Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr14
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  244914714

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770   

This is table  315  of  770  ( 92376 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96340538--96340669
29
4.6
29
89
0
165
30
15
30
24
1.95
96346020--96346181
40
4.1
40
93
1
256
23
20
27
28
1.99
96356237--96356287
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96357761--96358003
47
5.2
47
91
1
364
25
28
11
33
1.91
96357715--96358004
141
2.1
141
85
3
397
25
29
11
33
1.91
96357855--96357977
22
5.3
22
65
21
72
24
29
13
33
1.93
96362155--96362191
14
2.6
15
79
16
51
16
24
5
54
1.63
96362387--96362437
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96364498--96364548
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96366557--96366607
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96368790--96368841
25
2.0
26
85
10
72
25
15
23
36
1.93
96370320--96370403
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
96375189--96375231
12
3.6
12
93
0
77
13
48
25
11
1.77
96376869--96376921
26
2.0
27
85
7
74
24
15
22
37
1.92
96378403--96378486
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
96378482--96378506
10
2.5
10
100
0
50
32
12
8
48
1.69
96379713--96379763
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96381790--96381840
26
2.0
26
92
0
84
43
1
11
43
1.52
96383448--96383515
28
2.5
28
92
4
113
19
10
27
42
1.83
96385301--96385344
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
96387701--96387768
28
2.5
28
92
4
113
19
10
27
42
1.83
96391350--96391400
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96398243--96398293
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96400320--96400370
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96402404--96402454
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96404480--96404530
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96406559--96406609
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96408635--96408685
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96410715--96410765
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96411989--96412244
130
2.0
129
97
0
485
32
25
16
25
1.96
96412251--96412298
21
2.3
21
85
7
62
33
52
2
12
1.51
96414009--96414118
26
4.2
26
92
0
175
37
23
5
33
1.78
96416031--96416081
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96420909--96421021
27
4.2
27
83
7
124
38
23
22
16
1.93
96420913--96421019
54
2.0
54
85
3
144
38
22
21
17
1.93
96422632--96422715
26
3.2
26
94
0
141
35
23
4
35
1.76
96428928--96429042
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
96428928--96429042
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
96430663--96430746
26
3.2
26
91
0
123
34
23
7
34
1.82
96431202--96431252
26
2.0
26
88
7
77
45
1
11
41
1.52
96433948--96434116
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
96441729--96441897
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
96444368--96444418
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96446450--96446500
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96448325--96448361
14
2.6
15
79
16
51
16
24
5
54
1.63
96448558--96448608
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96450433--96450469
14
2.6
15
79
16
51
16
24
5
54
1.63
96450666--96450716
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96452637--96452687
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96454935--96455040
19
5.7
19
94
4
189
37
15
11
35
1.83
96454927--96455050
55
2.2
54
87
11
180
37
15
10
37
1.82
96454935--96455040
36
2.8
38
92
5
189
37
15
11
35
1.83
96456478--96456528
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96458564--96458614
26
2.0
26
92
7
86
47
1
11
39
1.52
96460646--96460694
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
96461512--96461676
40
4.2
40
79
8
160
24
21
27
25
1.99
96468625--96468673
17
2.8
18
74
22
50
24
18
22
34
1.96
96469495--96469661
40
4.2
40
79
6
169
25
21
27
25
1.99
96486887--96486911
13
1.9
13
100
0
50
40
24
0
36
1.55
96488460--96488518
27
2.2
26
82
14
68
32
8
15
44
1.76
96492876--96493027
43
3.5
43
80
1
162
26
17
26
28
1.98
96497666--96497706
22
1.9
21
85
5
55
56
0
0
43
0.99
96501426--96501545
7
17.0
7
73
10
66
38
38
0
22
1.60
96501534--96501587
21
2.5
23
74
14
62
46
25
1
25
1.63
96501460--96501597
21
6.6
21
68
12
52
42
33
1
23
1.63
96503302--96503374
36
2.0
36
97
0
137
23
23
13
39
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96504192--96504398
40
5.2
40
80
4
231
26
26
22
25
2.00
96504178--96504398
80
2.8
79
83
5
259
26
25
22
25
2.00
96512313--96512520
40
5.2
40
79
3
222
25
26
22
25
2.00
96518661--96518832
27
6.4
27
82
1
193
36
17
20
26
1.94
96523972--96524179
40
5.2
40
89
1
294
26
28
21
23
1.99
96527423--96527535
31
3.7
31
85
11
146
25
25
17
30
1.97
96527457--96527535
31
2.5
31
97
0
149
22
26
18
31
1.97
96527850--96527894
11
4.4
11
78
13
51
33
17
13
35
1.89
96527930--96527977
25
1.9
25
91
0
78
27
12
22
37
1.90
96531147--96531402
