Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  546  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169813513--169813681
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
169817007--169817044
20
1.9
20
94
0
67
21
0
5
73
1.02
169820559--169820610
25
2.0
26
85
3
70
25
13
23
38
1.91
169822089--169822168
25
3.2
26
96
3
146
36
26
6
31
1.81
169827578--169827626
25
1.9
26
83
4
64
24
14
22
38
1.91
169829104--169829185
26
3.2
26
94
0
146
36
25
6
31
1.81
169834975--169835062
45
2.0
45
90
0
140
39
15
21
22
1.91
169835530--169835613
28
3.0
27
86
10
125
57
7
16
19
1.62
169837326--169837511
10
18.8
10
68
24
58
32
5
1
60
1.26
169837315--169837375
20
3.0
21
80
17
76
34
3
0
62
1.12
169837385--169837561
19
9.6
18
62
24
57
31
3
1
62
1.23
169840623--169840649
14
1.9
14
100
0
54
44
7
3
44
1.49
169843262--169843320
14
4.8
13
71
25
56
84
0
11
3
0.73
169843262--169843319
13
4.8
13
76
20
54
84
0
12
3
0.74
169843262--169843324
21
3.0
22
88
6
87
84
0
11
4
0.77
169844269--169844741
119
4.0
119
94
1
797
33
17
19
29
1.95
169844659--169844846
83
2.3
83
89
3
290
34
18
19
28
1.95
169845715--169845752
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
169846487--169846571
35
2.4
33
74
18
82
31
4
2
61
1.29
169846555--169846636
24
3.4
24
72
12
71
28
2
3
65
1.22
169847177--169847210
16
2.1
17
88
5
52
23
11
8
55
1.63
169848338--169848371
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169849086--169849289
40
5.1
39
81
9
191
26
21
26
25
1.99
169849086--169849303
79
2.7
78
76
11
212
27
21
26
25
1.99
169857141--169857326
40
4.7
40
88
5
218
25
21
26
26
1.99
169857194--169857349
80
2.0
79
82
8
192
26
20
26
26
1.99
169866509--169866538
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
169867348--169867383
16
2.3
16
90
4
56
8
0
30
61
1.26
169867379--169867413
16
2.2
16
90
10
54
0
8
2
88
0.61
169868059--169868637
88
7.0
83
71
15
299
36
18
16
27
1.93
169868227--169868288
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
169868398--169868778
79
5.0
76
79
6
375
33
18
16
30
1.94
169868437--169868964
72
6.8
73
75
12
423
33
19
17
29
1.95
169868803--169868964
74
2.1
75
85
7
222
32
20
18
28
1.97
169868634--169869289
165
4.0
165
90
3
929
33
20
18
27
1.96
169868958--169869129
73
2.3
77
84
6
235
32
20
19
27
1.97
169869109--169869143
14
2.5
14
90
0
52
57
5
20
17
1.60
169869312--169869417
54
1.9
54
85
9
144
38
18
14
28
1.90
169869119--169869573
72
6.3
71
70
11
266
37
21
16
24
1.93
169869573--169869835
70
3.7
71
83
5
347
38
22
14
25
1.91
169869411--169870002
262
2.3
257
94
2
1024
36
22
14
25
1.93
169875136--169875171
12
3.0
12
87
0
54
41
5
27
25
1.77
169875132--169875163
16
1.9
17
93
6
57
40
6
28
25
1.79
169877405--169877434
11
2.7
11
89
0
51
60
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169878282--169878315
12
2.9
11
91
8
50
0
8
2
88
0.62
169878282--169878318
17
2.2
17
90
9
58
0
8
2
89
0.58
169883330--169883368
19
2.1
19
86
13
55
66
10
7
15
1.43
169884460--169884535
19
4.1
18
76
3
71
40
0
2
56
1.13
169884531--169884584
20
2.7
20
88
11
76
31
0
5
62
1.18
169888017--169888104
44
2.0
44
84
8
117
29
17
17
36
1.92
169888491--169888692
55
3.7
53
83
9
237
37
17
13
30
1.89
169888661--169888829
71
2.3
72
85
5
225
29
22
16
31
1.96
169888865--169888996
71
1.9
71
90
0
210
28
23
17
31
1.97
169888705--169889566
319
2.7
320
98
0
1665
32
21
17
29
1.95
169888705--169889566
160
5.4
160
98
0
1665
32
21
17
29
1.95
169889023--169889315
71
3.9
71
69
14
226
31
21
16
30
1.95
169889342--169889475
71
1.9
71
90
0
214
29
23
16
30
1.96
169906246--169906315
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
169914053--169914122
27
2.6
27
95
2
122
30
27
14
28
1.95
169931206--169931252
25
1.9
24
91
4
76
40
4
2
53
1.32
169932048--169932098
26
2.0
26
92
0
84
29
7
19
43
1.79
169933589--169933626
18
2.1
18
85
9
51
28
7
2
60
1.38
169934812--169934872
30
2.0
30
