Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  690  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217439226--217439687
48
9.6
48
97
0
870
31
27
8
33
1.86
217441195--217441219
13
1.9
13
100
0
50
36
16
16
32
1.90
217443361--217443589
40
5.6
40
89
5
343
26
28
20
24
1.99
217443558--217443706
40
3.7
40
79
5
149
27
28
20
23
1.99
217443363--217443681
165
1.9
165
79
6
360
27
29
19
24
1.98
217446282--217446378
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
217448489--217448571
30
2.7
30
81
9
89
13
21
1
63
1.35
217448522--217448577
18
3.1
18
76
5
51
7
19
3
69
1.27
217448547--217448571
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
217448574--217448604
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
217448652--217448718
5
13.0
5
75
21
59
2
17
1
77
0.97
217448652--217448714
31
2.1
29
85
11
83
3
17
1
77
0.97
217448650--217448718
15
4.4
16
78
12
81
2
18
1
76
0.98
217449633--217449672
10
3.9
10
93
6
71
17
0
10
72
1.11
217449621--217449672
21
2.4
22
93
3
88
17
1
9
71
1.22
217451369--217451465
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
217451882--217451978
30
3.2
30
70
8
81
27
14
28
28
1.95
217451114--217452142
513
2.0
515
97
1
1960
33
16
22
28
1.95
217454083--217454154
30
2.4
31
81
11
87
13
23
1
61
1.41
217454228--217454288
5
12.0
5
77
16
63
3
18
1
77
0.99
217454228--217454284
30
1.9
30
85
7
80
3
17
1
77
1.00
217457669--217457716
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217464212--217464241
12
2.6
12
94
5
53
13
6
6
73
1.24
217464606--217464653
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
217465895--217465937
19
2.3
19
87
0
59
25
16
34
23
1.95
217469356--217469498
41
3.5
41
88
0
189
26
19
26
27
1.99
217469354--217469539
41
4.6
40
82
2
185
24
20
27
27
1.99
217469340--217469539
81
2.5
78
81
8
231
24
20
28
27
1.99
217469340--217469565
81
2.8
77
75
14
206
24
19
28
27
1.99
217473733--217473895
39
4.2
39
93
0
263
23
20
31
24
1.98
217473733--217473925
39
4.9
39
90
0
251
23
21
31
23
1.98
217481706--217481818
39
2.9
39
93
1
181
23
21
31
23
1.98
217481703--217481847
79
1.8
79
83
4
195
22
21
31
24
1.98
217485922--217485966
20
2.2
20
88
0
63
48
2
13
35
1.54
217486476--217486622
57
2.6
57
76
11
149
29
17
19
33
1.95
217488937--217489067
29
4.5
29
78
5
122
25
17
32
25
1.97
217496994--217497124
29
4.5
29
78
5
122
25
17
32
25
1.97
217506868--217507107
40
6.1
40
85
8
300
25
27
22
24
2.00
217506887--217507107
115
1.9
120
85
8
312
26
27
22
23
1.99
217513909--217514129
122
1.8
122
86
2
318
31
10
23
33
1.90
217514126--217514255
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
217521878--217522098
122
1.8
122
86
2
318
31
10
23
33
1.90
217522095--217522224
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
217527451--217527994
213
2.6
213
91
4
860
28
22
9
39
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217527451--217527992
27
20.6
27
82
9
633
28
22
9
39
1.85
217527432--217528003
79
7.2
80
81
10
405
29
22
9
38
1.85
217529308--217529364
9
5.9
9
73
15
51
35
8
21
35
1.84
217529306--217529368
20
3.2
20
95
0
117
36
12
19
31
1.89
217529423--217529612
24
8.0
24
89
3
269
28
23
22
25
1.99
217529805--217529868
31
2.1
31
87
0
92
34
17
23
25
1.96
217533844--217534019
46
3.8
46
81
10
232
20
21
29
28
1.98
217533840--217534011
93
1.8
93
96
0
317
20
22
30
27
1.98
217536963--217537031
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
217536954--217537041
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
217539408--217539583
46
3.8
46
80
12
225
21
21
28
28
1.98
217539405--217539575
93
1.8
93
96
0
315
21
21
29
28
1.98
217544738--217544816
29
2.7
29
86
5
106
27
32
15
24
1.95
217554372--217554420
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
217555240--217555405
40
4.2
40
78
8
162
25
22
27
24
2.00
217555240--217555389
79
1.9
79
84
5
205
26
22
27
24
2.00
217563242--217563408
