Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr14 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  486  of  770  ( 92376 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
150176908--150177135
40
5.7
40
85
4
264
24
28
25
22
2.00
150179163--150179215
25
2.2
24
83
10
63
15
16
26
41
1.88
150184425--150184525
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
150184454--150184529
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
150192302--150192402
28
3.5
30
82
6
118
29
14
26
28
1.95
150192331--150192406
29
2.7
28
76
13
75
30
14
26
28
1.95
150196274--150196444
46
3.7
45
77
14
177
23
20
26
29
1.99
150196267--150196437
93
1.8
93
89
0
270
22
21
26
28
1.99
150202042--150202164
40
3.1
40
82
10
139
23
29
24
22
1.99
150205416--150205484
28
2.5
28
92
2
113
42
28
10
18
1.83
150215868--150216196
29
11.6
29
79
6
280
35
22
16
25
1.95
150215876--150216000
56
2.2
58
85
5
166
37
21
14
26
1.92
150215881--150216196
57
5.6
56
77
7
255
35
22
16
25
1.95
150233502--150233772
50
5.4
50
76
7
219
33
27
15
23
1.95
150233551--150233731
100
1.8
100
90
0
290
32
25
17
25
1.97
150233494--150233772
150
1.8
151
84
6
386
32
27
16
23
1.96
150237514--150237723
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
150245648--150245857
40
5.2
40
87
2
305
25
24
28
21
1.99
150248988--150249118
29
4.6
29
86
1
156
29
15
30
24
1.95
150248989--150249109
57
2.1
58
85
1
163
32
15
28
23
1.95
150255988--150256423
142
3.1
143
98
1
840
21
9
29
39
1.85
150256861--150256992
29
4.6
29
86
0
156
30
15
30
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
150263174--150263395
40
5.6
40
90
1
349
23
22
26
28
1.99
150266660--150266708
25
2.0
25
95
0
89
30
20
14
34
1.92
150267668--150267763
27
3.6
27
78
2
95
40
19
10
29
1.85
150271124--150271158
18
1.9
18
94
0
61
42
17
20
20
1.89
150271482--150271561
27
3.0
27
86
0
106
43
21
12
22
1.86
150278732--150278792
30
2.0
30
83
0
77
29
24
6
39
1.80
150280986--150281047
26
2.3
27
83
10
83
37
25
8
29
1.85
150281153--150281241
27
3.2
28
79
3
101
20
29
20
30
1.97
150288552--150288682
30
4.5
30
86
8
171
28
25
13
32
1.94
150288551--150288682
58
2.3
58
85
4
176
28
26
13
31
1.94
150296494--150296587
26
3.6
27
92
4
156
29
26
14
28
1.95
150298825--150298894
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
150298825--150298906
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
150306037--150306106
27
2.5
28
88
2
106
28
14
25
31
1.95
150306037--150306118
27
3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93
150318479--150318654
46
3.8
46
79
12
216
20
21
29
28
1.98
150318476--150318647
93
1.8
93
96
0
317
20
21
29
27
1.98
150323567--150323827
40
6.6
40
91
2
420
26
26
23
23
2.00
150342402--150342689
40
7.5
40
88
6
393
22
23
28
25
2.00
150350452--150350618
40
4.2
40
79
2
158
23
26
23
26
2.00
150358411--150358540
40
3.3
39
76
8
136
23
27
23
24
2.00
150358427--150358578
40
3.8
40
79
5
155
21
26
24
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
150358427--150358576
80
1.9
80
84
5
205
21
27
24
26
1.99
150363060--150363091
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
150363060--150363090
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
150363721--150363751
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
150363929--150363962
2
16.5
2
93
6
59
47
0
2
50
1.16
150364443--150364809
134
2.8
132
81
7
440
25
18
18
36
1.94
150372782--150372825
21
2.1
21
91
0
70
25
22
13
38
1.91
150376346--150376726
133
2.9
133
89
0
555
26
17
25
30
1.98
150378142--150378174
16
2.1
16
88
5
50
39
6
0
54
1.25
150379281--150379679
132
3.0
131
84
4
491
26
17
19
36
1.94
150383470--150383619
39
3.8
40
84
4
171
22
29
24
23
1.99
150385073--150385257
40
4.5
42
80
12
179
23
29
23
22
1.99
150393038--150393253
40
5.5
40
86
4
271
24
28
23
23
2.00
150393038--150393253
79
2.7
79
87
4
285
24
