054141--153054238
7
13.4
7
70
8
52
26
2
25
45
1.64
153054149--153054233
21
3.9
21
75
17
91
27
2
27
43
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153054156--153054249
46
2.0
46
95
0
170
28
3
26
41
1.71
153054299--153054396
36
2.7
37
80
10
96
20
0
41
37
1.52
153054276--153054397
7
17.1
7
68
11
61
20
0
40
38
1.53
153055612--153055675
25
2.6
25
92
0
101
20
35
12
31
1.90
153058797--153058920
43
2.9
43
93
0
203
22
20
30
25
1.98
153063439--153063535
30
3.2
30
75
2
97
27
15
27
28
1.96
153064831--153064927
30
3.2
30
76
2
106
27
16
27
27
1.97
153065903--153065986
30
2.8
30
70
0
78
28
16
26
28
1.97
153066866--153066949
19
4.1
19
71
24
64
25
2
2
70
1.11
153066866--153066942
6
12.5
6
72
10
57
23
2
2
71
1.11
153066908--153066949
20
2.1
20
86
8
59
21
0
4
73
1.01
153066894--153066942
13
3.9
13
76
12
50
20
0
4
75
0.96
153067198--153067382
43
4.3
43
88
0
244
22
21
32
23
1.98
153071670--153071703
2
17.0
2
100
0
68
50
0
50
0
1.00
153073693--153073761
35
2.0
35
91
5
113
53
8
2
34
1.47
153075823--153075860
13
2.8
13
96
4
67
86
5
2
5
0.76
153076061--153076118
26
2.3
24
88
5
80
24
3
18
53
1.60
153076615--153076820
3
67.7
3
71
13
109
26
7
3
62
1.39
153076960--153077039
21
4.0
21
76
12
69
27
7
1
63
1.29
153077130--153077160
15
2.1
15
100
0
62
32
6
0
61
1.21
153077140--153077177
18
2.1
18
85
9
51
31
10
0
57
1.32
153083692--153083858
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153083692--153083858
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
153084683--153084728
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
153091688--153091854
40
4.2
40
82
2
185
25
27
21
25
1.99
153091688--153091854
80
2.1
79
83
7
205
25
27
21
25
1.99
153092679--153092724
17
2.5
19
74
22
53
34
23
17
23
1.96
153103869--153103895
13
2.1
13
100
0
54
18
22
14
44
1.86
153110860--153110910
25
2.0
25
88
0
75
33
21
19
25
1.97
153110950--153110989
10
3.9
10
87
6
62
30
20
20
30
1.97
153111035--153111104
25
2.8
25
91
0
104
25
25
24
24
2.00
153111325--153111408
31
2.7
31
88
1
125
34
17
23
23
1.96
153113598--153113750
27
5.7
26
78
11
132
39
23
7
28
1.83
153113590--153113793
27
7.6
27
72
17
86
39
22
7
30
1.82
153113590--153113768
54
3.3
54
80
6
193
40
22
8
29
1.83
153113744--153113912
27
6.2
27
86
0
221
31
23
6
39
1.80
153113744--153113912
54
3.1
53
90
4
248
31
23
6
39
1.80
153113767--153113939
54
3.2
53
75
14
147
27
20
9
41
1.84
153114148--153114199
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
153114416--153114484
6
11.3
6
74
20
63
18
15
15
49
1.80
153118163--153118285
50
2.5
50
82
7
139
34
14
22
27
1.93
153119604--153119638
12
2.9
12
95
0
61
48
11
17
22
1.79
153119632--153119686
25
2.2
26
76
3
58
49
12
18
20
1.79
153120052--153120116
22
3.0
22
80
8
78
33
23
23
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
153120570--153120869
27
11.3
27
90
4
414
24
20
19
35
1.95
153120562--153120869
53
5.8
52
89
4
422
24
20
19
35
1.95
153120562--153120869
80
3.9
79
88
5
451
24
20
19
35
1.95
153120860--153120989
27
4.8
27
84
0
170
36
9
24
29
1.86
153120860--153121009
81
1.9
81
86
0
219
36
9
23
30
1.86
153125160--153125324
39
4.2
40
79
5
167
24
27
21
26
2.00
153133642--153133693
27
2.0
26
84
3
68
17
26
21
34
1.95
153133730--153133754
13
1.9
13
100
0
50
52
8
0
40
1.31
153133751--153133810
27
2.3
26
85
2
75
21
23
20
35
1.96
153141012--153141201
67
2.8
67
89
4
274
17
27
21
34
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770