Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  402  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123635396--123635490
31
3.1
31
98
0
181
23
22
15
38
1.92
123635682--123635822
23
6.0
24
88
7
191
26
22
21
29
1.99
123635681--123635822
70
2.0
71
89
4
216
26
22
21
29
1.99
123635682--123635822
47
3.0
47
88
7
189
26
22
21
29
1.99
123635873--123635932
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
123635873--123635927
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
123635975--123636022
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
123643532--123643595
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
123643787--123643929
24
6.0
24
91
4
209
26
22
22
28
1.99
123643787--123643928
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
123643786--123643929
71
2.0
72
89
4
220
26
22
22
29
1.99
123643980--123644039
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
123643980--123644034
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
123644082--123644129
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
123646499--123646559
30
2.0
30
83
0
77
31
21
8
39
1.82
123651327--123651411
43
2.0
43
84
9
111
36
22
14
27
1.92
123651431--123651536
44
2.4
44
85
1
151
31
24
17
26
1.97
123651821--123651860
14
2.5
17
76
19
50
35
20
2
42
1.65
123655860--123656038
37
5.0
36
86
8
242
25
21
30
22
1.98
123655869--123656038
72
2.4
71
88
8
247
25
21
31
21
1.98
123663858--123664053
39
5.0
39
87
3
268
27
20
30
21
1.98
123663868--123664053
78
2.4
79
92
3
313
25
21
31
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123666967--123667002
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
123668270--123668460
58
3.2
59
93
2
312
36
14
24
25
1.93
123668300--123668460
88
1.8
87
97
1
304
37
14
24
24
1.92
123668300--123668460
29
5.5
29
97
1
304
37
14
24
24
1.92
123671326--123671361
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
123672658--123672817
29
5.5
29
96
3
295
37
14
23
24
1.92
123675678--123675713
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
123677012--123677142
29
4.5
29
96
2
237
37
14
23
24
1.92
123676982--123677142
57
2.7
59
89
4
245
36
14
24
25
1.93
123676982--123677145
58
2.8
58
86
3
231
35
14
24
25
1.93
123684222--123684344
22
5.3
22
65
24
74
31
13
30
25
1.93
123684199--123684435
47
5.1
47
93
2
383
32
11
29
26
1.92
123684318--123684393
23
3.2
25
62
24
63
28
13
34
23
1.92
123684199--123684525
47
7.0
45
90
5
300
33
10
28
27
1.90
123684394--123684538
50
3.0
50
91
5
226
37
8
24
29
1.85
123684406--123684562
50
3.2
50
84
11
198
33
7
28
30
1.85
123684688--123684796
37
2.9
37
95
0
191
22
19
31
26
1.98
123686066--123686375
40
7.8
40
92
1
498
24
22
28
25
1.99
123690530--123690814
47
6.1
47
93
1
468
31
12
29
25
1.93
123690530--123690814
93
3.1
93
92
2
457
31
12
29
25
1.93
123690530--123690814
140
2.0
139
91
2
464
31
12
29
25
1.93
123690699--123690772
23
3.1
25
62
25
59
29
13
33
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123690800--123690828
13
2.2
13
100
0
58
34
6
31
27
1.83
123693230--123693307
28
2.8
28
86
0
111
35
11
21
30
1.89
123693380--123693679
39
7.7
39
93
1
487
18
22
29
29
1.97
123693380--123693665
155
1.8
155
93
1
493
18
22
30
29
1.97
123696724--123696803
39
2.1
39
97
0
151
36
26
3
33
1.74
123703045--123703156
42
2.6
43
81
13
124
33
26
16
23
1.95
123709727--123709790
31
2.1
31
96
0
119
23
21
15
39
1.92
123709982--123710123
24
6.0
24
90
5
200
26
22
21
28
1.99
123709981--123710123
70
2.0
72
87
5
211
26
22
21
29
1.99
123710174--123710233
20
3.0
20
95
0
111
33
20
10
36
1.86
123710174--123710228
11
5.4
11
70
16
55
30
20
10
38
1.87
123710276--123710323
25
1.9
25
86
0
69
25
16
25
33
1.96
123717581--123717678
27
3.7
27
81
8
112
39
20
10
29
1.85
123717583--123717686
53
2.0
53
83
7
131
38
21
9
30
1.85
123717675--123717966
27
10.9
27
85
5
324
28
21
7
41
1.81
123717783--123718163
27
14.1
27
