Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  230  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69003029--69003220
40
4.8
40
94
0
321
26
20
27
26
1.99
69006625--69006685
27
2.3
27
100
0
122
36
0
26
37
1.57
69006580--69006734
76
2.0
76
94
0
274
35
6
27
30
1.82
69006652--69006880
49
4.8
49
91
2
340
32
9
30
27
1.88
69010627--69010727
28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
69018522--69018622
28
3.5
29
86
6
125
29
27
13
28
1.95
69030001--69030251
40
6.3
40
81
5
296
27
26
21
23
1.99
69030001--69030251
79
3.2
80
90
4
375
27
26
21
23
1.99
69030001--69030221
119
1.9
119
88
1
336
28
26
21
23
1.99
69035347--69035429
42
2.0
42
90
0
130
31
27
16
24
1.97
69037517--69037616
41
2.5
41
86
4
141
34
25
19
22
1.96
69041931--69042058
46
2.7
48
79
4
161
23
30
20
25
1.98
69045727--69045758
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
69046567--69046809
50
4.8
51
77
5
217
31
27
16
24
1.97
69051099--69051150
22
2.4
22
96
0
95
40
19
19
21
1.92
69052326--69052368
23
1.9
22
95
0
68
34
23
23
18
1.96
69065220--69065257
12
3.2
12
85
3
51
78
0
21
0
0.74
69065260--69065303
6
7.2
6
92
2
70
34
13
0
52
1.41
69065672--69065732
31
2.0
31
83
0
77
37
3
8
50
1.48
69065859--69065936
29
2.6
30
80
13
81
47
16
6
29
1.71
69066359--69066395
13
2.9
12
88
11
56
32
2
0
64
1.07
69067054--69067097
18
2.4
18
76
0
52
29
9
18
43
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69080698--69080740
20
2.2
20
87
8
61
39
11
0
48
1.40
69105828--69105867
19
2.1
19
100
0
80
20
30
10
40
1.85
69107029--69107053
12
2.1
12
100
0
50
56
16
8
20
1.65
69109549--69109694
43
3.4
41
74
11
116
34
21
15
29
1.93
69112927--69113028
29
3.5
28
74
12
82
26
35
17
20
1.95
69115579--69115646
20
3.4
20
86
8
86
47
22
22
8
1.78
69115546--69115644
40
2.5
40
80
9
112
41
24
25
9
1.84
69120931--69121135
38
5.4
38
73
7
148
39
17
13
30
1.88
69122577--69122813
39
6.1
39
82
2
244
16
32
19
32
1.94
69122563--69122813
78
3.2
78
83
3
290
16
31
19
32
1.94
69122602--69122779
20
9.1
20
65
16
77
16
34
18
30
1.93
69130192--69130311
43
2.8
42
77
13
129
26
21
25
26
2.00
69131626--69131812
30
6.4
30
84
11
253
48
14
17
19
1.82
69131626--69131812
85
2.2
85
97
0
347
48
14
17
19
1.82
69131626--69131787
6
26.8
6
78
15
174
48
14
17
19
1.80
69131945--69132043
27
3.7
26
86
5
117
36
21
22
20
1.95
69132201--69132265
22
3.0
22
75
8
69
33
21
23
21
1.97
69132690--69133000
27
11.3
27
84
5
354
23
19
20
36
1.95
69132737--69132965
115
2.0
116
91
0
370
24
19
19
37
1.94
69132764--69132991
88
2.7
87
91
5
360
23
20
20
35
1.96
69132726--69132992
142
1.9
142
88
1
410
23
19
20
35
1.95
69132985--69133334
27
13.1
27
77
8
175
32
8
24
35
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69133022--69133134
26
4.3
25
76
11
86
29
8
22
39
1.84
69133138--69133310
81
2.1
81
92
2
285
38
6
25
29
1.82
69133138--69133310
54
3.2
54
87
1
258
38
6
25
29
1.82
69133138--69133355
81
2.7
81
85
1
222
37
6
23
32
1.82
69135299--69135482
30
6.1
29
84
6
215
47
15
18
18
1.82
69135299--69135482
91
2.0
91
89
2
280
47
15
18
18
1.82
69135320--69135457
6
22.8
6
81
12
167
48
14
18
18
1.81
69135617--69135715
27
3.7
26
86
5
117
36
21
22
20
1.95
69135873--69135937
22
3.0
22
80
8
78
33
23
23
20
1.97
69136362--69136673
27
11.3
27
82
5
320
23
19
19
36
1.95
69136398--69136665
143
1.9
143
86
1
385
23
19
20
36
1.95
69136658--69137007
27
13.1
27
78
8
166
32
8
24
35
1.84
69136811--69136983
54
3.2
54
86
1
249
36
7
26
29
1.84
69136811--69136994
81
2.3
81
90
1
280
35
7
26
30
1.84
69136848--69137028
81
2.2
81
86
0
227
36
7
23
32
1.83
69149198--69149374
40
4.4
40
82
4
216
26
27
22
24
2.00
69149198--69149360
