Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  84  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24651270--24651374
56
1.9
55
92
5
176
38
10
13
38
1.79
24651282--24651381
37
2.7
38
87
6
161
38
9
16
37
1.80
24651282--24651397
19
5.8
22
80
13
96
37
8
15
38
1.78
24658087--24658183
30
3.2
30
80
5
79
20
24
38
16
1.93
24663174--24663208
15
2.3
16
90
9
56
0
25
0
74
0.82
24665983--24666013
15
2.1
15
100
0
62
0
32
29
38
1.57
24669832--24670056
40
5.7
39
84
7
249
25
21
26
26
2.00
24673449--24673480
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
24674629--24674695
29
2.2
31
81
5
75
28
13
5
52
1.64
24674754--24674811
28
2.0
29
93
6
100
24
10
17
48
1.78
24679775--24679822
16
3.1
15
82
8
53
77
6
2
14
1.06
24681139--24681163
13
1.9
13
100
0
50
36
8
8
48
1.62
24682365--24682392
13
2.2
13
100
0
56
35
14
17
32
1.90
24686240--24686285
22
2.0
23
83
4
58
28
6
8
56
1.54
24686379--24686427
16
3.1
16
82
11
64
22
0
2
75
0.90
24686548--24686595
25
2.0
24
84
12
62
25
4
8
62
1.41
24688218--24688361
3
48.7
3
74
13
120
35
4
0
59
1.24
24698152--24698269
58
2.0
58
100
0
236
23
6
18
50
1.70
24699423--24699474
24
2.2
24
89
0
77
51
9
5
32
1.58
24712869--24712916
25
2.0
24
87
4
69
43
6
2
47
1.40
24713112--24713151
12
3.4
12
96
3
73
55
30
0
15
1.41
24714496--24714559
25
2.5
25
77
12
67
29
1
20
48
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24718324--24718413
44
2.0
44
97
0
171
36
13
23
26
1.92
24742874--24742906
17
1.9
17
100
0
66
36
12
24
27
1.91
24749241--24749274
2
17.0
2
100
0
68
50
0
0
50
1.00
24749893--24750028
26
5.2
26
94
0
236
33
5
25
36
1.78
24751819--24752240
136
3.1
136
97
0
790
24
17
25
32
1.97
24754120--24754150
16
2.0
15
93
6
53
51
9
12
25
1.70
24754670--24754734
30
2.2
30
97
0
121
61
3
7
27
1.38
24754823--24754901
32
2.4
32
77
12
81
56
3
7
31
1.45
24757494--24757536
2
22.5
2
90
9
72
48
0
0
51
1.00
24757896--24757960
30
2.2
29
81
10
69
24
9
6
60
1.50
24763503--24763584
26
3.2
26
94
0
146
29
7
26
36
1.83
24770422--24770474
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
24771963--24772098
26
5.2
26
95
0
227
36
24
5
33
1.79
24773881--24773910
15
2.0
15
100
0
60
13
33
13
40
1.83
24774206--24774273
32
2.2
31
82
7
77
55
1
1
41
1.18
24774973--24775009
19
1.9
19
88
0
56
43
0
2
54
1.14
24775329--24775367
19
1.9
19
85
10
51
33
2
0
64
1.08
24776264--24776294
15
2.1
15
100
0
62
35
19
19
25
1.95
24778364--24778483
58
2.1
58
90
3
188
38
13
10
37
1.80
24784294--24784377
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
24785870--24785918
25
2.0
25
84
8
64
38
20
16
24
1.92
24790066--24790149
26
3.2
26
96
0
150
33
4
25
36
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24796204--24796237
16
2.1
17
94
5
61
44
5
20
29
1.75
24796599--24796670
37
1.9
38
94
2
128
15
48
12
23
1.79
24796628--24796702
22
3.3
22
79
17
89
22
52
9
16
1.72
24796776--24796814
19
2.0
20
90
5
62
7
0
23
69
1.14
24797145--24797230
3
28.3
3
73
19
65
30
3
1
65
1.17
24797144--24797230
27
3.4
27
71
19
78
29
3
1
65
1.16
24797145--24797234
18
4.7
18
80
13
92
31
3
1
64
1.17
24802894--24802928
6
5.8
6
96
0
61
48
17
31
2
1.61
24804223--24804569
44
7.9
44
68
12
198
34
21
23
20
1.97
24804223--24804467
85
2.8
88
80
10
283
34
22
23
19
1.96
24804574--24804768
68
2.9
68
88
3
286
27
22
22
27
1.99
24804884--24805700
44
18.6
44
73
9
531
30
18
24
26
1.98
24804826--24805709
132
6.7
132
93
0
1482
30
18
23
26
1.98
24805760--24805912
43
3.6
43
70
2
137
37
22
21
18
1.94
24805722--24805960
87
2.8
86
82
0
298
36
23
23
17
1.95
24805989--24806240
44
5.9
44
85
6
