Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  644  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202394514--202396197
843
2.0
843
99
0
3325
32
23
13
29
1.94
202403390--202403603
36
5.6
38
84
10
233
25
27
21
25
2.00
202403390--202403603
76
2.8
76
80
13
253
25
27
21
25
2.00
202411972--202412097
40
3.2
40
82
10
143
23
25
29
22
1.99
202422723--202422884
39
4.2
39
87
1
227
24
32
19
24
1.98
202427807--202427977
40
4.3
39
77
10
159
28
21
26
23
1.99
202435900--202436000
39
2.5
40
85
1
132
30
22
24
21
1.99
202435900--202436082
40
4.6
40
82
3
181
27
22
26
23
1.99
202440569--202440678
41
2.8
40
79
10
118
24
23
28
23
2.00
202448714--202448864
40
3.8
40
80
6
164
26
23
27
23
2.00
202448751--202448880
40
3.2
40
82
2
163
23
23
27
25
2.00
202455161--202455206
20
2.2
21
92
7
85
13
28
10
47
1.76
202456877--202457037
29
5.6
29
81
4
83
25
32
16
26
1.96
202456876--202457037
58
2.8
59
85
3
195
25
32
16
26
1.96
202459916--202460122
40
5.2
39
82
2
200
25
25
22
27
2.00
202459916--202460120
79
2.6
81
82
5
238
24
25
22
26
2.00
202467893--202468100
40
5.2
39
84
1
209
25
25
22
26
2.00
202467893--202468098
80
2.6
81
84
3
247
24
26
22
26
2.00
202475918--202475991
29
2.6
29
89
4
105
25
16
32
25
1.96
202482487--202482639
40
3.8
38
77
8
137
25
28
22
23
2.00
202490486--202490584
40
2.5
39
85
1
126
25
29
22
23
1.99
202490486--202490635
39
3.8
39
80
6
151
25
28
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202499498--202499621
39
3.2
39
88
3
189
27
29
21
21
1.99
202503598--202503646
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
202504463--202504629
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
202511590--202511638
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
202512457--202512607
40
3.8
40
79
6
155
26
23
27
23
2.00
202514224--202514295
34
2.1
34
97
0
135
34
2
30
31
1.72
202517821--202517907
34
2.6
34
83
3
95
27
24
25
22
2.00
202522840--202523011
93
1.8
93
89
0
272
28
28
20
22
1.99
202522832--202523007
46
3.8
46
79
10
196
29
27
20
22
1.98
202522883--202523026
46
3.1
46
71
18
127
30
27
19
22
1.98
202525847--202525956
40
2.8
40
85
0
148
23
26
23
26
2.00
202546717--202546899
79
2.3
81
83
7
223
23
23
27
25
2.00
202546717--202546920
40
5.1
39
79
11
209
24
23
27
25
2.00
202546751--202546934
79
2.3
77
80
10
201
26
22
26
25
2.00
202554779--202554963
40
4.7
40
82
7
218
23
22
28
25
2.00
202554779--202554961
79
2.3
81
85
7
241
24
22
27
25
2.00
202554780--202554996
79
2.7
78
79
12
237
25
22
27
24
2.00
202564228--202564447
40
5.6
40
83
4
259
25
26
23
24
2.00
202569065--202569272
40
5.2
39
82
3
202
25
25
23
25
2.00
202569065--202569271
80
2.6
80
82
3
238
25
26
23
25
2.00
202578176--202578278
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
202586148--202586250
29
3.6
29
81
2
118
21
16
33
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202588275--202588482
40
5.2
39
81
3
193
25
25
23
25
2.00
202588275--202588481
80
2.6
80
81
5
231
25
26
23
24
2.00
202596319--202596526
40
5.2
39
82
3
202
25
25
23
25
2.00
202596319--202596525
80
2.6
80
82
3
238
25
26
23
25
2.00
202600875--202601053
39
4.6
38
79
8
166
27
22
26
23
2.00
202608997--202609140
40
3.7
38
78
8
128
24
22
28
24
2.00
202609002--202609185
79
2.3
79
80
4
192
21
23
30
24
1.99
202615899--202615931
16
1.9
18
88
11
52
48
12
15
24
1.78
202616457--202616675
45
5.0
45
85
5
252
23
28
21
26
1.99
202616457--202616675
88
2.5
89
84
3
275
23
28
21
26
1.99
202617196--202617221
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
202617493--202617603
47
2.4
47
95
0
195
45
13
9
30
1.76
202617515--202617625
47
2.6
43
88
9
156
47
11
10
29
1.74
202625898--202625979
33
2.4
35
87
6
114
23
34
19
23
1.97
202626022--202626216
47
4.2
48
92
3
310
31
29
6
33
1.82
202626212--202626771
47
11.9
48
86
8
714
29
27
8
34
1.87
