Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  125  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36561451--36561541
5
17.0
5
78
18
62
18
3
0
78
0.89
36561444--36561506
23
3.0
22
82
13
80
14
7
0
77
0.97
36561450--36561534
30
2.9
29
78
15
102
17
3
0
78
0.88
36562482--36562711
118
1.9
118
88
0
343
24
17
29
28
1.97
36562836--36562876
18
2.3
18
87
8
57
87
0
9
2
0.62
36570185--36571414
153
8.1
153
80
5
1219
36
18
11
34
1.86
36570185--36571452
307
4.2
304
82
5
1336
36
18
10
34
1.86
36570185--36571215
460
2.2
459
83
2
1309
36
18
11
33
1.86
36576098--36576362
132
2.0
131
90
5
419
30
12
8
48
1.71
36579715--36579777
23
2.7
24
77
5
74
53
23
1
20
1.54
36587278--36587312
16
2.2
16
100
0
70
11
31
45
11
1.76
36587459--36587493
12
3.0
12
87
4
54
31
0
0
68
0.90
36587494--36587531
18
2.1
18
85
9
51
65
15
0
18
1.27
36587630--36587674
20
2.2
21
84
7
58
68
8
0
22
1.16
36587703--36587742
11
3.6
11
82
0
53
60
10
10
20
1.57
36589877--36589905
14
2.1
14
100
0
58
44
0
27
27
1.54
36591838--36591880
19
2.2
19
83
8
50
41
2
11
44
1.53
36592898--36592999
40
2.5
40
80
4
116
25
14
23
36
1.93
36597952--36597984
13
2.5
13
100
0
66
27
36
21
15
1.93
36601263--36601343
21
3.8
20
70
15
56
14
27
18
39
1.90
36601263--36601343
42
1.9
42
87
0
117
14
27
18
39
1.90
36603327--36603377
25
2.0
25
88
0
75
37
7
13
41
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36603884--36603925
19
2.2
20
91
4
68
28
9
11
50
1.70
36604005--36604047
18
2.4
18
96
0
77
46
2
0
51
1.13
36604037--36604083
13
3.5
13
73
21
51
38
0
2
59
1.09
36604033--36604089
28
2.0
28
100
0
114
35
0
3
61
1.13
36608633--36608724
44
2.1
44
87
4
132
19
21
25
33
1.97
36609004--36609044
21
2.0
21
85
4
57
17
19
21
41
1.90
36609223--36609264
6
7.0
6
80
20
52
45
0
21
33
1.52
36609223--36609264
18
2.3
18
100
0
84
45
0
21
33
1.52
36609936--36609988
22
2.4
22
93
0
97
18
26
18
35
1.95
36613119--36613169
25
2.0
25
84
0
66
39
7
11
41
1.71
36616891--36617078
42
4.3
43
79
12
220
31
30
24
12
1.93
36617069--36617193
39
3.2
39
87
5
164
27
26
23
23
2.00
36623885--36623946
31
2.0
31
93
6
108
33
11
3
51
1.54
36627644--36627699
26
2.1
27
83
6
71
25
0
7
67
1.15
36627905--36627949
24
1.9
24
90
4
74
51
17
17
13
1.77
36634332--36634399
14
4.9
14
80
8
68
1
29
0
69
0.98
36634338--36634372
17
2.1
17
94
0
61
0
25
0
74
0.82
36634341--36634399
21
2.6
22
77
17
68
0
30
0
69
0.89
36634344--36634400
22
2.8
20
76
23
66
0
31
0
68
0.90
36634688--36634762
26
2.8
26
76
13
73
64
1
1
33
1.11
36635977--36636017
16
2.4
16
88
8
55
43
2
2
51
1.28
36637800--36637834
10
3.6
10
88
3
54
0
11
0
88
0.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36637799--36637836
13
3.1
12
88
11
51
0
10
0
89
0.49
36637802--36637835
17
1.9
18
94
5
61
0
11
0
88
0.52
36637798--36637836
10
3.8
10
87
12
53
0
12
0
87
0.55
36637800--36637843
19
2.2
20
84
4
54
6
9
0
84
0.79
36637980--36638192
118
1.8
118
93
0
372
28
30
17
23
1.97
36638949--36639038
43
2.1
43
84
10
114
21
12
33
33
1.90
36639148--36639225
5
13.7
6
84
9
69
79
0
3
16
0.87
36639148--36639224
24
3.4
24
79
13
92
79
0
3
16
0.88
36645656--36645717
27
2.3
26
76
13
63
48
11
3
37
1.55
36647233--36647270
5
7.6
5
100
0
76
81
0
0
18
0.69
36651579--36651606
5
5.6
5
100
0
56
82
0
0
17
0.68
36658691--36658715
7
3.6
7
100
0
50
24
16
48
12
1.79
36659114--36659152
17
2.2
19
90
9
64
66
0
2
30
1.05
36659112--36659152
18
2.4
16
84
15
55
65
0
2
31
1.05
36659155--36659195
22
1.9
21
85
5
55
48
4
2
43
1.37
36659235--36659277
19
2.3
19
83
0
50
65
2
0
32
1.06
36659112--36659277
10