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
217569681--217569870
29
6.6
29
91
1
292
33
15
21
30
1.94
217572238--217572290
6
9.2
6
95
4
92
16
0
0
83
0.66
217579045--217579129
41
2.1
41
97
0
161
42
23
15
18
1.88
217595429--217595453
13
1.9
13
100
0
50
64
8
0
28
1.22
217595678--217595726
10
4.8
10
80
14
55
40
22
22
14
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217595678--217595726
21
2.4
21
89
3
73
40
22
22
14
1.90
217599034--217599130
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
217601453--217601500
15
3.3
15
73
5
53
43
25
0
31
1.55
217601713--217601762
11
4.5
11
82
9
66
80
8
0
12
0.92
217601712--217601756
22
2.0
23
91
4
74
77
6
0
15
0.96
217602782--217602837
30
1.9
28
85
7
76
53
3
30
12
1.55
217606067--217606125
29
2.1
28
90
3
91
42
27
0
30
1.56
217606073--217606120
15
3.3
15
73
5
53
43
25
0
31
1.55
217615932--217615965
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
217617727--217617956
40
5.8
40
94
0
399
22
28
23
24
1.99
217617700--217617960
80
3.3
80
92
2
420
22
27
24
26
2.00
217625777--217626005
39
5.9
39
93
4
401
24
28
22
24
1.99
217625752--217626006
79
3.3
79
90
7
400
23
28
23
25
2.00
217633723--217633865
75
1.9
77
95
2
263
23
29
22
24
1.99
217633723--217633865
40
3.7
39
92
6
247
23
29
22
24
1.99
217636545--217636674
40
3.2
40
83
4
165
22
25
29
23
1.99
217644663--217644792
40
3.2
40
83
4
165
22
25
29
23
1.99
217650030--217650237
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
217650031--217650237
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
217657257--217657464
40
5.2
40
84
0
218
25
22
25
25
2.00
217657258--217657464
80
2.6
80
83
4
247
25
22
26
25
2.00
217663296--217663462
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217663312--217663462
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
217671298--217671464
40
4.2
40
81
2
176
24
27
22
25
2.00
217671314--217671464
80
1.9
79
83
6
198
23
27
22
25
2.00
217676624--217676783
41
3.9
41
74
12
150
21
22
28
27
1.99
217677310--217677335
13
2.0
13
100
0
52
15
15
7
61
1.55
217678375--217678475
25
4.0
25
74
2
96
28
24
21
24
1.99
217682812--217682977
40
4.2
39
81
3
172
24
27
22
25
2.00
217682828--217682977
79
1.9
79
84
5
205
24
27
22
26
2.00
217684161--217684267
54
2.1
50
82
10
126
27
14
18
40
1.89
217689179--217689358
41
4.5
40
81
4
168
24
25
23
27
2.00
217697211--217697415
39
5.2
40
81
4
197
25
26
21
26
1.99
217699260--217699438
71
2.7
65
78
10
191
27
21
24
26
1.99
217701312--217701349
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
217704116--217704211
27
3.5
28
84
7
126
44
25
10
19
1.82
217711473--217711640
40
4.2
40
77
3
151
22
26
23
27
2.00
217713498--217713706
40
5.2
40
87
2
296
25
23
28
22
1.99
217718038--217718098
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
217722474--217722534
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
217725675--217725712
19
2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
217725942--217726112
93
1.8
93
87
0
252
29
26
21
23
1.99
217725937--217726109
46
3.7
46
74
10
163
30
25
20
23
1.99
217729211--217729432
48
4.7
48
74
9
215
27
20
24
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
217731987--217732190
40
5.1
40
87
4
263
26
28
22
22
1.99
217733339--217733367
9
3.3
9
90
9
51
89
0
0
10
0.48
217740233--217740302
27
2.6
27
93
2
113
28
30
14
27
1.95
217741653--217741699
23
2.0
23
100
0
94
25
25
8
40
1.84
217744969--217745034
29
2.3
29
92
5
107
42
12
10
34
1.77
217748119--217748267
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
217748160--217748267
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
217756226--217756374
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
217756267--217756374
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
217762907--217763089
66
2.8
64
78
9
203
28
16
30
23
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770