Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  129  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37694402--37694565
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
37694402--37694599
71
2.8
70
92
3
276
20
28
17
33
1.95
37719532--37719580
10
4.9
10
82
9
64
22
10
0
67
1.20
37723172--37723264
5
17.6
5
75
22
84
19
1
0
79
0.79
37723184--37723249
7
8.9
7
84
14
62
21
0
0
78
0.75
37723183--37723263
32
2.5
32
93
2
135
20
0
0
79
0.74
37729193--37729420
113
2.0
113
99
0
447
26
22
15
35
1.94
37733603--37733628
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
37736044--37736076
12
2.7
13
90
9
52
51
24
6
18
1.68
37740594--37740622
10
2.9
10
100
0
58
31
6
10
51
1.62
37741922--37742187
46
6.0
45
85
8
339
21
23
15
39
1.92
37742100--37742175
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
37744323--37744374
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
37747213--37747478
46
6.0
45
85
8
339
21
23
15
39
1.92
37747391--37747466
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
37749616--37749667
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
37757244--37757349
49
2.2
49
83
6
126
23
26
17
32
1.97
37757305--37757390
25
3.4
24
79
6
73
19
24
23
32
1.98
37759837--37759913
38
2.0
38
100
0
154
45
5
10
38
1.61
37759841--37759902
17
3.3
19
67
24
58
45
3
8
43
1.49
37768678--37768742
25
2.9
23
80
15
66
66
7
0
26
1.19
37768704--37768742
19
2.0
20
90
5
62
71
7
0
20
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37769074--37769119
25
1.9
23
86
8
65
63
8
0
28
1.24
37768620--37769424
395
2.0
397
98
0
1553
52
10
8
29
1.64
37774359--37774657
3
97.7
3
65
21
65
31
5
4
59
1.39
37774361--37774406
23
2.0
23
83
8
58
28
6
0
65
1.17
37774682--37774760
24
3.2
24
71
12
72
35
1
6
56
1.32
37774710--37774810
12
8.4
12
68
19
68
34
0
3
60
1.22
37774697--37774778
23
3.4
23
71
22
60
35
1
3
59
1.23
37774757--37774817
11
5.2
12
73
26
60
34
1
1
62
1.15
37774755--37774871
21
5.2
22
79
15
100
35
3
3
58
1.32
37774746--37774877
34
4.0
32
70
19
92
35
3
3
58
1.29
37774755--37774869
23
5.2
22
80
12
103
34
3
3
58
1.32
37774755--37774871
46
2.6
45
81
11
127
35
3
3
58
1.32
37774962--37775090
24
5.2
24
73
20
79
31
8
6
53
1.56
37775058--37775149
40
2.3
41
81
5
116
35
5
5
53
1.47
37778537--37778606
21
3.4
21
74
18
83
25
11
12
50
1.74
37778526--37778606
21
3.9
21
73
20
73
24
12
13
49
1.76
37778526--37778604
41
1.9
41
100
0
158
22
12
13
50
1.76
37779729--37779759
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
37785307--37785538
114
2.0
114
91
1
376
40
15
15
28
1.87
37786076--37786106
8
3.8
8
91
8
53
9
0
0
90
0.46
37786076--37786111
9
4.0
9
92
7
56
11
2
0
86
0.68
37786617--37786664
21
2.3
21
96
0
87
18
39
25
16
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37789963--37789992
14
2.1
14
100
0
60
20
13
0
66
1.24
37793342--37793379
20
1.9
20
88
0
58
28
0
7
63
1.23
37794443--37794500
21
2.7
21
78
7
55
44
0
3
51
1.18
37794460--37794499
20
2.0
20
85
9
55
45
0
2
52
1.14
37799214--37799304
47
1.9
47
88
2
137
34
16
26
23
1.95
37799172--37799304
47
2.9
45
80
10
135
33
18
25
23
1.97
37801347--37801612
46
6.0
45
85
8
330
22
23
15
39
1.91
37801525--37801600
38
2.0
38
100
0
152
21
26
18
34
1.96
37802012--37802063
11
4.7
11
76
9
52
63
3
0
32
1.12
37806204--37806294
30
3.0
30
95
0
164
27
17
16
38
1.91
37808140--37808294
66
2.3
66
81
3
177
21
30
15
32
1.94
37817997--37818046
22
2.2
23
82
10
59
36
4
6
54
1.44
37818038--37818076
16
2.6
14
81
14
51
51
2
0
46
1.14
37844320--37844413
29
3.2
29
96
0
170
26
28
15
28
1.96
37844282--37844413
58
2.3
58
84
2
167
25
33
15