17.7
9
64
20
56
58
2
2
36
1.24
36660111--36660166
27
2.0
29
86
10
80
33
8
3
53
1.49
36664687--36665015
165
2.0
165
95
0
595
34
17
24
23
1.96
36667578--36667694
10
11.8
10
66
18
66
64
1
3
30
1.20
36667601--36667704
29
3.6
27
75
10
82
66
2
3
26
1.23
36667603--36667695
38
2.4
38
82
7
107
66
2
4
26
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36667875--36667919
19
2.4
19
88
7
65
28
6
0
64
1.19
36667898--36667950
21
2.5
22
82
8
58
30
9
0
60
1.28
36667881--36668019
10
14.1
10
67
17
67
32
5
0
62
1.17
36667941--36668029
30
2.9
30
76
12
92
35
1
1
61
1.11
36667965--36668015
21
2.4
21
80
9
59
37
1
0
60
1.08
36668145--36668351
101
2.0
102
86
1
292
37
11
20
30
1.88
36672964--36673649
343
2.0
342
86
1
962
22
26
16
34
1.95
36675641--36675704
28
2.3
28
94
0
110
32
28
7
31
1.85
36675810--36675899
28
3.2
28
78
10
96
20
27
22
30
1.98
36675820--36675910
27
3.2
28
78
10
71
21
29
18
29
1.97
36680239--36680424
80
2.3
81
78
6
191
22
26
23
26
2.00
36680271--36680421
40
3.8
39
76
10
126
21
26
24
27
2.00
36684147--36684247
49
2.1
49
90
0
157
20
13
33
31
1.92
36686879--36686942
28
2.3
28
94
0
110
32
28
7
31
1.85
36687048--36687136
27
3.2
27
82
6
108
20
26
22
30
1.98
36687048--36687161
55
2.1
55
80
9
126
19
26
21
33
1.97
36691079--36691109
13
2.4
13
94
0
53
35
25
0
38
1.56
36691246--36691474
46
5.0
46
93
2
343
22
23
13
40
1.90
36691226--36691474
92
2.7
92
91
2
385
21
23
13
41
1.89
36695457--36695498
19
2.2
20
86
4
59
47
7
19
26
1.74
36700428--36700467
17
2.4
16
84
8
53
65
10
2
22
1.35
36701771--36702486
52
13.2
52
69
16
391
30
16
21
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36701829--36702313
162
3.0
162
96
0
889
30
15
21
32
1.94
36701695--36702486
110
7.2
111
79
10
799
31
16
21
30
1.96
36702257--36702474
59
3.8
58
76
15
229
31
18
20
29
1.97
36702504--36702664
43
3.7
43
75
15
179
19
21
23
35
1.96
36702514--36702707
86
2.2
86
92
0
316
18
23
23
35
1.96
36702552--36702745
43
4.5
43
78
8
214
14
25
24
35
1.93
36702552--36702816
129
2.0
130
85
2
363
16
24
22
35
1.95
36710866--36710907
19
2.2
20
86
4
59
47
7
19
26
1.74
36715787--36715826
17
2.4
16
84
8
53
65
10
2
22
1.35
36716878--36716912
3
11.7
3
100
0
70
65
0
0
34
0.93
36718920--36719030
53
2.1
53
100
0
222
36
9
5
49
1.57
36722483--36722522
2
20.5
2
84
5
55
50
2
0
47
1.14
36723419--36723467
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
36725243--36725294
7
7.4
7
88
0
68
5
36
0
57
1.23
36728138--36728192
27
2.0
27
82
0
65
63
10
10
14
1.52
36729748--36729897
26
6.0
26
67
13
100
20
20
20
38
1.94
36729852--36729907
26
2.2
26
90
6
87
10
19
26
42
1.84
36732954--36733113
29
5.5
30
88
8
222
33
13
25
27
1.94
36732954--36733113
59
2.8
57
89
4
223
33
13
25
27
1.94
36737904--36737998
27
3.5
26
76
8
84
41
20
8
30
1.81
36738003--36738198
27
7.3
27
88
0
275
29
20
8
40
1.83
36738001--36738198
54
3.7
54
90
2
308
29
20
8
40
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36738003--36738225
81
2.8
81
84
2
198
30
20
8
40
1.82
36738202--36738369
54
3.1
54
80
8
148
42
20
7
29
1.80
36738219--36738399
27
6.7
27
84
3
197
40
20
8
29
1.82
36738192--36738369
81
2.2
81
83
7
220
42
19
7
29
1.79
36738388--36738665
27
10.3
27
90
0
432
33
20
21
24
1.97
36738391--36738655
134
2.0
135
92
2
444
33
19
21
24
1.97
36739085--36739178
6
15.3
6
72
16
77
19
17
14
48
1.81
36739085--36739164
31
2.6
31
89
0
115
18
17
15
48
1.81
36741141--36741235
27
3.5
26
77
8
84
41
21
8
29
1.82
36741240--36741435
27
7.3
27
89
0
284
30
20
7
40
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770