Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  127  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37112134--37112287
76
2.0
76
98
0
299
35
16
11
36
1.86
37120444--37120585
40
3.5
40
83
1
124
27
23
26
22
1.99
37120483--37120611
40
3.2
39
84
6
152
24
22
27
25
2.00
37125871--37126019
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
37125912--37126019
40
2.7
38
87
8
137
20
30
25
23
1.98
37132047--37132076
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
37132672--37132712
17
2.3
19
87
8
59
34
0
7
58
1.26
37136678--37136806
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
37141045--37141162
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
37141013--37141176
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
37145589--37145717
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
37149955--37150072
41
3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96
37149923--37150086
71
2.3
71
100
0
328
35
17
28
18
1.94
37154503--37154631
44
2.8
45
82
4
152
34
13
24
27
1.93
37156967--37157210
40
6.1
39
90
4
339
24
23
27
25
2.00
37159926--37160135
55
3.9
54
75
10
196
24
25
15
34
1.95
37167396--37167423
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
37168013--37168053
17
2.3
19
87
8
59
34
0
7
58
1.26
37172735--37172765
16
1.9
16
100
0
62
38
19
25
16
1.92
37172975--37173089
29
4.0
28
79
2
113
26
14
29
28
1.95
37172988--37173098
57
1.9
58
83
1
143
26
15
30
27
1.96
37174719--37174765
20
2.3
20
96
0
85
34
17
21
27
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37175895--37175924
15
1.9
16
93
6
53
36
6
16
40
1.75
37177118--37177250
69
1.9
70
90
1
214
33
13
16
36
1.88
37177953--37177978
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
37177997--37178251
39
6.5
39
88
3
327
20
22
27
29
1.98
37177997--37178204
77
2.7
78
89
1
319
19
23
28
28
1.98
37183592--37183690
29
3.4
29
84
8
105
25
30
15
29
1.95
37193189--37193244
24
2.5
22
75
11
67
39
0
3
57
1.16
37194334--37194364
11
2.8
11
95
0
53
32
0
3
64
1.09
37196624--37196721
30
3.2
30
71
16
76
40
11
5
42
1.62
37196769--37196796
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
37197043--37197071
2
14.5
2
100
0
58
51
0
0
48
1.00
37198316--37198368
20
2.6
20
85
8
72
32
0
7
60
1.25
37198848--37198891
18
2.4
18
78
10
54
56
9
2
31
1.43
37198846--37198889
19
2.4
19
85
11
56
56
9
2
31
1.43
37200473--37200526
28
1.9
28
100
0
108
46
11
9
33
1.71
37200615--37200656
20
2.2
20
95
4
77
42
0
9
47
1.36
37205505--37205543
3
12.7
3
94
5
69
33
0
0
66
0.92
37208523--37208645
55
2.2
55
100
0
246
28
21
26
22
1.99
37208727--37208767
13
3.2
13
89
0
64
24
29
31
14
1.95
37210101--37210142
22
1.9
22
85
9
59
38
0
19
42
1.51
37210809--37211029
40
5.6
39
87
6
270
25
22
27
25
2.00
37210809--37211029
79
2.8
77
83
8
257
25
22
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37210815--37211054
79
3.0
77
80
12
256
26
21
26
25
1.99
37218286--37218327
22
1.9
22
85
9
59
38
0
19
42
1.51
37218992--37219212
39
5.6
38
87
4
273
25
21
27
25
2.00
37226401--37226442
22
1.9
22
85
9
59
38
0
19
42
1.51
37227111--37227327
39
5.5
39
85
7
271
25
21
26
25
2.00
37227109--37227327
79
2.8
78
82
8
266
25
22
26
25
2.00
37227120--37227362
79
3.1
79
80
7
194
26
21
26
25
1.99
37235253--37235474
39
5.6
39
85
6
272
25
22
27
25
2.00
37235259--37235507
79
3.2
77
79
11
247
26
20
26
25
1.99
37242015--37242056
22
1.9
22
85
9
59
38
0
19
42
1.51
37242722--37242942
40
5.6
39
86
6
261
25
22
26
25
2.00
37242722--37242942
79
2.8
77
83
8
248
25
22
26
25
2.00
37242728--37242977
79
3.2
76
77
13
229
26
21
26
26
1.99
37245461--37245532
29
2.5
28
88
6
101
30
16
26
26
1.97
37247509--37247587
39
2.0
39
92
0
131
22