28
23
23
2.00
150395578--150395610
2
17.0
2
93
6
59
48
0
0
51
1.00
150395581--150395610
15
2.0
15
100
0
60
46
0
0
53
1.00
150400742--150400925
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
150400782--150400970
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
150408861--150409044
40
4.6
39
75
6
138
26
23
27
22
2.00
150408901--150409089
80
2.4
81
77
4
186
23
24
29
22
1.99
150414975--150415025
23
2.2
24
82
3
59
72
1
1
23
1.05
150415316--150415457
21
7.1
20
68
20
66
54
4
6
33
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
150415316--150415359
20
2.1
21
87
4
63
50
6
9
34
1.61
150415337--150415465
25
5.1
27
69
19
98
55
3
6
34
1.43
150415394--150415473
23
3.5
22
73
23
76
57
3
5
33
1.38
150415559--150415599
21
2.0
20
85
4
55
56
7
2
34
1.40
150415620--150415786
25
7.1
24
71
23
83
59
4
3
32
1.33
150415620--150415846
24
9.7
23
73
20
161
59
4
3
32
1.35
150415488--150415791
11
25.6
12
64
23
58
56
5
3
34
1.39
150415623--150415846
23
9.5
23
74
19
117
59
4
3
32
1.36
150415620--150415846
72
3.2
69
77
14
214
59
4
3
32
1.35
150415955--150416017
28
2.1
31
80
13
71
61
0
4
33
1.17
150418821--150418859
19
2.1
19
100
0
78
53
5
10
30
1.56
150429608--150429706
45
2.2
45
83
0
117
32
17
26
24
1.97
150429791--150429978
45
4.2
44
80
7
184
28
17
27
27
1.97
150429808--150429991
89
2.1
89
83
4
228
29
17
25
27
1.97
150431866--150431936
35
2.0
35
100
0
142
39
16
0
43
1.48
150433689--150433727
18
2.2
18
95
0
69
53
17
5
23
1.63
150435764--150435872
26
4.2
26
96
1
175
33
5
23
36
1.78
150437349--150437401
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
150437593--150437640
21
2.3
21
85
7
62
12
2
52
33
1.51
150437647--150437932
137
2.1
136
98
0
545
24
18
25
31
1.98
150441677--150441786
26
4.2
26
97
0
184
33
5
24
36
1.79
150443263--150443315
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
150446093--150446233
27
5.2
29
78
14
126
35
22
23
18
1.96
150446107--150446236
54
2.4
54
90
0
206
33
22
25
18
1.96
150478959--150478994
17
2.1
17
89
0
54
61
5
30
2
1.33
150500001--150500036
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
150501332--150501463
59
2.3
58
97
1
246
37
14
24
24
1.92
150501302--150501463
88
1.8
89
90
1
263
35
14
24
25
1.93
150501332--150501463
29
4.5
29
97
1
246
37
14
24
24
1.92
150507682--150507717
18
1.9
19
88
5
56
63
0
25
11
1.27
150509012--150509143
59
2.3
58
97
1
246
37
14
24
24
1.92
150508982--150509143
88
1.8
89
90
1
263
35
14
24
25
1.93
150509012--150509143
29
4.5
29
97
1
246
37
14
24
24
1.92
150511410--150511468
28
2.1
29
93
3
102
27
15
28
28
1.96
150511418--150511493
28
2.7
28
84
6
91
26
15
30
27
1.96
150513722--150513751
15
2.0
15
100
0
60
33
0
6
60
1.23
150518706--150518742
16
2.3
16
90
0
56
62
8
8
21
1.49
150526856--150526933
26
3.2
26
62
20
69
25
17
26
29
1.98
150526837--150527058
46
4.8
46
81
11
247
22
19
27
29
1.98
150529999--150530053
14
3.7
15
78
11
69
12
16
9
61
1.55
150529990--150530051
15
4.2
15
75
19
67
12
14
12
59
1.61
150532419--150532547
46
2.8
46
93
0
213
20
20
28
30
1.98
150533995--150534166
40
4.3
40
82
5
188
26
26
19
26
1.99
150540971--150541119
80
1.9
80
81
2
183
22
30
24
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
150541012--150541119
40
2.7
38
85
8
128
21
29
25
23
1.99
150550460--150550606
39
3.8
38
76
14
140
26
23
27
22
2.00
150558226--150558447
124
1.8
122
83
3
293
31
11
23
32
1.90
150558406--150558556
40
3.8
40
77
11
141
26
24
27
21
2.00
150558443--150558572
40
3.2
40
79
2
154
23
23
28
23
2.00
150558405--150558572
80
2.1
80
82
6
207
26
23
27
22
2.00
150560799--150560883
24
3.5
24
91
3
127
21
10
29
38
1.87
150563069--150563147
26
3.0
26
87
3
104
37
18
24
18
1.94
150563099--150563164
26
2.6
26
83
7
64
37
19
24
18
1.93
150563791--150564274
27
18.0
27
88
0
637
24
21
18
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770