80
2.1
79
89
3
247
26
27
21
23
1.99
69153638--69153669
2
16.0
2
93
0
55
50
3
0
46
1.17
69154331--69154420
34
2.7
33
94
5
155
4
5
15
74
1.17
69155063--69155093
13
2.4
13
94
0
53
67
9
6
16
1.39
69155244--69155305
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
69155028--69155496
88
5.5
86
71
15
276
37
19
15
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69155428--69155958
77
6.7
77
71
14
323
32
19
17
29
1.95
69155501--69155958
171
2.8
172
80
13
477
32
19
17
29
1.95
69155663--69155958
74
3.9
75
84
5
364
32
20
17
29
1.96
69155077--69155911
242
3.4
246
83
7
845
35
18
16
28
1.93
69155663--69155985
155
2.1
148
83
8
386
33
19
17
29
1.95
69155935--69156040
54
1.9
54
83
9
135
36
19
16
27
1.93
69155817--69156221
210
1.9
211
84
8
541
37
20
16
26
1.93
69156031--69156193
70
2.3
71
89
3
249
41
20
15
22
1.89
69156071--69156296
115
1.9
118
85
6
314
36
22
14
26
1.93
69156255--69156594
147
2.4
145
86
3
481
33
22
18
26
1.96
69156255--69156594
72
4.7
71
85
4
464
33
22
18
26
1.96
69156525--69156741
115
1.9
113
84
7
294
36
23
14
25
1.93
69163644--69163673
2
15.0
2
92
0
51
50
3
0
46
1.18
69164352--69164415
31
2.2
29
86
13
87
4
6
15
73
1.20
69164329--69164419
32
2.8
34
91
6
145
4
5
15
74
1.16
69165528--69165587
30
2.0
30
86
0
84
40
8
23
28
1.83
69168602--69168704
44
2.4
42
86
10
154
24
17
26
32
1.97
69170994--69171023
14
2.1
14
100
0
60
33
33
0
33
1.58
69171213--69171854
50
12.7
50
78
3
658
31
26
17
24
1.97
69171213--69171849
101
6.3
101
84
0
799
31
26
17
24
1.97
69171214--69171849
203
3.1
203
81
1
625
31
26
17
24
1.97
69171258--69171875
304
2.0
304
92
0
1020
31
26
17
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69175318--69175484
40
4.2
40
82
2
185
24
26
22
26
2.00
69187204--69187262
28
2.1
28
100
0
118
16
11
25
45
1.82
69188847--69188884
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
69195159--69195227
28
2.5
28
95
2
122
18
10
27
43
1.82
69196851--69196888
20
1.9
20
88
0
58
52
10
2
34
1.50
69198576--69198749
46
3.8
45
76
15
167
29
28
20
21
1.98
69198585--69198754
93
1.8
93
89
0
268
28
28
20
22
1.99
69198627--69198763
47
3.0
46
72
20
124
30
28
18
22
1.97
69211305--69211329
13
1.9
13
100
0
50
12
24
40
24
1.88
69213887--69214006
40
2.9
41
71
20
97
27
28
15
29
1.96
69218837--69219010
50
3.5
51
83
4
187
29
27
18
24
1.98
69218837--69219018
101
1.8
97
85
4
256
29
27
18
24
1.98
69224146--69224292
50
2.9
51
85
2
215
30
27
19
23
1.98
69243661--69243812
40
3.8
39
84
5
135
23
26
23
27
2.00
69243705--69243848
40
3.6
40
91
1
209
25
27
22
25
2.00
69245991--69246092
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
69253867--69253968
28
3.5
29
81
6
109
28
27
14
29
1.95
69263239--69263281
19
2.2
20
91
4
70
37
25
0
37
1.56
69278696--69278866
90
1.9
90
95
0
306
39
16
21
23
1.92
69290311--69290495
40
4.7
40
82
6
216
25
27
22
24
2.00
69290313--69290495
79
2.3
81
83
9
225
25
26
22
25
2.00
69294778--69295027
40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69301725--69301881
79
2.0
80
83
8
205
25
28
21
24
1.99
69301697--69301881
40
4.7
40
80
7
189
25
27
22
24
2.00
69310050--69310147
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
69317720--69317817
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
69321587--69321627
13
3.2
13
96
3
75
53
4
21
19
1.63
69324723--69324901
90
2.0
90
95
0
322
37
17
20
23
1.94
69327563--69327673
27
4.2
26
86
5
141
16
25
22
36
1.94
69333931--69334031
24
4.2
24
90
0
157
34
2
41
20
1.68
69335239--69335348
27
4.1
26
86
5
139
15
21
24
38
1.92
69335239--69335348
54
2.1
53
87
1
157
15
21
24
38
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770