genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.663.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  663  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
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208438665--208438734	27	2.5	28	88	2	106	28	14	25	31	1.95
208438665--208438746	27	3.0	27	80	8	103	29	13	23	34	1.93
208443828--208443963	29	4.7	29	86	3	157	24	30	15	29	1.95
208443803--208443962	58	2.8	58	81	0	176	23	33	15	27	1.95
208444605--208444899	143	2.1	141	98	1	563	38	29	10	21	1.87
208452796--208452931	29	4.7	29	86	3	157	24	30	15	29	1.95
208452771--208452930	58	2.8	58	81	0	176	23	33	15	27	1.95
208453575--208453869	143	2.1	141	98	1	563	38	29	10	21	1.87
208460749--208460884	29	4.7	29	86	3	157	24	30	15	29	1.95
208460724--208460883	58	2.8	58	81	0	176	23	33	15	27	1.95
208461528--208461822	143	2.1	141	98	1	563	38	29	10	21	1.87
208468710--208468845	29	4.7	29	86	3	157	24	30	15	29	1.95
208468685--208468844	58	2.8	58	81	0	176	23	33	15	27	1.95
208469487--208469781	143	2.1	141	98	1	563	38	29	10	21	1.87
208473243--208473429	40	4.7	40	90	0	259	25	22	27	24	2.00
208481454--208481654	40	5.0	40	83	1	233	25	20	26	26	1.99
208486884--208486910	11	2.5	11	100	0	54	29	0	22	48	1.51
208487767--208487941	46	3.8	46	79	15	198	28	29	20	21	1.98
208487775--208487946	93	1.8	93	92	0	290	27	29	20	21	1.98
208487772--208487961	46	4.1	44	71	18	127	28	28	20	22	1.98
208493910--208494039	29	4.5	29	88	0	163	23	30	15	30	1.95
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
208493852--208494040	58	3.3	58	77	5	179	24	32	16	26	1.96
208509421--208509546	40	3.2	39	80	6	139	21	25	24	28	1.99
208509360--208509546	80	2.3	80	78	12	204	22	27	24	25	2.00
208511744--208511868	49	2.6	49	85	2	153	20	27	22	29	1.99
208518290--208518473	40	4.6	39	75	6	138	26	23	27	22	2.00
208518330--208518518	80	2.4	81	77	4	186	23	24	29	22	1.99
208522811--208522988	49	3.7	49	80	8	168	25	28	18	26	1.98
208527621--208527788	40	4.2	39	80	4	142	24	26	22	26	2.00
208532086--208535806	537	6.9	539	97	1	7042	36	18	11	33	1.86
208535801--208540407	535	8.6	539	96	1	8430	37	18	10	33	1.86
208542124--208542186	31	2.1	31	90	3	101	23	23	15	36	1.94
208542378--208542519	24	6.0	24	90	5	200	26	22	21	28	1.99
208542378--208542519	47	3.0	47	89	6	198	26	22	21	28	1.99
208542570--208542630	20	3.0	20	95	0	113	34	19	11	34	1.88
208542570--208542625	11	5.5	11	71	16	57	32	19	12	35	1.89
208542673--208542720	25	1.9	25	86	0	69	25	16	25	33	1.96
208543859--208543928	25	2.8	28	79	16	73	24	22	21	31	1.98
208543874--208543949	25	2.9	26	80	7	82	22	19	21	36	1.95
208543990--208544246	27	9.4	27	77	5	140	33	9	19	37	1.84
208544080--208544219	54	2.6	54	82	4	183	31	7	21	39	1.82
208544198--208544404	27	7.8	26	86	5	258	39	8	23	28	1.83
208544198--208544398	80	2.5	79	85	5	255	40	8	22	28	1.83
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
208544197--208544404	53	3.9	53	85	5	269	39	8	23	28	1.83
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208544410--208544514	27	3.9	27	79	9	90	34	9	17	39	1.82
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Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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