Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  709  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
223874402--223874605
43
4.8
43
93
3
353
11
25
31
31
1.92
223874796--223874877
28
2.9
28
71
10
87
24
20
29
25
1.99
223888765--223888794
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
223889386--223889565
40
4.6
40
88
3
242
28
23
27
21
1.99
223896995--223897202
40
5.2
39
82
3
202
25
25
23
25
2.00
223896995--223897201
80
2.6
80
82
3
238
25
26
23
25
2.00
223908008--223908069
32
1.9
32
96
0
115
29
9
22
38
1.86
223916246--223916324
5
14.2
6
77
19
66
48
16
2
32
1.60
223916242--223916287
20
2.2
21
92
7
85
47
19
0
32
1.50
223916242--223916288
11
4.5
11
87
12
73
46
19
0
34
1.50
223916321--223916348
14
2.0
14
100
0
56
71
0
14
14
1.15
223930205--223930319
38
2.9
39
89
2
169
29
20
3
46
1.66
223930925--223930981
22
2.5
23
85
2
71
35
31
3
29
1.75
223931428--223931452
13
1.9
13
100
0
50
8
28
16
48
1.74
223931435--223931564
44
3.0
43
90
3
199
26
26
15
31
1.96
223931661--223932443
204
3.8
203
94
2
1304
29
23
18
29
1.97
223944236--223944296
22
2.8
22
80
2
61
68
6
6
18
1.33
223944365--223944427
3
21.0
3
96
0
117
65
0
1
33
1.03
223944522--223944553
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
223944657--223944699
16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
223944794--223944826
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
223944920--223944954
3
11.7
3
100
0
70
65
0
0
34
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
223945412--223945489
28
2.6
30
86
10
115
51
19
5
24
1.67
223946012--223946801
205
3.9
205
92
1
1255
29
22
18
29
1.97
223954317--223954454
39
3.5
40
88
3
183
24
29
21
23
1.99
223962290--223962426
39
3.5
38
89
5
179
24
29
21
24
1.99
223962297--223962478
78
2.3
79
81
11
207
24
28
22
24
2.00
223970273--223970463
40
4.8
40
82
7
221
24
28
23
24
2.00
223970247--223970463
79
2.8
80
80
9
241
24
27
22
24
2.00
223979135--223979225
37
2.4
37
98
1
173
25
31
18
24
1.97
223979265--223979464
48
4.2
48
94
0
355
32
28
6
33
1.83
223979480--223979515
18
2.0
18
88
0
54
33
22
11
33
1.89
223979377--223979619
123
2.0
123
98
0
468
32
27
8
32
1.86
223979410--223979619
57
3.5
57
70
13
179
31
27
8
32
1.87
223985764--223985930
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
223993769--223993935
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
223999654--223999771
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
223999627--223999784
71
2.2
70
97
2
307
34
17
29
18
1.94
224001093--224001345
50
5.2
49
90
6
406
31
26
8
33
1.87
224004035--224004201
40
4.2
40
79
6
169
26
22
26
24
2.00
224010357--224010525
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
224018360--224018537
40
4.5
40
80
4
175
23
25
22
28
1.99
224024016--224024232
40
5.5
40
91
4
309
25
28
23
22
1.99
224029553--224029675
49
2.5
49
95
0
219
26
10
33
29
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
224029778--224029855
37
2.1
37
100
0
156
28
19
32
20
1.97
224031218--224031305
33
2.6
34
76
16
85
26
22
25
26
2.00
224047027--224047062
16
2.2
16
95
0
63
55
11
16
16
1.68
224047267--224047406
29
4.9
29
79
5
135
25
14
34
25
1.94
224047267--224047400
28
4.7
29
74
14
127
26
14
34
25
1.94
224056744--224056953
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
224063913--224063982
27
2.6
27
97
2
131
31
27
12
28
1.93
224071829--224071898
27
2.6
27
93
2
113
31
27
14
27
1.95
224072599--224072623
12
2.1
12
100
0
50
88
0
12
0
0.53
224074292--224074550
49
5.4
49
92
4
429
28
9
32
29
1.88
224074293--224074550
95
2.7
96
93
2
439
28
9
32
29
1.88
224074287--224074606
144
2.2
143
81
6
387
29
9
31
30
1.88
224074652--224074771
36
3.3
37
94
3
208
25
19
33
21
1.97
224082804--224082989
40
4.7
40
84
5
200
26
25
19
27
1.99
224086249--224086302
28
1.9
28
88
0
81
31
22
24
22