15
6
55
1.62
37250867--37250927
30
2.0
30
83
0
77
31
22
8
37
1.84
37253650--37253874
124
1.8
124
86
1
326
30
10
24
35
1.88
37253869--37253998
40
3.2
40
83
4
165
22
25
29
23
1.99
37259725--37259999
48
5.8
48
73
10
204
29
24
20
26
1.99
37262659--37262714
26
2.2
26
96
0
103
35
10
25
28
1.89
37264892--37264920
13
2.2
13
100
0
58
31
31
24
13
1.94
37269404--37269670
48
5.7
47
72
10
138
27
18
28
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37271285--37271549
47
5.6
48
79
10
216
23
28
19
29
1.98
37271284--37271552
94
2.9
94
81
10
286
23
28
19
28
1.98
37278541--37278598
26
2.2
26
84
9
73
34
27
10
27
1.89
37278704--37278762
27
2.2
27
87
3
84
16
22
22
38
1.93
37286567--37286676
27
4.1
27
86
1
159
18
22
22
36
1.95
37286585--37286696
54
2.1
54
84
3
145
23
24
18
33
1.97
37289708--37289965
47
5.5
45
76
12
202
23
27
17
31
1.97
37295452--37295481
10
3.0
10
95
0
51
53
10
0
36
1.35
37297694--37297727
12
2.8
12
90
0
50
50
2
0
47
1.16
37300531--37300633
29
3.6
29
92
2
154
26
32
15
26
1.96
37308613--37308715
29
3.6
29
92
2
154
26
32
15
26
1.96
37312296--37312347
24
2.2
24
85
0
68
59
17
13
9
1.60
37312553--37312625
29
2.5
29
79
0
83
28
15
30
26
1.96
37317580--37317609
10
3.0
10
95
0
51
53
10
0
36
1.35
37318759--37318893
45
3.0
45
97
0
252
31
4
17
45
1.68
37324086--37324374
27
10.7
27
74
10
85
37
21
8
32
1.84
37324086--37324212
54
2.4
53
78
13
134
32
23
7
36
1.84
37324234--37324385
54
2.8
54
80
4
182
42
20
7
29
1.80
37324314--37324442
27
4.7
27
77
11
118
43
17
6
32
1.74
37324234--37324469
110
2.2
108
81
4
260
40
19
8
31
1.82
37324286--37324447
27
5.9
27
76
9
114
40
17
9
32
1.81
37325374--37325457
25
3.4
24
82
8
89
27
21
23
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37325591--37325682
42
2.2
42
98
0
175
31
15
20
32
1.94
37325706--37325906
31
6.5
31
91
0
330
29
15
24
29
1.96
37338377--37338406
10
3.0
10
95
0
51
53
10
0
36
1.35
37341046--37341073
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
37342238--37342439
47
4.3
47
86
4
277
33
9
29
28
1.88
37342238--37342439
93
2.2
92
86
5
273
33
9
29
28
1.88
37342510--37342594
40
2.2
40
86
2
118
17
21
31
29
1.96
37343240--37343264
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
37345603--37345765
29
5.6
29
87
1
193
28
26
15
30
1.96
37345606--37345765
58
2.8
58
88
1
223
28
25
15
30
1.96
37349936--37349973
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
37351368--37351451
2
43.0
2
82
4
100
45
2
4
47
1.36
37358341--37358673
48
6.9
48
94
1
558
35
6
26
32
1.81
37358647--37358703
30
1.9
30
92
0
96
38
10
22
28
1.87
37358605--37358751
78
1.9
78
97
0
276
34
7
26
31
1.84
37358677--37358962
48
6.1
48
86
10
423
34
6
27
31
1.83
37358551--37358934
126
3.0
126
89
4
536
35
6
26
31
1.83
37358341--37358962
174
3.4
180
88
6
887
35
6
26
31
1.82
37358809--37358890
37
2.2
37
97
0
155
34
7
26
31
1.84
37358711--37358962
135
1.9
133
94
1
450
34
6
26
31
1.83
37358759--37358938
85
2.1
87
92
2
301
35
6
26
32
1.81
37359478--37359589
40
2.8
40
100
0
224
20
24
29
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
37361259--37361362
29
3.6
28
84
5
136
29
16
25
27
1.97
37369301--37369404
29
3.6
28
84
5
136
29
16
25
27
1.97
37370884--37370999
40
2.9
40
92
0
187
18
25
31
24
1.98
37371163--37371217
25
2.2
25
83
6
76
29
10
30
29
1.91
37372476--37372516
22
2.0
21
86
13
59
78
0
14
7
0.96
37373845--37373947
29
3.5
29
94
2
179
36
15
24
23
1.93
37373835--37373947
59
1.9
59
92
0
190
38
15
23
23
1.92
37378009--37378797
48
16.3
48
95
1
1355
33
6
28
31
1.83
37378911--37379029
37
3.2
37
90
2
177
26
17
29
26
1.98
37380191--37380243
26
2.0
27
85
14
74
11
24
3
60
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770