49
5.3
49
94
1
439
32
7
30
30
1.86
96533699--96533819
40
3.0
40
93
1
199
24
21
29
23
1.99
96537355--96537610
49
5.3
49
94
1
439
32
7
30
30
1.86
96540780--96540815
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
96541470--96541735
49
5.5
49
93
2
450
30
29
7
33
1.84
96543381--96543410
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
96543591--96543620
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
96545090--96545192
29
3.6
29
71
10
93
25
32
18
24
1.97
96545056--96545208
58
2.7
58
90
3
238
26
28
20
24
1.99
96545252--96545507
43
6.0
43
98
0
485
32
32
23
12
1.92
96545486--96545659
40
4.2
42
71
10
133
25
28
22
23
1.99
96546835--96546864
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
96547519--96547784
49
5.5
49
93
2
450
30
29
7
33
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96555794--96555913
42
2.8
43
76
7
120
28
21
19
30
1.97
96558011--96558229
39
5.6
40
83
11
274
26
26
22
25
2.00
96558011--96558229
79
2.8
80
86
8
281
26
26
22
25
2.00
96572102--96572573
48
9.9
48
94
1
822
35
6
27
30
1.82
96572714--96572804
37
2.5
37
98
0
173
23
20
31
24
1.98
96574099--96574384
40
7.2
40
93
0
414
23
19
28
28
1.98
96574444--96574545
29
3.6
29
80
7
118
22
15
31
30
1.95
96574412--96574600
57
3.3
57
83
5
215
22
16
29
31
1.96
96574416--96574570
28
5.5
28
76
7
134
21
17
29
32
1.96
96576603--96576628
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
96577734--96578205
48
9.9
48
94
1
822
35
6
27
30
1.82
96578346--96578436
37
2.5
37
98
0
173
23
20
31
24
1.98
96579730--96580014
40
7.2
40
92
1
405
23
19
28
28
1.98
96580074--96580175
29
3.6
29
80
7
118
22
15
31
30
1.95
96580042--96580230
57
3.3
57
83
5
215
22
16
29
31
1.96
96580046--96580200
28
5.5
28
76
7
134
21
17
29
32
1.96
96582233--96582272
2
20.0
2
100
0
80
50
0
0
50
1.00
96584051--96584115
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
96591984--96592048
29
2.2
29
97
0
121
29
16
27
26
1.97
96594477--96594948
48
9.9
48
95
0
829
34
6
27
30
1.82
96595089--96595191
37
2.8
37
93
0
170
24
19
31
25
1.98
96596474--96596759
40
7.2
40
93
0
423
23
19
28
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96596819--96596920
29
3.6
29
80
7
118
22
15
31
30
1.95
96596787--96596975
57
3.3
57
83
5
215
22
16
29
31
1.96
96596791--96596945
28
5.5
28
76
7
134
21
17
29
32
1.96
96598980--96599005
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
96600113--96600729
48
12.9
48
95
0
1072
35
6
27
30
1.82
96600870--96600972
37
2.8
37
89
0
152
25
21
28
25
1.99
96607896--96607925
6
5.0
6
91
0
51
50
20
13
16
1.78
96608717--96608754
15
2.6
15
83
4
51
0
21
0
78
0.74
96608832--96608885
16
3.4
17
72
12
51
40
3
0
55
1.17
96613899--96614000
40
2.6
41
89
6
156
24
25
23
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   439   440   441   442   443   444   445   446   447   448   
          449   450   451   452   453   454   455   456   457   458   459   460   461   462   463   464   
          465   466   467   468   469   470   471   472   473   474   475   476   477   478   479   480   
          481   482   483   484   485   486   487   488   489   490   491   492   493   494   495   496   
          497   498   499   500   501   502   503   504   505   506   507   508   509   510   511   512   
          513   514   515   516   517   518   519   520   521   522   523   524   525   526   527   528   
          529   530   531   532   533   534   535   536   537   538   539   540   541   542   543   544   
          545   546   547   548   549   550   551   552   553   554   555   556   557   558   559   560   
          561   562   563   564   565   566   567   568   569   570   571   572   573   574   575   576   
          577   578   579   580   581   582   583   584   585   586   587   588   589   590   591   592   
          593   594   595   596   597   598   599   600   601   602   603   604   605   606   607   608   
          609   610   611   612   613   614   615   616   617   618   619   620   621   622   623   624   
          625   626   627   628   629   630   631   632   633   634   635   636   637   638   639   640   
          641   642   643   644   645   646   647   648   649   650   651   652   653   654   655   656   
          657   658   659   660   661   662   663   664   665   666   667   668   669   670   671   672   
          673   674   675   676   677   678   679   680   681   682   683   684   685   686   687   688   
          689   690   691   692   693   694   695   696   697   698   699   700   701   702   703   704   
          705   706   707   708   709   710   711   712   713   714   715   716   717   718   719   720   
          721   722   723   724   725   726   727   728   729   730   731   732   733   734   735   736   
          737   738   739   740   741   742   743   744   745   746   747   748   749   750   751   752   
          753   754   755   756   757   758   759   760   761   762   763   764   765   766   767   768   
          769   770