genome.fa.s14.2.7.7.80.10.50.1000.684.html

Tandem Repeats Finder Program written by:

Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          769   770   

This is table  684  of  770  ( 92376 repeats found )

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Table Explanation

Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
215623579--215623826	40	6.2	40	91	1	374	22	21	29	26	1.99
215627378--215627475	40	2.5	39	88	1	142	26	21	27	24	1.99
215629221--215629404	38	4.9	39	90	7	274	25	21	31	21	1.98
215629220--215629404	77	2.5	73	90	5	282	24	21	31	21	1.98
215636735--215636847	39	2.9	39	89	3	167	23	22	31	22	1.98
215636820--215636880	24	2.3	27	83	16	74	19	18	36	26	1.94
215641757--215641816	27	2.2	27	84	0	75	33	23	10	33	1.88
215644448--215644582	43	3.1	44	83	6	184	24	17	29	28	1.97
215644465--215644582	45	2.7	43	84	6	166	26	17	28	27	1.98
215644879--215645087	38	5.5	38	90	1	285	20	20	25	33	1.97
215644852--215645087	76	3.1	76	86	3	298	21	21	25	31	1.98
215644852--215645087	114	2.1	114	85	3	314	21	21	25	31	1.98
215645080--215645206	44	2.9	45	87	3	179	21	24	29	25	1.99
215646012--215646098	27	3.2	27	91	0	138	27	20	9	42	1.82
215646076--215646350	27	10.2	27	79	6	209	40	22	7	29	1.82
215646076--215646432	54	6.6	53	73	5	230	39	21	8	30	1.83
215646076--215646348	81	3.4	80	82	6	282	40	22	7	29	1.81
215646361--215646412	27	1.9	27	88	7	79	38	13	13	34	1.84
215646465--215646550	26	3.3	26	90	4	120	36	20	24	18	1.95
215647356--215647543	26	7.3	26	86	2	249	28	20	22	28	1.99
215647356--215647543	52	3.7	52	92	3	303	28	20	22	28	1.99
215647676--215647767	42	2.2	42	88	3	132	30	14	20	34	1.92
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
215647791--215647873	30	2.7	31	85	3	107	32	16	22	27	1.96
215654968--215655130	39	4.2	39	91	0	263	22	20	33	23	1.97
215654968--215655161	39	4.9	39	89	0	253	22	21	32	23	1.98
215662863--215663025	39	4.2	39	91	0	263	22	20	33	23	1.97
215662863--215663056	39	4.9	39	89	0	253	22	21	32	23	1.98
215670786--215670948	39	4.2	39	91	0	263	22	20	33	23	1.97
215670786--215670978	39	4.9	39	89	1	253	22	21	32	23	1.98
215670803--215671016	78	2.7	78	84	5	218	23	22	31	22	1.99
215673536--215673849	49	6.7	45	74	12	167	28	19	28	24	1.98
215677327--215677841	27	19.1	27	84	4	617	27	21	9	41	1.85
215677327--215677837	108	4.7	109	89	1	685	27	21	9	41	1.84
215677846--215678041	27	7.3	27	86	0	257	35	19	19	25	1.96
215678240--215678322	27	3.1	26	87	5	112	20	22	20	36	1.95
215678632--215678698	27	2.5	27	85	4	82	22	25	17	34	1.96
215678822--215678923	6	16.8	6	75	17	95	19	15	14	50	1.79
215678822--215678923	30	3.4	30	87	6	152	19	15	14	50	1.79
215701999--215702099	28	3.5	30	82	6	118	29	14	26	28	1.95
215702028--215702103	29	2.7	28	76	13	75	30	14	26	28	1.95
215714474--215714537	31	2.1	31	96	0	119	23	21	15	39	1.92
215714728--215714892	70	2.3	70	89	6	253	27	21	22	28	1.99
215714729--215714892	23	7.0	24	91	5	239	27	21	22	28	1.99
215714939--215714993	11	5.5	11	71	20	57	32	20	10	36	1.87
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
215714939--215714998	20	3.0	20	95	4	113	35	20	10	35	1.86
215722529--215722646	31	3.5	35	89	9	135	22	23	16	37	1.94
215722552--215722646	31	3.1	31	98	0	181	23	22	15	38	1.92
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215886102--215886231	40	3.2	40	75	4	129	25	23	26	23	2.00
Indices	Period Size	Copy Number	Consensus Size	Percent Matches	Percent Indels	Score	A	C	G	T	Entropy (0-2)
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215905187--215905350	71	2.3	71	100	0	328	35	17	28	18	1.94
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215912735--215912852	41	3.1	41	60	28	98	32	17	28	21	1.96
215912703--215912866	71	2.3	71	100	0	328	35	17	28	18	1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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