25
1.95
37852356--37852449
29
3.2
29
96
0
170
26
28
15
28
1.96
37852318--37852449
58
2.3
58
84
2
167
25
33
15
25
1.95
37856878--37856917
21
1.9
21
94
0
71
37
12
30
20
1.89
37858422--37858475
23
2.3
23
83
0
72
22
18
18
40
1.91
37858800--37858868
3
23.3
3
94
2
122
34
1
0
63
1.03
37862930--37863020
44
2.0
44
85
2
119
39
21
12
26
1.89
37871792--37871824
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37874659--37874745
6
15.8
5
79
13
84
77
1
4
17
1.01
37874676--37874737
11
5.6
10
83
9
61
79
1
3
16
0.95
37880012--37880044
13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
37887930--37888008
39
2.0
39
100
0
158
35
17
2
44
1.63
37888740--37888989
125
2.0
125
97
0
473
38
17
4
40
1.68
37891236--37891302
34
2.0
34
96
0
125
32
19
11
35
1.88
37894906--37894979
29
2.6
29
89
4
105
28
17
28
25
1.98
37911236--37911262
10
2.7
10
100
0
54
40
0
11
48
1.39
37913541--37913618
20
3.9
19
82
15
88
57
5
0
37
1.21
37913551--37913618
20
3.5
20
88
8
95
57
5
0
36
1.23
37913587--37913637
27
1.9
26
84
4
66
56
1
0
41
1.10
37915278--37915311
17
1.9
18
88
5
52
50
11
0
38
1.39
37920522--37920704
50
3.6
50
79
10
176
32
27
15
24
1.95
37927351--37927629
50
5.5
50
83
7
323
32
26
17
24
1.97
37927401--37927582
101
1.8
101
93
2
321
29
25
19
24
1.99
37930166--37930378
46
4.6
46
80
9
231
24
28
17
30
1.97
37929968--37930399
93
4.6
93
76
8
308
25
28
17
28
1.97
37929973--37930470
93
5.3
94
77
9
279
25
28
17
29
1.97
37934720--37934751
8
4.0
8
100
0
64
50
12
12
25
1.75
37938466--37938773
93
3.3
92
83
8
360
24
29
18
28
1.98
37938421--37938773
46
7.6
46
75
11
240
23
29
18
28
1.98
37938317--37938770
47
9.7
47
66
18
218
24
29
17
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37946169--37946202
2
17.0
2
87
0
50
44
0
0
55
0.99
37946739--37946769
2
15.5
2
100
0
62
51
0
0
48
1.00
37957551--37957593
19
2.4
17
81
14
50
30
0
6
62
1.21
37959237--37959261
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
37959951--37960081
42
3.1
43
87
6
178
34
17
20
27
1.95
37959954--37960151
42
4.8
42
80
7
172
33
19
18
28
1.95
37960045--37960161
41
2.8
39
77
12
110
35
20
14
29
1.92
37960260--37960304
21
2.1
22
91
4
74
22
28
0
48
1.50
37960325--37960372
25
1.9
25
91
0
78
16
29
18
35
1.93
37960443--37960504
31
2.0
31
87
0
88
33
27
8
30
1.86
37963288--37963363
25
3.1
24
79
11
66
57
5
0
36
1.21
37963295--37963356
31
2.0
30
84
9
81
58
4
0
37
1.20
37963311--37963363
17
2.9
19
80
11
58
56
1
0
41
1.10
37963398--37963446
24
2.0
24
84
0
62
46
2
12
38
1.53
37964124--37964176
27
1.9
28
84
3
72
52
0
47
0
1.00
37964128--37964172
22
2.0
23
91
4
74
51
0
48
0
1.00
37965507--37965531
13
1.9
13
100
0
50
64
4
16
16
1.44
37965835--37966189
70
5.0
71
76
8
315
32
23
15
29
1.95
37979165--37979308
39
3.7
40
89
0
202
23
31
22
22
1.99
37984464--37984532
15
4.6
15
83
0
84
11
17
13
57
1.64
37984455--37984542
30
3.0
30
81
8
99
10
17
15
56
1.66
37986924--37987097
45
3.8
44
79
12
192
21
20
29
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37986920--37987089
92
1.8
92
92
2
288
21
20
30
28
1.98
37989567--37989605
12
3.4
12
82
13
55
74
0
12
12
1.08
37989568--37989641
22
3.5
21
76
18
64
78
0
10
10
0.97
37989537--37989620
25
3.5
24
76
11
73
75
1
10
13
1.12
37990759--37990994
64
3.7
64
89
1
330
29
16
16
37
1.90
37991232--37991318
43
2.0
43
81
2
102
31
17
25
26
1.97
37991412--37991457
23
2.0
23
95
0
83
23
8
45
21
1.80
37991418--37991465
23
2.1
23
92
0
78
25
8
43
22
1.81
37996026--37996295
135
2.0
135
99
0
531
24
23
14
38
1.92
37996747--37996791
23
2.0
23
86
0
63
35
2
2
60
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770