1.98
224086368--224086397
8
3.8
8
95
0
51
40
13
20
26
1.89
224087109--224087325
27
8.1
26
79
7
193
32
11
18
37
1.86
224087113--224087326
81
2.7
80
79
5
218
32
10
18
38
1.85
224093391--224093451
24
2.5
24
100
0
122
19
18
26
36
1.94
224106177--224106221
18
2.5
20
75
17
53
46
0
4
48
1.22
224107858--224108045
43
4.4
43
80
1
189
32
24
20
21
1.97
224107858--224108127
128
2.1
129
81
6
307
31
23
21
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
224108083--224108218
73
1.9
73
90
3
220
30
23
19
26
1.98
224108172--224108333
44
3.7
43
87
4
218
29
23
18
29
1.98
224108172--224108333
43
3.7
43
89
4
218
29
23
18
29
1.98
224108172--224108333
87
1.9
87
85
2
227
29
23
18
29
1.98
224115177--224115252
29
2.6
29
85
0
107
25
19
32
22
1.97
224117496--224117535
21
1.9
21
94
0
71
47
12
10
30
1.74
224121453--224121488
11
3.2
12
88
11
58
41
33
0
25
1.55
224122628--224122657
15
2.0
15
93
0
51
33
10
0
56
1.32
224122690--224122731
22
1.9
22
90
0
66
40
33
7
19
1.78
224123043--224123094
25
2.1
25
96
0
95
42
21
7
28
1.80
224123491--224123628
41
3.4
41
93
1
233
20
23
22
34
1.97
224123564--224123695
67
2.0
67
93
1
230
18
18
25
38
1.92
224123604--224123654
26
2.0
26
88
0
75
15
11
27
45
1.81
224123502--224123771
148
1.8
148
85
4
384
20
21
21
36
1.95
224123637--224123806
41
4.2
40
78
10
157
21
21
17
40
1.92
224131228--224131276
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
224132098--224132264
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
224139232--224139280
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
224140102--224140267
40
4.2
39
77
9
158
25
21
27
24
1.99
224147224--224147272
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
224148094--224148260
40
4.2
40
78
6
160
25
22
27
24
2.00
224151019--224151121
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
224153912--224154013
29
3.6
28
81
4
114
29
33
16
20
1.95
224161898--224162000
29
3.6
28
80
5
116
29
33
16
21
1.95
224164146--224164329
39
4.7
40
86
8
209
25
21
26
26
2.00
224164199--224164348
39
3.8
39
86
6
110
26
21
26
25
1.99
224164180--224164348
79
2.1
79
80
10
186
27
21
25
25
1.99
224172261--224172406
40
3.7
40
81
7
163
24
21
26
26
2.00
224175469--224175656
43
4.5
43
82
6
242
22
22
31
22
1.98
224175475--224175656
84
2.2
83
86
4
240
22
21
32
23
1.98
224176753--224176780
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
224176844--224176896
23
2.3
23
77
9
54
32
0
9
58
1.30
224179931--224179964
2
17.0
2
100
0
68
50
0
50
0
1.00
224181952--224182020
35
2.0
35
91
5
113
53
8
2
34
1.47
224184081--224184118
13
2.8
13
96
4
67
86
5
2
5
0.76
224184319--224184376
26
2.3
24
88
5
80
24
3
18
53
1.60
224184875--224185082
3
68.7
3
71
14
115
26
7
3
62
1.39
224185225--224185305
21
4.0
21
79
9
78
27
7
1
64
1.28
224185255--224185283
6
4.8
6
100
0
58
17
0
0
82
0.66
224185399--224185429
15
2.1
15
100
0
62
32
6
0
61
1.21
224185409--224185446
18
2.1
18
85
9
51
31
10
0
57
1.32
224197032--224198426
205
6.9
204
95
2
2434
29
18
22
29
1.97
224198774--224198805
11
2.8
11
95
4
55
84
6
3
6
0.86
224201906--224202047
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
224201945--224202073
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
224209898--224210039
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
224209937--224210065
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
224212869--224213020
40
3.8
40
78
10
143
23
23
28
25
2.00
224214399--224214591
48
4.0
48
96
1
361
31
25
6
36
1.82
224214557--224214626
35
2.0
35
97
0
131
31
27
10
31
1.89
224214510--224214674
83
2.0
82
96
1
303
30
26
7
34
1.85
224218037--224218127
28
3.2
28
79
11
105
30
29
17
21
1.96
224218349--224218654
40
7.7
40
85
0
407
28
29
19
23
1.98
224218333--224218652
80
4.0
80
87
0
462
28
29
19
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770