Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  349  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107014608--107014634
2
13.5
2
100
0
54
51
0
0
48
1.00
107020064--107020318
39
6.5
39
88
3
352
29
27
21
21
1.99
107022852--107022933
26
3.2
26
94
0
146
32
26
7
32
1.84
107024050--107024100
8
6.4
8
77
8
50
52
17
21
7
1.69
107024050--107024100
24
2.1
24
85
7
68
52
17
21
7
1.69
107024311--107024425
29
4.0
29
84
6
137
26
15
28
28
1.96
107025511--107025545
18
2.0
18
88
5
54
37
17
17
28
1.92
107027302--107027474
46
3.8
45
77
14
183
22
19
27
30
1.98
107027299--107027469
93
1.8
93
91
2
281
22
19
28
29
1.98
107031176--107031306
40
3.3
40
83
2
174
25
27
22
24
2.00
107039173--107039340
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
107044284--107044447
71
2.3
71
98
0
319
19
28
17
35
1.94
107044284--107044481
71
2.8
70
90
3
249
21
28
16
33
1.95
107045719--107045747
13
2.2
13
100
0
58
62
10
0
27
1.28
107045972--107046019
10
4.7
10
80
14
53
41
22
20
14
1.89
107045972--107046019
21
2.3
21
89
3
71
41
22
20
14
1.89
107046712--107046809
29
3.4
28
80
9
108
27
28
15
28
1.96
107048087--107048132
19
2.4
19
85
10
58
26
34
15
23
1.94
107049824--107049859
16
2.2
17
95
5
65
8
5
33
52
1.55
107050418--107050475
14
4.0
15
77
6
66
51
27
0
20
1.47
107050416--107050470
22
2.5
22
77
13
60
54
25
0
20
1.44
107050418--107050475
29
2.0
29
89
0
89
51
27
0
20
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107050454--107053780
849
3.9
845
77
9
3074
31
17
13
37
1.89
107052133--107052166
7
4.9
7
92
0
59
44
41
0
14
1.45
107063508--107063532
8
3.1
8
100
0
50
24
0
24
52
1.48
107067767--107067934
43
4.0
41
81
9
176
25
17
23
33
1.96
107069907--107070517
48
12.8
48
85
4
636
24
29
19
27
1.98
107078221--107078308
6
14.3
6
73
17
74
47
13
18
20
1.82
107078230--107078308
31
2.5
31
89
0
113
48
12
18
20
1.81
107078825--107079075
27
9.3
27
83
4
278
25
19
17
37
1.94
107078826--107079073
134
1.9
134
89
0
388
25
20
17
36
1.94
107079055--107079776
27
26.7
27
82
0
663
32
9
20
38
1.84
107079166--107079776
27
22.6
27
84
0
691
32
8
20
38
1.83
107079166--107079776
54
11.3
54
86
0
783
32
8
20
38
1.83
107081711--107081798
6
14.3
6
73
17
74
47
14
18
19
1.82
107081720--107081798
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0
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18
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107082314--107082511
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7.3
27
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54
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18
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1.96
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54
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54
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19
17
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1.93
107082318--107082509
81
2.4
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88
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278
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19
17
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1.93
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1.83
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108
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107082602--107082942
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27
84
0
439
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20
39
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107083956--107084180
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48
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1.98
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1.9
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80
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19
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160
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1
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29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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2.0
233
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1.96
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2.9
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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