77
10
100
35
19
8
36
1.83
123717622--123717976
107
3.3
108
79
6
326
30
22
8
39
1.83
123717732--123718002
134
2.0
134
81
4
314
30
21
8
40
1.82
123717944--123718081
53
2.6
53
82
5
170
39
21
7
30
1.82
123718121--123718172
27
1.9
27
84
7
70
40
9
11
38
1.74
123718234--123718316
27
3.1
26
86
5
112
31
19
26
22
1.98
123719555--123719615
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123719665--123719807
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
123719665--123719807
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
123719665--123719808
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
123719999--123720093
31
3.1
31
95
0
172
40
15
22
22
1.91
123722820--123722920
27
3.7
28
80
9
111
38
20
9
30
1.85
123722820--123722925
54
2.0
53
81
9
126
37
20
9
32
1.85
123722915--123723206
27
10.9
27
84
4
333
27
21
8
42
1.81
123723076--123723404
27
12.1
27
76
9
114
36
19
8
35
1.83
123723184--123723323
54
2.6
54
85
4
192
38
22
8
30
1.84
123723184--123723351
54
3.1
52
80
8
151
38
22
8
29
1.85
123723362--123723412
27
1.9
27
84
11
70
41
9
11
37
1.75
123723466--123723557
27
3.4
27
84
3
114
33
18
26
21
1.96
123724794--123724854
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
123724904--123725046
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
123724904--123725046
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
123724904--123725047
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
123725237--123725330
31
3.1
31
95
3
172
39
15
22
22
1.92
123728055--123728155
27
3.7
28
80
9
111
38
20
9
30
1.85
123728055--123728161
54
2.0
54
81
7
128
38
20
9
31
1.84
123728057--123728173
54
2.2
53
79
10
121
38
21
10
29
1.86
123728150--123728442
27
10.9
27
85
4
333
27
21
8
41
1.81
123728312--123728640
27
12.1
27
76
9
114
36
19
8
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123728420--123728559
54
2.6
54
85
4
192
38
22
8
30
1.84
123728420--123728587
54
3.1
52
80
8
151
38
22
8
29
1.85
123728710--123728792
27
3.1
26
86
5
112
31
19
26
22
1.98
123730028--123730088
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
123730138--123730280
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99
123730138--123730280
47
3.0
47
90
5
207
28
22
22
26
1.99
123730138--123730281
71
2.0
72
89
4
220
29
22
22
26
1.99
123730472--123730565
31
3.1
31
95
3
172
39
15
22
22
1.92
123733284--123733339
27
2.0
27
83
10
69
39
16
8
35
1.80
123733293--123733393
27
3.7
27
77
13
91
38
19
9
31
1.85
123733388--123733680
27
10.9
27
86
4
342
27
21
8
41
1.82
123733604--123733878
27
10.1
27
77
8
110
37
19
9
33
1.83
123733658--123733797
54
2.6
54
85
4
192
38
22
8
30
1.84
123733658--123733825
54
3.1
52
80
8
151
38
22
8
29
1.85
123733939--123734030
27
3.4
27
84
3
114
33
18
26
21
1.96
123735265--123735325
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
123735375--123735516
24
6.0
24
88
5
191
28
21
22
27
1.99
123735375--123735517
70
2.0
72
86
5
202
29
20
22
27
1.99
123735707--123735802
31
3.1
31
93
1
165
40
15
21
21
1.91
123737422--123737891
27
17.6
27
82
10
513
28
21
8
41
1.83
123737403--123737918
237
2.1
242
81
8
619
29
21
9
39
1.84
123739212--123739272
20
3.0
20
92
0
104
34
11
21
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123739322--123739431
23
5.0
23
86
8
156
23
22
23
30
1.99
123739323--123739454
65
2.0
65
82
10
162
25
21
23
28
1.99
123739645--123739736
29
3.1
31
87
7
145
40
15
22
21
1.91
123741351--123741816
132
3.5
134
88
4
675
28
22
9
40
1.84
123741351--123741816
27
17.6
27
85
7
616
28
22
9
40
1.84
123741352--123741829
53
9.0
53
83
7
269
28
21
8
40
1.84
123743049--123743096
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
123743144--123743197
11
5.4
11
70
20
55
37
11
20
31
1.88
123743139--123743197
19
3.0
20
95
5
111
35
10
20
33
1.86
123743245--123743387
24
6.0
24
91
4
209
28
22
22
26
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770