202626208--202626770
96
6.0
94
87
8
797
28
27
8
34
1.87
202626208--202626767
230
2.4
234
89
6
877
28
27
8
34
1.87
202630128--202630178
25
2.0
27
81
11
63
29
33
7
29
1.85
202634211--202634280
4
17.2
4
91
8
115
74
0
25
0
0.82
202639983--202640111
47
2.8
47
95
1
224
20
20
29
30
1.97
202642550--202642716
46
3.6
45
83
6
185
25
19
32
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202642599--202642759
46
3.6
44
85
8
184
23
20
31
24
1.98
202646084--202646260
47
3.8
46
80
13
218
20
20
29
29
1.98
202648696--202648862
46
3.6
45
83
6
185
25
19
32
22
1.98
202648745--202648905
46
3.6
44
85
8
184
23
20
31
24
1.98
202652222--202652398
47
3.8
46
80
13
218
20
20
29
29
1.98
202654837--202655003
46
3.6
45
83
6
185
25
19
32
22
1.98
202654886--202655046
46
3.6
44
85
8
184
23
20
31
24
1.98
202658368--202658544
47
3.8
46
80
13
218
20
20
29
29
1.98
202660688--202660859
40
4.3
40
80
7
172
25
22
27
25
2.00
202663576--202663618
19
2.4
19
84
7
54
48
0
9
41
1.35
202667796--202667839
19
2.4
19
85
7
56
50
0
9
40
1.34
202677522--202677941
48
8.8
48
96
0
761
35
6
27
30
1.82
202677522--202677929
191
2.1
192
96
0
755
35
6
27
30
1.82
202678086--202678258
37
4.7
37
96
0
310
23
18
32
25
1.97
202679532--202679809
40
7.0
40
93
0
468
20
21
30
28
1.98
202679533--202679809
119
2.3
120
92
1
466
20
21
30
27
1.98
202679973--202680023
25
2.0
25
81
7
59
35
13
29
21
1.92
202684607--202684654
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
202684698--202684756
20
3.0
20
97
0
109
37
10
20
32
1.86
202684702--202684756
11
5.4
11
70
16
55
38
10
20
30
1.87
202684807--202684901
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
202684808--202684901
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202685093--202685187
38
2.5
38
91
1
154
35
16
25
22
1.95
202692886--202692933
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
202692977--202693035
20
3.0
20
92
0
100
37
11
20
30
1.89
202693086--202693179
47
2.0
49
85
12
133
27
21
24
26
1.99
202693085--202693179
24
4.0
24
85
10
124
28
21
24
26
1.99
202693394--202693509
31
3.5
31
80
15
142
41
14
20
23
1.89
202693371--202693532
38
4.4
38
84
12
232
38
16
22
22
1.93
202693371--202693509
69
2.0
68
97
1
260
39
15
21
23
1.91
202697120--202697270
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
202697157--202697286
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
202705116--202705266
40
3.8
40
77
13
134
27
23
26
22
2.00
202705153--202705282
40
3.2
40
77
4
138
24
23
27
23
2.00
202706637--202706771
43
2.9
48
64
16
113
28
25
20
26
1.99
202721930--202721978
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
202722801--202722967
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
202729720--202729762
22
2.0
22
81
9
52
23
18
13
44
1.86
202739754--202739786
17
2.0
16
94
5
57
39
0
0
60
0.97
202740707--202740742
15
2.4
15
82
17
56
25
5
22
47
1.73
202742424--202742606
40
4.6
39
79
5
145
24
24
27
23
2.00
202742424--202742608
79
2.3
82
83
7
229
24
24
27
23
2.00
202747559--202747874
46
6.7
46
75
10
212
25
27
18
28
1.98
202747661--202747874
94
2.3
94
81
1
250
24
27
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
202751070--202751309
119
2.0
118
88
7
353
23
23
26
26
2.00
202751070--202751309
79
3.0
80
87
5
330
23
23
26
26
2.00
202751070--202751309
40
6.1
40
89
5
337
23
23
26
26
2.00
202760951--202761078
40
3.3
39
80
4
159
24
28
23
23
1.99
202760967--202761116
40
3.8
40
79
5
162
22
27
24
26
1.99
202774441--202774474
15
2.2
16
89
5
52
26
0
8
64
1.22
202780867--202781034
40
4.2
40
79
1
158
22
27
23
26
2.00
202780883--202781032
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
202788857--202789005
40
3.8
40
77
11
148
21
27
24
26
1.99
202788857--202789004
80
1.9
78
84
8
201
20
27
24
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770