100
0
122
59
19
3
18
1.52
169936935--169937083
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
169936976--169937083
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
169949425--169949557
39
3.4
39
89
0
194
24
27
19
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
169953354--169953396
21
2.0
21
90
0
68
41
4
13
39
1.66
169967118--169967188
15
4.7
15
79
6
65
12
15
15
56
1.68
169971622--169971651
14
2.1
15
93
6
53
63
13
10
13
1.52
169972908--169973123
43
5.0
43
81
2
231
31
24
15
28
1.96
169981294--169981618
100
3.2
100
98
0
614
32
8
28
31
1.86
169981294--169981626
151
2.2
150
95
2
605
33
7
27
31
1.85
169981294--169981618
51
6.5
51
96
2
604
32
8
28
31
1.86
169981591--169981723
48
2.8
48
90
0
203
37
6
24
31
1.81
169981294--169981674
151
2.5
150
89
3
491
34
7
27
31
1.85
169981763--169981845
37
2.2
37
93
6
141
20
20
32
26
1.97
169984125--169984211
45
1.9
45
90
0
138
22
11
25
40
1.88
169985325--169985422
50
2.0
50
89
4
153
13
25
32
28
1.93
169987019--169987132
42
2.7
43
78
4
124
26
21
26
25
2.00
169991304--169991463
29
5.6
29
87
3
198
26
16
31
25
1.96
169991300--169991464
57
2.9
57
84
6
201
27
15
31
25
1.96
169991304--169991462
86
1.8
86
85
2
221
26
16
31
25
1.96
169997028--169997176
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
169997069--169997176
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
170002875--170003023
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
170002916--170003023
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
170009278--170009306
11
2.5
12
94
5
51
48
0
17
34
1.47
170010837--170011012
46
3.8
46
80
10
223
20
21
29
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
170010833--170011004
93
1.8
93
94
0
308
20
21
30
27
1.98
170019155--170019342
40
4.7
40
89
2
252
26
26
22
24
2.00
170021991--170022028
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
170023656--170023724
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
170029997--170030034
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
170031660--170031685
12
2.2
12
100
0
52
46
30
0
23
1.53
170033629--170033812
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
170033669--170033857
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
170041717--170041900
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
170041757--170041945
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
170045662--170045882
39
5.6
39
88
5
279
25
26
22
25
2.00
170049799--170049910
27
4.2
26
84
7
134
37
22
24
16
1.93
170049799--170049910
54
2.1
54
86
3
154
37
22
24
16
1.93
170050327--170050356
16
1.9
15
93
6
51
3
20
23
53
1.60
170056707--170056733
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
170057938--170058053
42
2.7
42
82
6
144
26
27
20
25
1.99
170058344--170058400
28
2.0
28
96
0
105
38
10
8
42
1.71
170058811--170058907
42
2.3
42
83
1
113
26
27
19
25
1.99
170059055--170059208
79
1.9
79
93
0
263
44
15
4
35
1.67
170060156--170060180
13
1.9
13
100
0
50
48
0
0
52
1.00
170062869--170062972
43
2.4
43
91
1
163
23
23
27
25
2.00
170063553--170063585
16
1.9
18
88
11
52
18
12
18
51
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
170066260--170066447
49
3.8
49
88
1
241
27
18
25
28
1.98
170070869--170071054
40
4.7
40
82
7
202
25
23
25
25
2.00
170077144--170077293
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
170077168--170077351
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
170081609--170081758
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
170081633--170081816
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
170081947--170082012
30
2.2
31
97
2
125
27
9
30
33
1.88
170086062--170086211
67
2.2
67
81
8
171
32
17
28
21
1.96
170086086--170086269
67
2.8
64
77
8
194
29
17
29
22
1.97
170086408--170086458
23
2.3
22
96
3
93
25
11
31
31
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770