340
29
17
31
21
1.96
24805989--24806230
84
2.9
86
87
4
352
27
17
32
22
1.96
24805989--24806240
128
2.0
128
93
0
432
29
17
31
21
1.96
24806662--24806710
22
2.2
22
92
0
89
26
51
8
14
1.70
24806593--24806680
38
2.3
38
96
0
158
15
47
12
23
1.80
24806785--24806827
22
2.0
22
86
4
61
6
0
25
67
1.15
24807157--24807239
3
27.3
3
73
20
59
30
3
1
65
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24807160--24807239
12
6.8
12
75
12
76
30
3
1
65
1.18
24813188--24813322
26
5.2
26
95
1
227
37
23
5
34
1.77
24813188--24813322
51
2.6
51
92
1
225
37
23
5
34
1.77
24833932--24834094
35
4.7
35
83
4
197
31
11
24
32
1.91
24833932--24834094
70
2.3
69
88
1
227
31
11
24
32
1.91
24841409--24841537
35
3.7
35
86
0
168
30
12
24
32
1.92
24844813--24844968
35
4.5
35
85
3
199
31
12
24
32
1.92
24844805--24844968
70
2.3
70
88
0
229
30
12
25
32
1.92
24846649--24846707
21
2.8
21
72
10
57
40
3
0
55
1.16
24846684--24846725
10
4.4
9
85
14
50
40
2
4
52
1.35
24846517--24847033
258
2.0
258
99
0
1016
35
5
11
47
1.64
24846942--24846983
10
4.4
9
85
14
50
40
2
4
52
1.35
24848081--24848122
15
2.6
16
81
14
50
59
4
9
26
1.48
24848702--24848769
28
2.4
29
80
14
79
60
0
5
33
1.21
24848758--24848822
3
21.3
3
74
14
53
66
0
1
32
1.01
24848757--24848806
17
2.9
18
82
11
68
66
0
2
32
1.03
24848707--24848838
20
6.6
20
70
20
80
61
0
4
33
1.22
24848777--24848822
12
3.6
13
82
11
60
67
0
0
32
0.91
24848696--24848822
24
6.0
22
70
18
76
62
0
3
33
1.14
24851347--24851393
20
2.4
20
85
3
69
36
4
8
51
1.52
24851836--24851889
26
2.1
26
82
6
65
25
1
7
64
1.30
24857624--24857776
25
6.4
24
80
9
145
35
18
24
20
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24857664--24857776
50
2.3
50
89
6
167
34
18
24
22
1.96
24862643--24862677
16
2.3
15
90
5
52
62
2
2
31
1.24
24863475--24863517
17
2.5
17
84
3
59
6
53
30
9
1.59
24863908--24863964
27
2.1
27
93
3
98
3
3
21
71
1.15
24864624--24864743
55
2.2
55
98
1
233
38
18
14
29
1.90
24864866--24864970
54
1.9
54
86
3
149
38
20
15
26
1.92
24864920--24865108
72
2.6
72
79
4
218
37
21
14
26
1.92
24865068--24865201
51
2.6
51
82
7
162
38
19
14
27
1.91
24865068--24865202
54
2.6
53
81
10
170
37
19
14
28
1.91
24865174--24865439
72
3.7
72
82
5
277
36
21
15
27
1.93
24865566--24865749
72
2.5
72
81
6
237
35
22
15
26
1.94
24865570--24868168
261
10.1
261
75
15
2135
36
21
15
26
1.93
24864834--24865867
315
3.3
315
83
10
1407
36
21
15
26
1.93
24865796--24866010
72
3.0
72
82
3
261
35
22
16
25
1.94
24866057--24866270
72
3.0
72
80
8
247
35
21
16
25
1.94
24866396--24866591
72
2.7
72
83
4
243
37
21
13
26
1.91
24866544--24866681
55
2.6
54
87
2
197
38
19
12
29
1.88
24866645--24866917
72
3.8
71
80
7
280
35
21
15
26
1.94
24867038--24867227
72
2.6
72
85
4
256
35
22
15
26
1.94
24867353--24867542
72
2.6
73
84
4
242
36
22
14
26
1.93
24866082--24867648
315
4.9
315
89
6
2482
36
21
15
26
1.93
24867589--24867803
72
3.0
72
81
3
252
35
21
16
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24867850--24868047
72
2.7
74
84
2
258
33
23
17
25
1.96
24868184--24868383
72
2.8
72
82
7
244
38
22
14
25
1.92
24868337--24868474
55
2.6
54
85
2
197
38
18
13
29
1.89
24868445--24868711
72
3.7
72
81
6
279
35
21
15
26
1.94
24868827--24869020
72
2.7
72
83
4
246
36
22
15
25
1.93
24867875--24869127
315
3.9
315
86
7
1893
36
21
15
26
1.93
24877545--24877580
12
3.0
12
91
0
54
44
5
22
27
1.75
24879323--24879365
20
2.1
21
82
4
52
62
6
2
27
1.33
24880409--24880471
31
2.1
30
91
8
103
4
3
19
73
1.15
24884485--24884524
6
6.5
6
88
5
62
80
0
2
17
0.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770